Protein–RNA interactions for Protein: A6NI47

POTEM, Putative POTE ankyrin domain family member M, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POTEMA6NI47 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POTEMA6NI47 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POTEMA6NI47 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POTEMA6NI47 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
POTEMA6NI47 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
POTEMA6NI47 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
POTEMA6NI47 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POTEMA6NI47 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
POTEMA6NI47 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
POTEMA6NI47 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
POTEMA6NI47 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POTEMA6NI47 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POTEMA6NI47 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POTEMA6NI47 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POTEMA6NI47 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POTEMA6NI47 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POTEMA6NI47 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POTEMA6NI47 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POTEMA6NI47 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POTEMA6NI47 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POTEMA6NI47 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POTEMA6NI47 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POTEMA6NI47 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POTEMA6NI47 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POTEMA6NI47 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
POTEMA6NI47 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POTEMA6NI47 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POTEMA6NI47 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POTEMA6NI47 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POTEMA6NI47 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POTEMA6NI47 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POTEMA6NI47 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POTEMA6NI47 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POTEMA6NI47 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POTEMA6NI47 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POTEMA6NI47 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POTEMA6NI47 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POTEMA6NI47 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POTEMA6NI47 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POTEMA6NI47 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POTEMA6NI47 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POTEMA6NI47 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POTEMA6NI47 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POTEMA6NI47 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POTEMA6NI47 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POTEMA6NI47 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POTEMA6NI47 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POTEMA6NI47 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POTEMA6NI47 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POTEMA6NI47 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POTEMA6NI47 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POTEMA6NI47 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POTEMA6NI47 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POTEMA6NI47 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POTEMA6NI47 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POTEMA6NI47 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POTEMA6NI47 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POTEMA6NI47 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
POTEMA6NI47 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
POTEMA6NI47 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
POTEMA6NI47 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
POTEMA6NI47 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
POTEMA6NI47 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
POTEMA6NI47 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
POTEMA6NI47 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
POTEMA6NI47 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
POTEMA6NI47 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
POTEMA6NI47 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
POTEMA6NI47 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
POTEMA6NI47 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
POTEMA6NI47 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
POTEMA6NI47 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
POTEMA6NI47 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
POTEMA6NI47 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
POTEMA6NI47 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
POTEMA6NI47 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
POTEMA6NI47 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
POTEMA6NI47 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
POTEMA6NI47 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
POTEMA6NI47 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
POTEMA6NI47 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
POTEMA6NI47 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
POTEMA6NI47 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
POTEMA6NI47 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
POTEMA6NI47 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
POTEMA6NI47 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
POTEMA6NI47 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
POTEMA6NI47 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
POTEMA6NI47 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
POTEMA6NI47 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
POTEMA6NI47 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
POTEMA6NI47 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
POTEMA6NI47 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
POTEMA6NI47 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
POTEMA6NI47 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
POTEMA6NI47 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
POTEMA6NI47 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
POTEMA6NI47 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
POTEMA6NI47 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
POTEMA6NI47 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms