Protein–RNA interactions for Protein: A6NFD8

HELT, Hairy and enhancer of split-related protein HELT, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELTA6NFD8 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HELTA6NFD8 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms