Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 CLVS1-203ENST00000518592 2880 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 STARD9-201ENST00000290607 15567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 AC022164.1-201ENST00000568767 2673 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 AL590763.1-201ENST00000398297 1545 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 TCF7L2-206ENST00000355995 4073 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 ZNF486-201ENST00000335117 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 SPINK14-201ENST00000356972 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 RNU6-650P-201ENST00000365658 111 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 RNU6-452P-201ENST00000384406 107 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 RNU2-17P-201ENST00000410290 190 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 AC105402.1-201ENST00000413336 545 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 AL158827.1-201ENST00000416300 391 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 AC048351.1-201ENST00000420064 602 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 AL603910.1-201ENST00000423099 370 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 AL021153.1-201ENST00000427360 308 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 AC074011.1-201ENST00000431376 581 ntTSL 4 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 AL031599.1-201ENST00000432694 808 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 AL139002.1-201ENST00000435281 902 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 UBE2L5P-201ENST00000436446 465 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 RPL34P26-201ENST00000445636 354 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 AL591363.1-201ENST00000450091 483 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 AL022329.1-203ENST00000453811 451 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 AL122008.1-201ENST00000456078 452 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 SLC25A51P1-201ENST00000468432 871 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 OR2AO1P-201ENST00000476497 403 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 LINC02040-201ENST00000481004 556 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 AC122710.1-201ENST00000510622 553 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 SNORA26.10-201ENST00000516427 141 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 AC013701.1-201ENST00000522657 465 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 GPRC5D-AS1-205ENST00000540198 404 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 AL121594.2-201ENST00000541658 472 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 DCN-210ENST00000547568 823 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 SYNE2-210ENST00000553455 674 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 AL109741.3-201ENST00000561748 592 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 LINC02129-201ENST00000564381 692 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 AC090457.1-201ENST00000579775 211 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 AC005972.3-201ENST00000606304 481 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 AC112493.1-201ENST00000609836 303 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 EAF1-AS1-211ENST00000610011 316 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 FGF1-214ENST00000612258 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 MIR8080-201ENST00000622224 89 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 LINC01708-202ENST00000634316 859 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 DAOA-212ENST00000640578 378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 ASAH2-203ENST00000443575 1942 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 SEC31A-226ENST00000508479 3397 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 SLFN13-201ENST00000285013 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 SYCP2L-207ENST00000543878 2436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 OR9Q2-202ENST00000641291 3774 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 LINC02401-201ENST00000550185 3059 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 MYBPC1-207ENST00000545503 3569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 WASHC4-202ENST00000332180 5812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 SAMMSON-213ENST00000641336 1521 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 ENKUR-205ENST00000615958 3294 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 LIPF-203ENST00000394375 1470 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 TTC21B-201ENST00000243344 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 ZNF143-201ENST00000299606 2562 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 CLCA1-202ENST00000394711 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 NOL4-203ENST00000538587 1979 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 DLGAP5-202ENST00000395425 2954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 CCDC169-202ENST00000239860 716 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 GKN2-201ENST00000328895 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 SNORD1C-201ENST00000363315 78 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 RNA5-8SP5-201ENST00000365304 152 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 BPHL-201ENST00000380368 797 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 SNORA40.4-201ENST00000390971 128 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 AC233289.1-201ENST00000403700 508 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 AC017048.1-201ENST00000412153 495 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 TATDN1P1-201ENST00000414123 891 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 XKRYP4-201ENST00000414395 483 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 AC096711.3-201ENST00000420721 582 ntTSL 4 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 AL133173.1-201ENST00000423458 397 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 NANOGP4-201ENST00000427230 913 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 AL021408.1-201ENST00000430428 552 ntTSL 4 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 AL109807.1-201ENST00000438222 569 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 LINC01496-201ENST00000448761 460 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 AC036101.1-201ENST00000449272 597 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 XKRYP5-201ENST00000449659 483 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 AP000547.1-201ENST00000454360 617 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 AC009495.2-201ENST00000457108 506 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 RPL7P48-201ENST00000461513 746 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 AC087672.1-201ENST00000479876 766 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 NPM1P29-201ENST00000483112 803 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 AC004815.1-201ENST00000484185 331 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 MOSPD2-206ENST00000497603 775 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 LINC01088-208ENST00000511895 795 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 AC027338.1-201ENST00000514840 825 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 AC107391.1-201ENST00000514966 412 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 SNORA31.13-201ENST00000516624 135 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 NSMCE2-202ENST00000517315 996 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 AC069113.2-201ENST00000517735 359 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 RAD21-203ENST00000517749 1003 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 VTA1P2-201ENST00000520205 911 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 AC090424.1-201ENST00000535243 736 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 LINC02412-201ENST00000552584 1269 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 AC126615.2-201ENST00000553003 515 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 AC023906.4-201ENST00000557898 895 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 AC096996.1-201ENST00000563813 325 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 AC104365.1-202ENST00000587080 398 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 AC006115.2-201ENST00000596823 202 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 AC124856.1-201ENST00000600819 896 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
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