Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 POLR1E-201ENST00000377792 2229 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 PNPLA6-220ENST00000600737 4195 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC35B4-201ENST00000378509 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM120C-202ENST00000375180 8057 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 COBLL1-202ENST00000375458 9367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 SYK-203ENST00000375751 4936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 PRKCE-201ENST00000306156 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 AC004846.1-201ENST00000554614 3050 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 TAB2-208ENST00000636456 3092 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 OR3A3-203ENST00000641141 3800 ntAPPRIS P1 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 PIK3CB-214ENST00000544716 3181 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 STRCP1-201ENST00000509801 5328 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 EYA1-201ENST00000303824 3930 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 GAB2-201ENST00000340149 6052 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 EIF4G1-207ENST00000411531 4683 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 TOX2-203ENST00000372999 2519 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 NEFM-204ENST00000518131 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 PMEL-218ENST00000552882 2516 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 AC113208.3-201ENST00000637356 2523 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 CDK14-206ENST00000436577 4787 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 TRPM4-201ENST00000252826 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 LINGO4-201ENST00000368820 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 ALDH4A1-202ENST00000375341 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 SON-203ENST00000381679 7860 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 SESN3-203ENST00000536441 9558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 PLAA-201ENST00000397292 4234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 BHLHE40-201ENST00000256495 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF3-203ENST00000303915 3473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 CACNA1C-212ENST00000399621 6568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 CACNA1C-215ENST00000399637 6568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 CACNA1C-221ENST00000402845 6568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 GRHL1-201ENST00000324907 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 MYH3-205ENST00000583535 6037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 TRPC5OS-201ENST00000371970 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 AL096816.1-201ENST00000623300 2920 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 ARHGAP45-203ENST00000543365 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 ETNK1-201ENST00000266517 7159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 UACA-211ENST00000560441 4723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 TEX10-204ENST00000535814 3006 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 ANO3-204ENST00000531568 3117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 EPS15-203ENST00000371733 5225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 DNAJC11-202ENST00000377577 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 BCAS1-202ENST00000395961 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 FBN3-201ENST00000270509 9232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF677-201ENST00000333952 3422 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 AC092123.2-201ENST00000611189 5421 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 DNM3-206ENST00000520906 4454 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 MAGED4B-201ENST00000335504 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 MYLK-204ENST00000360304 7738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 ABCB8-202ENST00000358849 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 POLE-201ENST00000320574 7840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 OR1C1-202ENST00000641256 3719 ntAPPRIS P1 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 DLG2-202ENST00000330014 2789 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF627-204ENST00000588174 2755 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 DDAH1-201ENST00000284031 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 HDLBP-214ENST00000427183 6238 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 CEMIP-203ENST00000394685 7357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 PDE2A-203ENST00000418754 2855 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 AL591543.1-202ENST00000642095 4149 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 TRIM22-201ENST00000379965 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 CTNNA2-202ENST00000361291 3071 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC8A1-203ENST00000403092 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM153B-201ENST00000253490 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 PAN2-201ENST00000257931 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 IQCA1-204ENST00000409907 3281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF304-203ENST00000443917 3391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 RAB27A-202ENST00000396307 3459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 IQSEC1-204ENST00000613206 3582 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 KCNMA1-291ENST00000640834 3664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 NCOA4-202ENST00000579039 2211 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF286B-205ENST00000545289 5328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 POU6F2-201ENST00000403058 2335 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 KIAA1524-206ENST00000491772 3877 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 AC015813.1-202ENST00000577267 4056 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF16-202ENST00000394909 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.1 ms