Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 CKAP2-207ENST00000490903 3395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 RNF182-207ENST00000537663 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.17□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 GAS2L3-203ENST00000539410 2229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 PIK3C3-217ENST00000639914 2722 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 RAD51AP1-202ENST00000352618 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 IL1RAPL1-202ENST00000378993 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 ZNF836-204ENST00000597252 3209 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 CDH18-210ENST00000511273 2318 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 BANK1-203ENST00000444316 3141 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 ANXA1-202ENST00000376911 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 STXBP4-203ENST00000405898 2229 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 LRP6-201ENST00000261349 10020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 OR51Q1-201ENST00000300778 1096 ntAPPRIS P1 BASIC4.16□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 MGST1-205ENST00000396210 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 NUDT19P3-201ENST00000404698 555 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 MIR1271-201ENST00000408537 86 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 RN7SKP97-201ENST00000410966 333 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 AL513325.1-201ENST00000417716 1034 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 CASP5-203ENST00000418434 1023 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 AC023347.1-202ENST00000419223 440 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 AL606970.4-201ENST00000424343 455 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 AL591719.2-201ENST00000437400 386 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 LINC01035-201ENST00000445072 784 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 BBIP1-208ENST00000454061 812 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 AC092590.1-201ENST00000471672 737 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 OR2AO1P-201ENST00000476497 403 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 AC020779.1-201ENST00000478757 796 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 RPL5P22-201ENST00000480199 884 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 SETSIP-201ENST00000485873 879 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 RN7SL184P-201ENST00000488308 297 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 PLSCR5-203ENST00000492200 1058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 AL136038.1-201ENST00000497246 351 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 AC106732.1-201ENST00000512458 550 ntTSL 4 BASIC4.16□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 HMMR-AS1-202ENST00000521666 800 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 LINC02553-201ENST00000529088 734 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 AC126177.5-201ENST00000549599 178 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 DCTN5-207ENST00000568272 523 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 MYLK-221ENST00000583087 678 ntTSL 4 BASIC4.16□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 ZNF227-204ENST00000586228 569 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 UBA2-208ENST00000592791 910 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 AC108359.1-201ENST00000616451 1211 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 AL122125.1-201ENST00000616999 600 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 OR51Q1-202ENST00000641085 1096 ntAPPRIS P1 BASIC4.16□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 AC073869.10-201ENST00000642016 354 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 OR8A1-204ENST00000642111 1145 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 FNIP1-202ENST00000307968 6388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 STAU2-210ENST00000521210 1950 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 NUP205-201ENST00000285968 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 SPINK5-202ENST00000359874 3656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 MROH9-202ENST00000367759 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 CYP4Z2P-201ENST00000423332 1512 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 BCL2L14-213ENST00000589718 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 AC015813.6-201ENST00000624409 5808 ntBASIC4.15□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 LRRC19-201ENST00000380055 3609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 VNN2-201ENST00000326499 2118 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 CLSPN-203ENST00000373220 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 ANAPC10-201ENST00000309439 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 F9-202ENST00000394090 1272 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 RN7SKP59-201ENST00000410520 314 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 LINC02528-201ENST00000417800 381 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 AC016994.1-201ENST00000425419 552 ntTSL 4 BASIC4.15□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 AL139148.1-201ENST00000427122 680 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 RPS4XP16-201ENST00000427198 791 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 AC104843.2-201ENST00000427666 297 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 AL139002.1-201ENST00000435281 902 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 AL161630.1-201ENST00000450938 1299 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 GYG1P1-201ENST00000460864 698 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 HAX1-208ENST00000483970 1151 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 OR11I1P-201ENST00000486033 954 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 AC004889.1-208ENST00000489077 423 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 AC005412.2-201ENST00000492004 341 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 EGFLAM-AS3-201ENST00000505267 549 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 UGT2A3P7-201ENST00000510485 734 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 AC026719.2-201ENST00000515656 295 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 AC025524.2-206ENST00000517953 439 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 AC024940.3-201ENST00000538551 316 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 LINC02400-201ENST00000548210 351 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 NQO1-206ENST00000564043 892 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 AL390726.5-202ENST00000564800 256 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 AC007922.3-201ENST00000581648 543 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 LINC01125-220ENST00000599501 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 AC079395.2-201ENST00000610982 737 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 OR8G7P-201ENST00000616658 848 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 AC037198.3-201ENST00000616754 526 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 Metazoa_SRP.93-201ENST00000622525 276 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 AL023755.1-201ENST00000441851 1801 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 SOCS5-201ENST00000306503 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 LINC00704-201ENST00000430998 1478 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 PTK2-206ENST00000517712 3351 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 ZNF83-204ENST00000545872 2633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 PCDH11X-207ENST00000406881 4156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 PATJ-213ENST00000613764 4172 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 ZEB1-205ENST00000446923 6267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 ALS2CR12-202ENST00000392257 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 CDH17-201ENST00000027335 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 AC027279.1-201ENST00000568885 4284 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 ARHGEF38-202ENST00000420470 5454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 CFAP70-201ENST00000310715 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 FASTKD3-201ENST00000264669 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 ECM2-202ENST00000375540 1606 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
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