Protein–RNA interactions for Protein: O14727

APAF1, Apoptotic protease-activating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APAF1O14727 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
APAF1O14727 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
APAF1O14727 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
APAF1O14727 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
APAF1O14727 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
APAF1O14727 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
APAF1O14727 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
APAF1O14727 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
APAF1O14727 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
APAF1O14727 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
APAF1O14727 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
APAF1O14727 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
APAF1O14727 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
APAF1O14727 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
APAF1O14727 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
APAF1O14727 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
APAF1O14727 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
APAF1O14727 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
APAF1O14727 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
APAF1O14727 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
APAF1O14727 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
APAF1O14727 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
APAF1O14727 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
APAF1O14727 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
APAF1O14727 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
APAF1O14727 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
APAF1O14727 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
APAF1O14727 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
APAF1O14727 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
APAF1O14727 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
APAF1O14727 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
APAF1O14727 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
APAF1O14727 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
APAF1O14727 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
APAF1O14727 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
APAF1O14727 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
APAF1O14727 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
APAF1O14727 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
APAF1O14727 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
APAF1O14727 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
APAF1O14727 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
APAF1O14727 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
APAF1O14727 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
APAF1O14727 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
APAF1O14727 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
APAF1O14727 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
APAF1O14727 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
APAF1O14727 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
APAF1O14727 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
APAF1O14727 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
APAF1O14727 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
APAF1O14727 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
APAF1O14727 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
APAF1O14727 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
APAF1O14727 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
APAF1O14727 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
APAF1O14727 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
APAF1O14727 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
APAF1O14727 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
APAF1O14727 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
APAF1O14727 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
APAF1O14727 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
APAF1O14727 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
APAF1O14727 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
APAF1O14727 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
APAF1O14727 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
APAF1O14727 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
APAF1O14727 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
APAF1O14727 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
APAF1O14727 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
APAF1O14727 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
APAF1O14727 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
APAF1O14727 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
APAF1O14727 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
APAF1O14727 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
APAF1O14727 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
APAF1O14727 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
APAF1O14727 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
APAF1O14727 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
APAF1O14727 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
APAF1O14727 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
APAF1O14727 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
APAF1O14727 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
APAF1O14727 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
APAF1O14727 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
APAF1O14727 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
APAF1O14727 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
APAF1O14727 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
APAF1O14727 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
APAF1O14727 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
APAF1O14727 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
APAF1O14727 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
APAF1O14727 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
APAF1O14727 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
APAF1O14727 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
APAF1O14727 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
APAF1O14727 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
APAF1O14727 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
APAF1O14727 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
APAF1O14727 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms