Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 NBPF12-203ENST00000611443 5594 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 AC000367.1-201ENST00000452711 1766 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 CUBNP3-201ENST00000457461 1784 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 AC010328.1-201ENST00000596769 4060 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 DEFB129-201ENST00000246105 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 RNU6-353P-201ENST00000364266 108 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 RN7SKP292-201ENST00000365522 317 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 FAM24A-201ENST00000368894 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 AL079342.2-201ENST00000403367 482 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 RNA5SP156-201ENST00000410250 110 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 RNA5SP178-201ENST00000410380 128 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 AC011754.1-201ENST00000415201 491 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 AC068535.1-201ENST00000416008 471 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 AL049765.1-201ENST00000416237 573 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 AL035604.1-201ENST00000416481 531 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 LINC01797-202ENST00000433432 765 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 LINC01291-203ENST00000435984 565 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 UBE2V1P8-201ENST00000437166 265 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 LINC01789-201ENST00000443123 860 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 AC022387.1-201ENST00000444770 794 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
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PTPRAP18433 AC005077.1-201ENST00000449226 375 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 RPL21P134-201ENST00000453468 483 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 VPS25P1-201ENST00000455691 508 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 OR13C1P-201ENST00000457612 963 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 RNU7-140P-201ENST00000459546 60 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 UBFD1P1-201ENST00000473259 814 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 AC109486.1-201ENST00000486833 374 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 AC034226.1-201ENST00000506429 487 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
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PTPRAP18433 HMGB3P13-201ENST00000511263 607 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 AC116347.2-201ENST00000514912 523 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 AC025881.1-201ENST00000518851 512 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 C14orf105-210ENST00000534126 1030 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 AC005832.1-201ENST00000544380 572 ntTSL 4 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 OLR1-210ENST00000544577 924 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 PSMA3-213ENST00000557508 814 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 AC009269.3-201ENST00000558429 472 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 CYP2C60P-201ENST00000566088 139 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 AC138811.1-201ENST00000569096 361 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 AC087301.1-201ENST00000579037 321 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 AC011476.3-202ENST00000586845 553 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
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PTPRAP18433 UBE2E3-208ENST00000602632 446 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
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PTPRAP18433 AC018714.1-201ENST00000605028 208 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
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PTPRAP18433 MAPK1IP1L-201ENST00000395468 6480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
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PTPRAP18433 OR4G11P-201ENST00000492842 939 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 RHOBTB3-204ENST00000504179 883 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 LINC02271-202ENST00000506379 596 ntTSL 4 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 STPG2-AS1-201ENST00000508933 537 ntTSL 4 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 GYPB-213ENST00000513128 360 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 OR5AZ1P-201ENST00000527448 943 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
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