Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 CDKL3-207ENST00000521755 586 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 LINC01269-201ENST00000553682 602 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 FAM27B-201ENST00000610601 213 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 AL049794.2-201ENST00000616301 365 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 FGF1-215ENST00000619447 3818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 CASC22-202ENST00000628396 802 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 CTNND1-221ENST00000529873 5931 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 CFHR3-206ENST00000617219 1462 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 KBTBD8-201ENST00000417314 4680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 OR52B5P-204ENST00000641744 3467 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 AC087667.1-201ENST00000500180 1422 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 GABRA1-215ENST00000636573 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 AC245407.1-201ENST00000621489 2538 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 DDX20-202ENST00000475700 4332 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 AC002064.2-201ENST00000420245 289 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 MTND4LP2-201ENST00000502312 285 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 EGFLAM-AS3-201ENST00000505267 549 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 NPM1P41-201ENST00000512920 831 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 BCAR4-204ENST00000573319 1273 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 LINC00993-204ENST00000606476 500 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 AC004836.1-201ENST00000623032 634 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 OR8J3-204ENST00000642058 3806 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 MCM9-209ENST00000619706 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 FREM1-202ENST00000380880 7324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 GSTCD-201ENST00000360505 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 FRYL-209ENST00000506685 1940 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 VNN3-203ENST00000392393 1603 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 NLRP8-201ENST00000291971 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 SMAD4-202ENST00000398417 8495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 KDM4C-214ENST00000536108 3406 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 ATOX1-203ENST00000521264 4341 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 MCM8-205ENST00000610722 7486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 ENPP2-208ENST00000522826 2667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 BIVM-ERCC5-201ENST00000602836 5143 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 KALRN-202ENST00000291478 10888 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 LINC00894-201ENST00000413076 403 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 CASP12-207ENST00000447913 819 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 LINC02293-202ENST00000548385 358 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 AC027130.1-201ENST00000564490 686 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 MIR5699-201ENST00000578903 90 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 AC053481.4-201ENST00000583164 216 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 VIPR1-AS1-223ENST00000627073 451 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 NOSTRIN-206ENST00000444448 2537 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 MYO3A-203ENST00000376302 2723 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 EIF4G3-201ENST00000264211 5802 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 IRAK1BP1-204ENST00000607739 1387 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 BMPR1B-202ENST00000394931 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 FTO-203ENST00000460382 1517 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 OR1A1-202ENST00000641322 3743 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 MTERF1-203ENST00000419292 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 DENND4A-201ENST00000431932 5875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 LINC02110-201ENST00000503870 546 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 AC010230.1-201ENST00000514115 443 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 RAD21-203ENST00000517749 1003 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 AC022360.1-201ENST00000521058 340 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 AC084757.4-201ENST00000616350 526 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 ATP13A4-203ENST00000392443 4016 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 AP001605.1-201ENST00000420186 2603 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 KAT6B-201ENST00000287239 8287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 B3GALT2-201ENST00000367434 3274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 C1orf21-201ENST00000235307 10265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 CSDE1-205ENST00000438362 4167 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 AC011933.1-201ENST00000413334 321 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 RPS17P17-201ENST00000419392 409 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 USP12-AS1-201ENST00000440657 268 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 AC116533.1-201ENST00000459748 321 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 RPS27L-205ENST00000462430 681 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 SSR3-206ENST00000476217 807 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 AC009142.1-202ENST00000562565 563 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 AC092134.1-201ENST00000563690 800 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 AC135050.5-201ENST00000576336 543 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 NPIPB9-201ENST00000357796 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 CLASP1-215ENST00000541377 7909 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 DSPP-201ENST00000282478 4281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 ZNF181-203ENST00000459757 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 MIPOL1-201ENST00000327441 7185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 RGPD3-202ENST00000409886 5594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 VN2R3P-201ENST00000422626 1412 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 AC007967.1-201ENST00000455422 1159 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 ANK3-207ENST00000460468 677 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 RPS7P7-201ENST00000463499 571 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 RPL17P2-201ENST00000491913 451 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 RN7SL558P-201ENST00000497468 299 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 AC010451.1-201ENST00000509057 556 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 LINC02390-201ENST00000541404 560 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 AC119044.1-202ENST00000548463 339 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 CEACAM7-204ENST00000602225 524 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 AL356608.1-201ENST00000610034 820 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 AL121772.2-201ENST00000614331 297 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 AL139254.3-201ENST00000641097 674 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 ZNF37BP-202ENST00000452075 8637 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 ATP1B4-202ENST00000361319 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 DLG2-203ENST00000376104 5139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 R3HCC1L-202ENST00000314594 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 AC015813.1-202ENST00000577267 4056 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 OR56A4-202ENST00000641156 3768 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 ALMS1-207ENST00000614410 11700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 MAPK10-304ENST00000641341 3984 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 FABP4-201ENST00000256104 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 GNG5P2-201ENST00000372054 207 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
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