Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 AC068672.3-203ENST00000505166 311 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CASQ1P31415 AC097173.1-201ENST00000505862 819 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CASQ1P31415 AC079226.2-201ENST00000509283 518 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CASQ1P31415 AC022509.3-201ENST00000535914 436 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CASQ1P31415 LINC01489-201ENST00000542689 605 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CASQ1P31415 AC121758.1-202ENST00000556917 658 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CASQ1P31415 Z99755.2-201ENST00000610215 364 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CASQ1P31415 GRIK2-204ENST00000369137 4272 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CASQ1P31415 PATL1-201ENST00000300146 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CASQ1P31415 SGIP1-204ENST00000371039 4080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CASQ1P31415 MTERF1-202ENST00000406735 1639 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CASQ1P31415 PLCB4-203ENST00000378493 5796 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CASQ1P31415 ARPP21-202ENST00000396481 1304 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CASQ1P31415 CNTN5-212ENST00000619298 5734 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CASQ1P31415 NUP107-202ENST00000378905 2859 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.53
CASQ1P31415 RNMT-209ENST00000592764 4108 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CASQ1P31415 ZRANB3-201ENST00000264159 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CASQ1P31415 LINC02261-201ENST00000512873 2802 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CASQ1P31415 SCN1A-220ENST00000641603 12506 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CASQ1P31415 OR51Q1-201ENST00000300778 1096 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CASQ1P31415 PLET1-201ENST00000338832 1215 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CASQ1P31415 MIR375-201ENST00000362103 64 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CASQ1P31415 OR6C1-201ENST00000379668 1064 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CASQ1P31415 MIR105-1-201ENST00000385222 81 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CASQ1P31415 RN7SKP86-201ENST00000410454 332 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CASQ1P31415 AC109779.1-201ENST00000414475 573 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CASQ1P31415 PPP2R2DP1-201ENST00000420526 637 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CASQ1P31415 RPS26P47-201ENST00000427219 348 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CASQ1P31415 ALG13-AS1-201ENST00000430794 195 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CASQ1P31415 AL356121.1-201ENST00000442911 156 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CASQ1P31415 AL035551.1-201ENST00000446931 348 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CASQ1P31415 EIF4A1P11-201ENST00000451239 222 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CASQ1P31415 LRRC37A14P-201ENST00000452297 462 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CASQ1P31415 SPRR2F-201ENST00000468739 681 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CASQ1P31415 AC108751.2-201ENST00000469993 231 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CASQ1P31415 HSD3BP3-201ENST00000514706 994 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CASQ1P31415 HAND2-AS1-235ENST00000515376 951 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CASQ1P31415 AZIN1-AS1-203ENST00000517996 756 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CASQ1P31415 CCND2-AS2-201ENST00000537370 495 ntTSL 4 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CASQ1P31415 AC079866.2-201ENST00000541870 515 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CASQ1P31415 MGAT4C-206ENST00000552435 550 ntTSL 4 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CASQ1P31415 ACYP1-204ENST00000555135 639 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CASQ1P31415 AC092121.1-201ENST00000569452 202 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CASQ1P31415 AP005119.2-201ENST00000579735 1105 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CASQ1P31415 TULP3P1-203ENST00000606237 586 ntTSL 4 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CASQ1P31415 AC097505.1-201ENST00000610199 565 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CASQ1P31415 AL163952.1-201ENST00000612704 916 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CASQ1P31415 AL023881.1-201ENST00000621088 301 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CASQ1P31415 OR10X1-201ENST00000623167 981 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CASQ1P31415 OR51Q1-202ENST00000641085 1096 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CASQ1P31415 EIF2AK2-201ENST00000233057 10042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CASQ1P31415 MYOZ2-201ENST00000307128 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CASQ1P31415 ADAM29-213ENST00000615367 3386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CASQ1P31415 USP44-201ENST00000258499 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CASQ1P31415 ROBO2-213ENST00000614793 7662 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CASQ1P31415 MRE11-202ENST00000323977 2588 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CASQ1P31415 AC011155.1-201ENST00000316512 456 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CASQ1P31415 OR5P2-201ENST00000329434 1069 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CASQ1P31415 IL6STP1-201ENST00000346911 1020 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CASQ1P31415 AC004057.1-202ENST00000356247 284 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CASQ1P31415 RN7SKP250-201ENST00000363924 321 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CASQ1P31415 RNA5SP90-201ENST00000364801 99 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CASQ1P31415 SNORA81-201ENST00000408493 178 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CASQ1P31415 AC105275.1-201ENST00000417794 491 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CASQ1P31415 EIF4A1P7-201ENST00000421800 1220 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CASQ1P31415 ARPP21-211ENST00000427542 568 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CASQ1P31415 AL031186.1-201ENST00000433125 385 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CASQ1P31415 RAB9AP5-201ENST00000437794 597 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CASQ1P31415 AMYP1-201ENST00000440059 1023 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CASQ1P31415 FHP1-201ENST00000442741 703 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CASQ1P31415 LINC01133-202ENST00000443364 1266 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
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CASQ1P31415 SEMA6A-AS1-202ENST00000508424 862 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CASQ1P31415 LINC02117-201ENST00000513673 540 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CASQ1P31415 PDE4D-225ENST00000515835 590 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CASQ1P31415 MTCYBP19-201ENST00000517463 1124 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CASQ1P31415 AC090572.2-201ENST00000520649 761 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CASQ1P31415 NPIPA8-202ENST00000541810 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CASQ1P31415 AC011595.3-201ENST00000546699 632 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CASQ1P31415 NPIPA3-203ENST00000552140 1053 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CASQ1P31415 NPIPA2-203ENST00000553201 1053 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CASQ1P31415 SMARCE1P3-201ENST00000553649 1231 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CASQ1P31415 AC015660.2-201ENST00000561362 323 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CASQ1P31415 AC116553.2-201ENST00000564203 463 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CASQ1P31415 MTND2P13-201ENST00000577438 1039 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CASQ1P31415 TTN-AS1-219ENST00000586707 834 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CASQ1P31415 AC011500.1-201ENST00000601963 469 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CASQ1P31415 MILR1-204ENST00000616498 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CASQ1P31415 AC132068.1-201ENST00000623805 459 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CASQ1P31415 ITGB1-201ENST00000302278 3640 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CASQ1P31415 TLK1P1-201ENST00000456760 2440 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CASQ1P31415 KCNH7-205ENST00000621889 1893 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CASQ1P31415 C2CD6-204ENST00000450242 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CASQ1P31415 ZNF571-202ENST00000358744 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CASQ1P31415 AC068446.1-201ENST00000556425 1549 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CASQ1P31415 PHACTR4-201ENST00000373836 3107 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CASQ1P31415 OR6K3-201ENST00000368145 1844 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CASQ1P31415 GTDC1-203ENST00000392867 2408 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CASQ1P31415 NRG1-220ENST00000539990 2401 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CASQ1P31415 LINS1-201ENST00000314742 4821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
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