Protein–RNA interactions for Protein: B4DSR2

cDNA FLJ52234, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DSR2 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
B4DSR2 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
B4DSR2 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
B4DSR2 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
B4DSR2 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
B4DSR2 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
B4DSR2 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
B4DSR2 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
B4DSR2 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
B4DSR2 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
B4DSR2 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
B4DSR2 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
B4DSR2 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
B4DSR2 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
B4DSR2 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
B4DSR2 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
B4DSR2 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
B4DSR2 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
B4DSR2 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
B4DSR2 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
B4DSR2 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
B4DSR2 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
B4DSR2 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
B4DSR2 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
B4DSR2 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
B4DSR2 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
B4DSR2 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
B4DSR2 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
B4DSR2 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
B4DSR2 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
B4DSR2 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
B4DSR2 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
B4DSR2 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
B4DSR2 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
B4DSR2 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
B4DSR2 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
B4DSR2 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
B4DSR2 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
B4DSR2 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
B4DSR2 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
B4DSR2 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
B4DSR2 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
B4DSR2 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
B4DSR2 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
B4DSR2 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
B4DSR2 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
B4DSR2 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
B4DSR2 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
B4DSR2 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
B4DSR2 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
B4DSR2 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
B4DSR2 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
B4DSR2 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
B4DSR2 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
B4DSR2 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
B4DSR2 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
B4DSR2 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
B4DSR2 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
B4DSR2 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
B4DSR2 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
B4DSR2 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
B4DSR2 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
B4DSR2 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16■□□□□ 0.15
B4DSR2 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
B4DSR2 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC16■□□□□ 0.15
B4DSR2 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16■□□□□ 0.15
B4DSR2 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
B4DSR2 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
B4DSR2 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
B4DSR2 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
B4DSR2 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
B4DSR2 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
B4DSR2 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
B4DSR2 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
B4DSR2 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
B4DSR2 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
B4DSR2 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
B4DSR2 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
B4DSR2 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
B4DSR2 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
B4DSR2 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
B4DSR2 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
B4DSR2 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
B4DSR2 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
B4DSR2 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
B4DSR2 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
B4DSR2 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
B4DSR2 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
B4DSR2 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
B4DSR2 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
B4DSR2 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
B4DSR2 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
B4DSR2 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
B4DSR2 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
B4DSR2 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
B4DSR2 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
B4DSR2 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
B4DSR2 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
B4DSR2 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
B4DSR2 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms