Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 AC134511.1-201ENST00000535721 192 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 AC091078.2-201ENST00000557145 559 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 RBM22P12-201ENST00000567098 1255 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 MIR4472-2-201ENST00000582069 67 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 AC090236.2-201ENST00000587933 1101 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 AC018809.2-201ENST00000602436 3823 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 AC011374.2-201ENST00000607135 526 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 AC245100.7-201ENST00000609678 442 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 LINC00836-203ENST00000628620 1179 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 CCDC195-201ENST00000638102 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 AC092329.4-204ENST00000639327 549 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 NKAIN2-204ENST00000545433 3052 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 ANK2-202ENST00000357077 14196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 LIMA1-212ENST00000552491 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 TET2-203ENST00000380013 9679 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 AC087257.1-201ENST00000506925 2639 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 AC144833.1-201ENST00000567953 4089 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 CDH18-210ENST00000511273 2318 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 USP28-213ENST00000544967 3498 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 RAP1GDS1-202ENST00000339360 2092 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 AL078621.3-201ENST00000623707 2042 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 IL15-204ENST00000477265 6026 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 CNTN5-201ENST00000279463 5925 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 MTERF1-201ENST00000351870 1997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 RRM1-201ENST00000300738 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 CLSPN-202ENST00000318121 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 TESPA1-203ENST00000524622 4188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 CCT8P1-201ENST00000413611 1657 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 SFT2D2-201ENST00000271375 11040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 MRRF-208ENST00000394315 1501 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 HSPA8P19-201ENST00000505359 1517 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 AC015813.1-203ENST00000585065 4722 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 RNU6-249P-201ENST00000363016 102 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 SPANXN1-201ENST00000370493 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 MIR142-201ENST00000384835 87 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 BCL11A-205ENST00000409351 756 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 RN7SKP29-201ENST00000410957 272 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 GPS2P1-201ENST00000411761 986 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 AL133482.1-201ENST00000415988 498 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 AC008173.1-201ENST00000418901 264 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 MTCO3P4-201ENST00000419236 787 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 RPS4XP16-201ENST00000427198 791 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 DEFA9P-201ENST00000433042 285 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 LINC00972-202ENST00000438065 788 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 AC006994.1-201ENST00000438212 839 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 ATP6V1E1P1-201ENST00000439215 681 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 MEOX2-AS1-201ENST00000442176 697 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 AC097499.1-201ENST00000444277 208 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 CASP12-207ENST00000447913 819 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 CASP12-208ENST00000448103 1071 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 OR7E116P-201ENST00000448529 957 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 AC079760.2-201ENST00000449361 681 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 AL355592.1-201ENST00000450292 386 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 CFL1P4-201ENST00000451536 498 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 AL021940.1-201ENST00000454271 677 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 AC004692.2-201ENST00000457315 355 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 EIF4A2P4-201ENST00000458691 1196 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 SNORD125-201ENST00000459538 96 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 HAX1-208ENST00000483970 1151 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 RPS7P6-201ENST00000485777 579 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 AC012629.1-201ENST00000503953 342 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 AC112206.2-204ENST00000504068 793 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 AC105919.1-201ENST00000507203 393 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 FGB-207ENST00000509493 1164 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 AC115622.1-201ENST00000509628 587 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 MOCS2-206ENST00000510818 1251 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 IGHVII-60-1-201ENST00000519079 256 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 LINC01339-203ENST00000519336 561 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 IGKV2-4-201ENST00000523070 340 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 AP003110.1-201ENST00000526976 717 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 GPRC5D-AS1-203ENST00000536029 466 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 AC007956.1-201ENST00000555623 542 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 AL357172.1-201ENST00000556016 593 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 GTSCR1-201ENST00000582578 470 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 MOCS2-210ENST00000584946 736 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 AP001542.3-201ENST00000587619 527 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 AL136131.3-201ENST00000607600 188 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 RMST_10.1-201ENST00000616309 154 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 MIR6778-201ENST00000617912 73 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 ZNF479-203ENST00000620639 1239 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 AC011815.3-201ENST00000624194 473 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 AC083865.1-201ENST00000636634 831 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 SAMMSON-209ENST00000641222 1100 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 VPS13D-213ENST00000613099 16245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 ZNF420-202ENST00000337995 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 AC027088.4-201ENST00000611559 1947 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 SEM1-202ENST00000356686 2667 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 OR10G7-202ENST00000641585 3449 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 LMNTD1-207ENST00000539744 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 HEMGN-202ENST00000616898 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 ATF2-201ENST00000264110 4176 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 DIAPH3-208ENST00000498416 2249 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 RPL7-204ENST00000396467 1526 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 A1CF-207ENST00000395495 9400 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 PTPRD-203ENST00000381196 9911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 KTN1-202ENST00000395308 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 ZNF215-205ENST00000529903 1396 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 ZFX-211ENST00000539115 6801 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 C11orf54-206ENST00000528099 1862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 GABRG2-217ENST00000639384 5360 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.7 ms