Protein–RNA interactions for Protein: O14879

IFIT3, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFIT3O14879 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFIT3O14879 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFIT3O14879 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFIT3O14879 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFIT3O14879 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFIT3O14879 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFIT3O14879 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFIT3O14879 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFIT3O14879 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFIT3O14879 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFIT3O14879 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFIT3O14879 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFIT3O14879 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFIT3O14879 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFIT3O14879 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFIT3O14879 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFIT3O14879 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFIT3O14879 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFIT3O14879 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFIT3O14879 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFIT3O14879 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFIT3O14879 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFIT3O14879 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFIT3O14879 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFIT3O14879 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFIT3O14879 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFIT3O14879 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFIT3O14879 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFIT3O14879 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFIT3O14879 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFIT3O14879 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFIT3O14879 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFIT3O14879 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFIT3O14879 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFIT3O14879 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFIT3O14879 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFIT3O14879 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFIT3O14879 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFIT3O14879 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFIT3O14879 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFIT3O14879 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFIT3O14879 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFIT3O14879 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFIT3O14879 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFIT3O14879 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFIT3O14879 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFIT3O14879 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFIT3O14879 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFIT3O14879 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFIT3O14879 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFIT3O14879 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFIT3O14879 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFIT3O14879 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFIT3O14879 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFIT3O14879 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFIT3O14879 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
IFIT3O14879 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFIT3O14879 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFIT3O14879 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFIT3O14879 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFIT3O14879 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFIT3O14879 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
IFIT3O14879 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
IFIT3O14879 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IFIT3O14879 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
IFIT3O14879 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IFIT3O14879 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IFIT3O14879 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IFIT3O14879 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
IFIT3O14879 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IFIT3O14879 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IFIT3O14879 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IFIT3O14879 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IFIT3O14879 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFIT3O14879 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFIT3O14879 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFIT3O14879 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFIT3O14879 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFIT3O14879 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFIT3O14879 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFIT3O14879 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFIT3O14879 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFIT3O14879 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFIT3O14879 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFIT3O14879 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFIT3O14879 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFIT3O14879 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFIT3O14879 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFIT3O14879 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFIT3O14879 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFIT3O14879 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
IFIT3O14879 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFIT3O14879 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFIT3O14879 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFIT3O14879 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFIT3O14879 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFIT3O14879 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFIT3O14879 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFIT3O14879 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFIT3O14879 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms