Protein–RNA interactions for Protein: A6NL46

Putative UPF0607 protein ENSP00000332738, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NL46 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
A6NL46 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
A6NL46 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
A6NL46 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
A6NL46 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
A6NL46 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
A6NL46 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
A6NL46 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
A6NL46 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
A6NL46 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
A6NL46 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
A6NL46 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
A6NL46 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
A6NL46 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
A6NL46 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
A6NL46 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
A6NL46 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
A6NL46 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
A6NL46 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
A6NL46 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
A6NL46 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
A6NL46 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
A6NL46 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
A6NL46 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
A6NL46 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
A6NL46 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
A6NL46 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
A6NL46 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
A6NL46 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
A6NL46 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
A6NL46 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
A6NL46 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
A6NL46 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
A6NL46 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
A6NL46 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
A6NL46 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
A6NL46 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
A6NL46 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
A6NL46 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
A6NL46 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
A6NL46 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
A6NL46 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
A6NL46 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
A6NL46 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
A6NL46 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
A6NL46 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
A6NL46 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
A6NL46 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
A6NL46 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
A6NL46 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
A6NL46 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
A6NL46 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
A6NL46 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
A6NL46 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
A6NL46 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
A6NL46 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
A6NL46 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
A6NL46 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
A6NL46 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
A6NL46 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
A6NL46 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
A6NL46 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
A6NL46 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
A6NL46 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
A6NL46 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
A6NL46 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
A6NL46 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
A6NL46 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
A6NL46 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
A6NL46 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
A6NL46 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
A6NL46 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
A6NL46 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
A6NL46 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
A6NL46 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
A6NL46 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
A6NL46 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
A6NL46 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
A6NL46 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
A6NL46 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
A6NL46 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
A6NL46 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
A6NL46 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
A6NL46 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
A6NL46 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
A6NL46 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
A6NL46 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
A6NL46 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
A6NL46 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
A6NL46 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
A6NL46 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
A6NL46 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
A6NL46 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
A6NL46 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
A6NL46 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
A6NL46 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
A6NL46 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
A6NL46 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
A6NL46 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
A6NL46 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms