Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 AC004817.1-201ENST00000553621 721 ntTSL 4 BASIC9.59□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 AL049779.2-201ENST00000553847 315 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 AP003774.2-201ENST00000569737 558 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 AC005410.2-201ENST00000580270 463 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 MIR5692C1-201ENST00000585309 91 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 AC024075.3-201ENST00000601687 453 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 AL590235.2-201ENST00000602641 632 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 C1orf195-202ENST00000625027 441 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 AC012557.3-201ENST00000626439 255 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 ADGRE3-201ENST00000253673 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 FPR3-201ENST00000339223 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 MCF2L2-203ENST00000447025 2394 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 C2CD3-202ENST00000334126 7960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 AC027097.2-201ENST00000588925 1976 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 NFIB-218ENST00000636432 1953 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 SPATA31D4-201ENST00000419782 4787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 RSL1D1-204ENST00000571133 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 CCDC15-201ENST00000344762 3893 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 RAD51AP1-201ENST00000228843 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 ZBTB43-201ENST00000373457 5695 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 ANKFN1-202ENST00000566473 3840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 SYNE1-217ENST00000466159 2610 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 NHSL2-208ENST00000639939 3402 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 INSR-202ENST00000341500 8954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 CABLES1-203ENST00000420687 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 MAPK10-312ENST00000641391 2488 ntAPPRIS P2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 MAPK10-378ENST00000642009 2463 ntAPPRIS P2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 SORBS2-209ENST00000418609 5529 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 SERBP1-203ENST00000370994 6676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 AC011453.1-201ENST00000597619 2239 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 MAPK10-228ENST00000512689 2583 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 AC008522.1-201ENST00000639479 2906 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 NDUFV3-201ENST00000340344 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 NYAP2-202ENST00000636099 5461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 RCAN1-208ENST00000482533 2686 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 AL031656.1-202ENST00000457704 1995 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 NXPH1-205ENST00000602349 1953 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 AC097714.1-201ENST00000511272 1647 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 OR1I1-201ENST00000209540 1242 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 RNU1-47P-201ENST00000362966 163 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 RNA5SP71-201ENST00000362967 126 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 PRR32-201ENST00000371125 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 CFAP61-207ENST00000389656 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 AC068286.1-201ENST00000416173 467 ntTSL 4 BASIC9.58□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 AC114760.1-201ENST00000420310 652 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 AC016912.1-201ENST00000432241 545 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 AC244505.2-201ENST00000435089 759 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 RPS26P40-201ENST00000435209 294 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 AC092431.2-201ENST00000441658 318 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 TBX18-AS1-202ENST00000441863 382 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 AC116533.1-201ENST00000459748 321 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 AC104472.2-201ENST00000469035 601 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 AC010368.1-201ENST00000510160 456 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 AC008574.1-201ENST00000514240 433 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 RN7SKP197-201ENST00000517077 297 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 AC011676.1-201ENST00000517658 397 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 HMGN1P28-201ENST00000521340 364 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 AP001107.4-201ENST00000533576 539 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 AC090023.2-201ENST00000540875 545 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 RAN-211ENST00000541679 572 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 AC004477.2-201ENST00000583349 192 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 RNASEH2B-AS1-202ENST00000593369 648 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 AC019080.3-201ENST00000606180 444 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 ST7-OT4_3.1-201ENST00000615542 293 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 PDZK1P1-203ENST00000616036 577 ntTSL 4 BASIC9.58□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 MIR6736-201ENST00000616799 59 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 CTNNA2-217ENST00000540488 2792 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 AC132825.3-201ENST00000562182 4710 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 NEDD4L-214ENST00000586263 3347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 SLC7A6-201ENST00000219343 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 SPATA6-202ENST00000371843 2297 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 ZNF778-207ENST00000620195 11031 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 NTRK3-221ENST00000629765 2714 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 TM2D2-203ENST00000456845 3295 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 TOR1AIP1-202ENST00000435319 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 AC008938.1-201ENST00000566929 6510 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 HMSD-201ENST00000408945 2101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 ZNF343-208ENST00000617391 3300 ntTSL 4 BASIC9.57□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 AC016205.1-201ENST00000591629 2306 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 ZNF546-207ENST00000600094 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 LNX1-201ENST00000263925 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 TTLL9-206ENST00000535842 3261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 CARF-201ENST00000320443 5209 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 FOXP1-220ENST00000614176 6384 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 AL049634.1-201ENST00000453770 1720 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 LINC01924-201ENST00000589376 1722 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 AL022323.3-201ENST00000623888 5388 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 PSEN1-205ENST00000406768 4062 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 ZNF35-202ENST00000396056 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 KIAA0930-202ENST00000336156 8119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 FHAD1-206ENST00000375998 4355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 NPIPB6-201ENST00000532254 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 ZHX3-214ENST00000559234 6296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 PRAC1-201ENST00000290294 386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.1 ms