Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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ECM1Q16610 AC044840.1-201ENST00000577641 472 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
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ECM1Q16610 AC019257.2-201ENST00000605539 497 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 OSTC-205ENST00000613215 876 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 AC015819.1-201ENST00000613588 663 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 AC012676.3-201ENST00000614983 479 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
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ECM1Q16610 EXD1-202ENST00000458580 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 LAMB4-201ENST00000205386 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 HBS1L-212ENST00000527578 2618 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 NEXMIF-203ENST00000616200 10624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
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ECM1Q16610 ZNF215-205ENST00000529903 1396 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 SALL4P7-201ENST00000555779 3120 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 ARCN1-202ENST00000359415 4038 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 CUL1-204ENST00000617797 2508 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 ELMO2-203ENST00000372176 3678 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 EFCAB3-201ENST00000305286 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 RPL11P4-201ENST00000332269 436 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 PIH1D3-201ENST00000336387 993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 IGKV7-3-201ENST00000357453 298 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
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