Protein–RNA interactions for Protein: O15047

SETD1A, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,707 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1AO15047 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SETD1AO15047 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC27.53■■■□□ 2
SETD1AO15047 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SETD1AO15047 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC27.53■■■□□ 2
SETD1AO15047 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SETD1AO15047 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SETD1AO15047 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
SETD1AO15047 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SETD1AO15047 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SETD1AO15047 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SETD1AO15047 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SETD1AO15047 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SETD1AO15047 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SETD1AO15047 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SETD1AO15047 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SETD1AO15047 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
SETD1AO15047 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SETD1AO15047 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SETD1AO15047 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
SETD1AO15047 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SETD1AO15047 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SETD1AO15047 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SETD1AO15047 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SETD1AO15047 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SETD1AO15047 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SETD1AO15047 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SETD1AO15047 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
SETD1AO15047 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SETD1AO15047 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
SETD1AO15047 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SETD1AO15047 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SETD1AO15047 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SETD1AO15047 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SETD1AO15047 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SETD1AO15047 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SETD1AO15047 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SETD1AO15047 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SETD1AO15047 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SETD1AO15047 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SETD1AO15047 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SETD1AO15047 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SETD1AO15047 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SETD1AO15047 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SETD1AO15047 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SETD1AO15047 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SETD1AO15047 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SETD1AO15047 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SETD1AO15047 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SETD1AO15047 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SETD1AO15047 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SETD1AO15047 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SETD1AO15047 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SETD1AO15047 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SETD1AO15047 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SETD1AO15047 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SETD1AO15047 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SETD1AO15047 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SETD1AO15047 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SETD1AO15047 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SETD1AO15047 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
SETD1AO15047 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SETD1AO15047 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SETD1AO15047 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SETD1AO15047 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SETD1AO15047 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SETD1AO15047 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SETD1AO15047 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SETD1AO15047 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SETD1AO15047 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SETD1AO15047 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SETD1AO15047 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SETD1AO15047 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SETD1AO15047 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
SETD1AO15047 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SETD1AO15047 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SETD1AO15047 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SETD1AO15047 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SETD1AO15047 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SETD1AO15047 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SETD1AO15047 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SETD1AO15047 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SETD1AO15047 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
SETD1AO15047 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SETD1AO15047 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SETD1AO15047 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SETD1AO15047 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SETD1AO15047 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SETD1AO15047 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SETD1AO15047 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SETD1AO15047 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SETD1AO15047 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SETD1AO15047 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SETD1AO15047 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SETD1AO15047 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SETD1AO15047 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SETD1AO15047 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
SETD1AO15047 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SETD1AO15047 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SETD1AO15047 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SETD1AO15047 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms