Protein–RNA interactions for Protein: F8W1W9

NPIPB9, Nuclear pore complex-interacting protein family member B9, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB9F8W1W9 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NPIPB9F8W1W9 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NPIPB9F8W1W9 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NPIPB9F8W1W9 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NPIPB9F8W1W9 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NPIPB9F8W1W9 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NPIPB9F8W1W9 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NPIPB9F8W1W9 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NPIPB9F8W1W9 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NPIPB9F8W1W9 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NPIPB9F8W1W9 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NPIPB9F8W1W9 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NPIPB9F8W1W9 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NPIPB9F8W1W9 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
NPIPB9F8W1W9 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NPIPB9F8W1W9 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NPIPB9F8W1W9 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NPIPB9F8W1W9 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NPIPB9F8W1W9 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NPIPB9F8W1W9 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NPIPB9F8W1W9 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NPIPB9F8W1W9 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NPIPB9F8W1W9 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NPIPB9F8W1W9 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NPIPB9F8W1W9 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
NPIPB9F8W1W9 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
NPIPB9F8W1W9 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
NPIPB9F8W1W9 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
NPIPB9F8W1W9 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
NPIPB9F8W1W9 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
NPIPB9F8W1W9 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
NPIPB9F8W1W9 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NPIPB9F8W1W9 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NPIPB9F8W1W9 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NPIPB9F8W1W9 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NPIPB9F8W1W9 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NPIPB9F8W1W9 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NPIPB9F8W1W9 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NPIPB9F8W1W9 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NPIPB9F8W1W9 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NPIPB9F8W1W9 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NPIPB9F8W1W9 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NPIPB9F8W1W9 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
NPIPB9F8W1W9 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NPIPB9F8W1W9 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NPIPB9F8W1W9 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NPIPB9F8W1W9 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NPIPB9F8W1W9 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NPIPB9F8W1W9 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NPIPB9F8W1W9 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NPIPB9F8W1W9 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NPIPB9F8W1W9 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NPIPB9F8W1W9 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NPIPB9F8W1W9 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NPIPB9F8W1W9 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NPIPB9F8W1W9 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NPIPB9F8W1W9 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NPIPB9F8W1W9 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NPIPB9F8W1W9 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NPIPB9F8W1W9 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NPIPB9F8W1W9 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NPIPB9F8W1W9 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NPIPB9F8W1W9 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NPIPB9F8W1W9 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NPIPB9F8W1W9 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NPIPB9F8W1W9 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NPIPB9F8W1W9 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NPIPB9F8W1W9 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NPIPB9F8W1W9 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NPIPB9F8W1W9 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NPIPB9F8W1W9 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NPIPB9F8W1W9 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NPIPB9F8W1W9 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NPIPB9F8W1W9 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NPIPB9F8W1W9 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NPIPB9F8W1W9 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NPIPB9F8W1W9 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NPIPB9F8W1W9 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NPIPB9F8W1W9 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NPIPB9F8W1W9 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NPIPB9F8W1W9 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NPIPB9F8W1W9 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NPIPB9F8W1W9 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NPIPB9F8W1W9 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NPIPB9F8W1W9 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NPIPB9F8W1W9 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NPIPB9F8W1W9 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NPIPB9F8W1W9 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NPIPB9F8W1W9 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
NPIPB9F8W1W9 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NPIPB9F8W1W9 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NPIPB9F8W1W9 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NPIPB9F8W1W9 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
NPIPB9F8W1W9 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NPIPB9F8W1W9 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NPIPB9F8W1W9 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NPIPB9F8W1W9 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NPIPB9F8W1W9 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
NPIPB9F8W1W9 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NPIPB9F8W1W9 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.3 ms