Protein–RNA interactions for Protein: O14503

BHLHE40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE40O14503 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BHLHE40O14503 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BHLHE40O14503 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BHLHE40O14503 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BHLHE40O14503 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BHLHE40O14503 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BHLHE40O14503 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BHLHE40O14503 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BHLHE40O14503 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BHLHE40O14503 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BHLHE40O14503 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BHLHE40O14503 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BHLHE40O14503 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BHLHE40O14503 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
BHLHE40O14503 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BHLHE40O14503 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BHLHE40O14503 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BHLHE40O14503 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BHLHE40O14503 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
BHLHE40O14503 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BHLHE40O14503 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BHLHE40O14503 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BHLHE40O14503 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BHLHE40O14503 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BHLHE40O14503 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BHLHE40O14503 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BHLHE40O14503 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BHLHE40O14503 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
BHLHE40O14503 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
BHLHE40O14503 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
BHLHE40O14503 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
BHLHE40O14503 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
BHLHE40O14503 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
BHLHE40O14503 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
BHLHE40O14503 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
BHLHE40O14503 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BHLHE40O14503 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BHLHE40O14503 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BHLHE40O14503 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BHLHE40O14503 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BHLHE40O14503 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BHLHE40O14503 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BHLHE40O14503 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
BHLHE40O14503 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BHLHE40O14503 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BHLHE40O14503 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BHLHE40O14503 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BHLHE40O14503 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BHLHE40O14503 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BHLHE40O14503 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BHLHE40O14503 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BHLHE40O14503 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BHLHE40O14503 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BHLHE40O14503 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BHLHE40O14503 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BHLHE40O14503 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BHLHE40O14503 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BHLHE40O14503 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
BHLHE40O14503 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BHLHE40O14503 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BHLHE40O14503 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BHLHE40O14503 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BHLHE40O14503 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BHLHE40O14503 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BHLHE40O14503 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BHLHE40O14503 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BHLHE40O14503 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BHLHE40O14503 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BHLHE40O14503 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BHLHE40O14503 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BHLHE40O14503 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BHLHE40O14503 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BHLHE40O14503 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BHLHE40O14503 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BHLHE40O14503 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BHLHE40O14503 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BHLHE40O14503 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BHLHE40O14503 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BHLHE40O14503 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BHLHE40O14503 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BHLHE40O14503 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BHLHE40O14503 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BHLHE40O14503 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BHLHE40O14503 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BHLHE40O14503 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BHLHE40O14503 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BHLHE40O14503 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BHLHE40O14503 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BHLHE40O14503 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BHLHE40O14503 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BHLHE40O14503 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BHLHE40O14503 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BHLHE40O14503 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BHLHE40O14503 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BHLHE40O14503 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
BHLHE40O14503 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BHLHE40O14503 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BHLHE40O14503 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BHLHE40O14503 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
BHLHE40O14503 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms