Protein–RNA interactions for Protein: M5A8F1

ERVH48-1, Suppressyn, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVH48-1M5A8F1 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVH48-1M5A8F1 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVH48-1M5A8F1 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVH48-1M5A8F1 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVH48-1M5A8F1 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVH48-1M5A8F1 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVH48-1M5A8F1 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVH48-1M5A8F1 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVH48-1M5A8F1 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVH48-1M5A8F1 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVH48-1M5A8F1 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVH48-1M5A8F1 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVH48-1M5A8F1 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVH48-1M5A8F1 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVH48-1M5A8F1 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVH48-1M5A8F1 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVH48-1M5A8F1 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVH48-1M5A8F1 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVH48-1M5A8F1 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVH48-1M5A8F1 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVH48-1M5A8F1 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVH48-1M5A8F1 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVH48-1M5A8F1 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVH48-1M5A8F1 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVH48-1M5A8F1 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVH48-1M5A8F1 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVH48-1M5A8F1 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVH48-1M5A8F1 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVH48-1M5A8F1 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVH48-1M5A8F1 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVH48-1M5A8F1 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVH48-1M5A8F1 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVH48-1M5A8F1 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVH48-1M5A8F1 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVH48-1M5A8F1 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVH48-1M5A8F1 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVH48-1M5A8F1 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVH48-1M5A8F1 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVH48-1M5A8F1 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVH48-1M5A8F1 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVH48-1M5A8F1 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVH48-1M5A8F1 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVH48-1M5A8F1 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVH48-1M5A8F1 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVH48-1M5A8F1 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVH48-1M5A8F1 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVH48-1M5A8F1 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVH48-1M5A8F1 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVH48-1M5A8F1 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVH48-1M5A8F1 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVH48-1M5A8F1 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVH48-1M5A8F1 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVH48-1M5A8F1 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVH48-1M5A8F1 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVH48-1M5A8F1 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVH48-1M5A8F1 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVH48-1M5A8F1 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVH48-1M5A8F1 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVH48-1M5A8F1 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVH48-1M5A8F1 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVH48-1M5A8F1 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVH48-1M5A8F1 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVH48-1M5A8F1 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVH48-1M5A8F1 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVH48-1M5A8F1 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVH48-1M5A8F1 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVH48-1M5A8F1 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVH48-1M5A8F1 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVH48-1M5A8F1 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVH48-1M5A8F1 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVH48-1M5A8F1 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVH48-1M5A8F1 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVH48-1M5A8F1 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVH48-1M5A8F1 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVH48-1M5A8F1 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVH48-1M5A8F1 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVH48-1M5A8F1 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVH48-1M5A8F1 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVH48-1M5A8F1 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVH48-1M5A8F1 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVH48-1M5A8F1 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVH48-1M5A8F1 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVH48-1M5A8F1 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVH48-1M5A8F1 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVH48-1M5A8F1 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVH48-1M5A8F1 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVH48-1M5A8F1 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVH48-1M5A8F1 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVH48-1M5A8F1 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVH48-1M5A8F1 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVH48-1M5A8F1 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVH48-1M5A8F1 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVH48-1M5A8F1 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVH48-1M5A8F1 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVH48-1M5A8F1 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVH48-1M5A8F1 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVH48-1M5A8F1 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVH48-1M5A8F1 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVH48-1M5A8F1 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVH48-1M5A8F1 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms