Protein–RNA interactions for Protein: Q12809

KCNH2, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH2Q12809 ZNF260-202ENST00000523638 5666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
KCNH2Q12809 ALG13-202ENST00000371979 2770 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
KCNH2Q12809 AP003066.1-201ENST00000527528 1647 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
KCNH2Q12809 AC009975.2-201ENST00000635306 1429 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
KCNH2Q12809 OR2T2-203ENST00000642130 3331 ntAPPRIS P1 BASIC7.84□□□□□ -1.15
KCNH2Q12809 PIK3R3-202ENST00000372006 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
KCNH2Q12809 AC006600.2-201ENST00000624834 2506 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
KCNH2Q12809 CTNNA2-218ENST00000541047 2870 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
KCNH2Q12809 NR1H4-206ENST00000548884 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
KCNH2Q12809 VCAN-202ENST00000342785 7154 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 AL450327.1-201ENST00000430931 2632 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 ZNF561-204ENST00000424629 4419 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 MAMDC2-AS1-202ENST00000414515 2097 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 SORBS1-207ENST00000371239 2436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 SREK1-203ENST00000380918 2433 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 BROX-209ENST00000612948 4028 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 SERPINB13-202ENST00000344731 3114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 ITPR1-202ENST00000354582 10242 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 MUC4-209ENST00000463781 17110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 OR5BR1P-201ENST00000524992 1330 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 CACNB4-270ENST00000638040 2026 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 CTAGE11P-201ENST00000451540 2353 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 ZSWIM5P3-201ENST00000511265 2743 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 UTP14C-201ENST00000521776 5529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 SLC7A6-216ENST00000618043 6124 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 GPRIN3-201ENST00000333209 6260 ntAPPRIS P1 BASIC7.83□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 AC104581.5-201ENST00000624171 7141 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 VPS13A-202ENST00000357409 9967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 KIF27-201ENST00000297814 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 OR4M1-201ENST00000315957 1116 ntAPPRIS P1 BASIC7.83□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 Y_RNA.166-201ENST00000363730 102 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 DEC1-201ENST00000374016 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 SNORA70.8-201ENST00000384231 136 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 ST7-204ENST00000393444 2113 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 AL603766.1-201ENST00000407763 664 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 RN7SKP232-201ENST00000410170 290 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 LINC01384-201ENST00000422494 659 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 AP001599.1-201ENST00000426771 361 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 BX890604.2-201ENST00000427883 474 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 AP001324.1-201ENST00000428553 399 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 AL365400.1-201ENST00000431854 640 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 LINC02384-202ENST00000441255 567 ntTSL 4 BASIC7.83□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 AC104306.1-201ENST00000449702 371 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 AL606490.1-201ENST00000452266 765 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 NDUFB3-204ENST00000454214 547 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 Z82190.1-201ENST00000454534 490 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 OR7E7P-201ENST00000455678 1012 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 AC093166.4-201ENST00000457867 318 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 TAAR3P-201ENST00000466706 1078 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 RN7SL228P-201ENST00000470060 303 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 RPL5P15-201ENST00000475870 897 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 TAAR3P-202ENST00000481759 1025 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 AC007182.2-201ENST00000489251 402 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 AC099520.1-202ENST00000503650 777 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 AC110792.2-201ENST00000510278 224 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 AP005902.2-201ENST00000518393 307 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 LINC01603-202ENST00000519557 712 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 AC105029.1-201ENST00000520250 669 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 IGHVIII-26-1-201ENST00000520387 250 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 CASC19-203ENST00000523510 575 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 AC021393.1-201ENST00000531077 433 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 AC243972.3-201ENST00000539655 198 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 LINC02423-202ENST00000542577 460 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 AC103996.3-201ENST00000553477 442 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 AC013489.1-201ENST00000561140 598 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 AC093515.1-201ENST00000567103 445 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 LINC01837-204ENST00000593211 570 ntTSL 4 BASIC7.83□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 AC063944.1-210ENST00000593837 519 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 AC243960.4-201ENST00000600532 288 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 AC008385.1-201ENST00000604421 355 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 AC011373.1-201ENST00000607270 237 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 AP003481.1-202ENST00000608214 503 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 AL603758.1-201ENST00000618654 241 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 EFCAB8-204ENST00000618684 435 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 PART1_3.1-201ENST00000619680 131 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 AC139792.3-201ENST00000623525 224 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 PTP4A2-219ENST00000626355 606 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 PTP4A2-220ENST00000627328 615 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 MMP10-201ENST00000279441 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 ZC3H14-215ENST00000555900 1762 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 FOXJ3-203ENST00000372571 4468 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 ADGRL3-206ENST00000507164 4982 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 ATM-201ENST00000278616 13147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 DNA2-203ENST00000399180 3207 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 TCP11X2-202ENST00000453326 1747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 TCP11X1-201ENST00000597070 1747 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 MED6-212ENST00000615788 1700 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 LINC02044-201ENST00000490139 2502 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 TRAF5-202ENST00000336184 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 ZNF37BP-203ENST00000452306 1352 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 CPB2-AS1-202ENST00000606243 2185 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 ZC3H11B-201ENST00000367211 2994 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 SYNPO2-202ENST00000429713 9920 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 FBXW7-201ENST00000263981 3743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 AC092111.1-201ENST00000618256 3358 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 RAPGEF6-208ENST00000509018 8357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 MPP7-201ENST00000337532 5080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 STN1-202ENST00000369764 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 AC066616.2-201ENST00000559334 1481 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
KCNH2Q12809 AC079178.2-201ENST00000439323 1624 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.7 ms