Protein–RNA interactions for Protein: A6NCW7

USP17L4, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L4A6NCW7 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP17L4A6NCW7 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP17L4A6NCW7 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP17L4A6NCW7 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP17L4A6NCW7 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP17L4A6NCW7 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP17L4A6NCW7 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP17L4A6NCW7 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP17L4A6NCW7 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP17L4A6NCW7 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP17L4A6NCW7 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP17L4A6NCW7 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP17L4A6NCW7 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
USP17L4A6NCW7 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
USP17L4A6NCW7 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP17L4A6NCW7 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP17L4A6NCW7 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP17L4A6NCW7 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP17L4A6NCW7 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP17L4A6NCW7 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP17L4A6NCW7 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP17L4A6NCW7 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP17L4A6NCW7 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP17L4A6NCW7 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP17L4A6NCW7 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP17L4A6NCW7 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
USP17L4A6NCW7 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP17L4A6NCW7 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
USP17L4A6NCW7 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP17L4A6NCW7 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP17L4A6NCW7 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP17L4A6NCW7 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP17L4A6NCW7 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP17L4A6NCW7 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP17L4A6NCW7 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP17L4A6NCW7 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP17L4A6NCW7 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP17L4A6NCW7 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP17L4A6NCW7 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP17L4A6NCW7 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP17L4A6NCW7 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP17L4A6NCW7 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP17L4A6NCW7 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP17L4A6NCW7 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP17L4A6NCW7 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP17L4A6NCW7 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP17L4A6NCW7 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP17L4A6NCW7 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP17L4A6NCW7 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP17L4A6NCW7 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP17L4A6NCW7 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP17L4A6NCW7 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP17L4A6NCW7 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP17L4A6NCW7 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP17L4A6NCW7 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP17L4A6NCW7 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP17L4A6NCW7 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP17L4A6NCW7 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP17L4A6NCW7 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP17L4A6NCW7 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP17L4A6NCW7 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP17L4A6NCW7 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP17L4A6NCW7 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP17L4A6NCW7 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
USP17L4A6NCW7 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP17L4A6NCW7 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP17L4A6NCW7 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP17L4A6NCW7 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP17L4A6NCW7 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP17L4A6NCW7 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP17L4A6NCW7 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP17L4A6NCW7 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP17L4A6NCW7 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
USP17L4A6NCW7 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
USP17L4A6NCW7 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP17L4A6NCW7 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP17L4A6NCW7 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP17L4A6NCW7 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP17L4A6NCW7 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP17L4A6NCW7 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP17L4A6NCW7 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP17L4A6NCW7 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP17L4A6NCW7 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP17L4A6NCW7 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP17L4A6NCW7 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP17L4A6NCW7 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP17L4A6NCW7 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP17L4A6NCW7 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP17L4A6NCW7 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP17L4A6NCW7 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
USP17L4A6NCW7 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP17L4A6NCW7 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP17L4A6NCW7 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP17L4A6NCW7 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP17L4A6NCW7 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP17L4A6NCW7 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP17L4A6NCW7 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP17L4A6NCW7 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP17L4A6NCW7 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP17L4A6NCW7 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms