Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 SLC17A4-203ENST00000439485 3699 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CENPFP49454 CTNND1-234ENST00000532844 6012 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
CENPFP49454 GABPB2-202ENST00000368918 8964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
CENPFP49454 EED-203ENST00000351625 1696 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
CENPFP49454 RPS27AP16-201ENST00000492222 470 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CENPFP49454 AC027807.1-201ENST00000559921 996 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CENPFP49454 RPS4Y2-201ENST00000629237 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
CENPFP49454 OR52N4-202ENST00000641350 1276 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CENPFP49454 AC018557.1-201ENST00000569274 1790 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CENPFP49454 EFNA5-206ENST00000611503 4933 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CENPFP49454 AP1M1-201ENST00000291439 13193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
CENPFP49454 AL592148.3-201ENST00000608771 2646 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CENPFP49454 AC127164.1-201ENST00000548738 4196 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CENPFP49454 PLCH1-203ENST00000447496 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
CENPFP49454 ZNF410-211ENST00000555044 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
CENPFP49454 PCDH15-210ENST00000395438 5806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CENPFP49454 FCER1G-201ENST00000289902 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
CENPFP49454 AP003025.1-201ENST00000421650 149 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
CENPFP49454 FABP5P2-201ENST00000439042 408 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CENPFP49454 PRPF38AP1-201ENST00000451976 933 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CENPFP49454 RN7SL443P-201ENST00000464331 290 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CENPFP49454 RPL7L1P8-201ENST00000469911 741 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CENPFP49454 AC009803.1-202ENST00000551940 544 ntTSL 4 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CENPFP49454 LINC01028-202ENST00000588782 458 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CENPFP49454 NNT-201ENST00000264663 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
CENPFP49454 ETV1-201ENST00000242066 6348 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CENPFP49454 LRRC53-201ENST00000294635 3859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
CENPFP49454 AC012213.2-201ENST00000562917 4597 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
CENPFP49454 CTNND1-213ENST00000526357 5994 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
CENPFP49454 TMPRSS11BNL-202ENST00000510782 3202 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
CENPFP49454 SPRR2G-201ENST00000368748 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
CENPFP49454 LCP2-201ENST00000046794 4678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
CENPFP49454 SSR3-206ENST00000476217 807 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.55
CENPFP49454 RN7SL810P-201ENST00000493031 276 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
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CENPFP49454 AC127526.3-201ENST00000534291 450 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.55
CENPFP49454 AC010197.1-201ENST00000541860 578 ntTSL 4 BASIC5.4□□□□□ -1.55
CENPFP49454 RN7SL703P-201ENST00000578485 302 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
CENPFP49454 AC010618.3-202ENST00000598141 476 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.55
CENPFP49454 AC005261.4-201ENST00000600047 1385 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
CENPFP49454 ERCC6L-201ENST00000334463 4243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
CENPFP49454 SCAF11-205ENST00000465950 5296 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
CENPFP49454 RGPD3-202ENST00000409886 5594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
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CENPFP49454 ZNF790-201ENST00000356725 3037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CENPFP49454 R3HDM1-203ENST00000409606 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CENPFP49454 LINC01520-201ENST00000441457 1487 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
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CENPFP49454 LINC01468-201ENST00000422763 570 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CENPFP49454 AC239803.1-202ENST00000432038 590 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
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CENPFP49454 SEPT10P1-201ENST00000517342 1162 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
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CENPFP49454 ATP13A4-202ENST00000342695 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
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CENPFP49454 OR8J2-201ENST00000641465 2883 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CENPFP49454 SBNO1-201ENST00000267176 11121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CENPFP49454 CTAGE5-204ENST00000341749 2912 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CENPFP49454 CAST-222ENST00000508579 1758 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CENPFP49454 SELENOI-205ENST00000613142 8126 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CENPFP49454 RPS12P10-201ENST00000427031 377 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CENPFP49454 SNORD125-201ENST00000459538 96 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CENPFP49454 AC091959.2-201ENST00000477363 321 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CENPFP49454 RPS24P16-201ENST00000497294 392 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CENPFP49454 AL110505.1-201ENST00000557062 522 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CENPFP49454 NKIRAS1-209ENST00000614374 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CENPFP49454 NAIP-204ENST00000503719 5347 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CENPFP49454 MAX-203ENST00000341653 330 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CENPFP49454 OR1L6-202ENST00000373684 1044 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CENPFP49454 AC000124.1-201ENST00000448311 957 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CENPFP49454 AL512303.1-201ENST00000458693 465 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CENPFP49454 RN7SL189P-201ENST00000468631 289 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CENPFP49454 AC025884.1-201ENST00000556034 378 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CENPFP49454 CEP44-201ENST00000296519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CENPFP49454 PSG9-202ENST00000270077 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CENPFP49454 BRIP1-201ENST00000259008 6048 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CENPFP49454 FILIP1L-201ENST00000331335 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CENPFP49454 ENTPD1-AS1-202ENST00000416301 4241 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CENPFP49454 RASGEF1B-203ENST00000436139 6323 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CENPFP49454 CACNA1D-224ENST00000637424 6856 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CENPFP49454 UG0898H09-202ENST00000623646 7040 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CENPFP49454 FABP4-201ENST00000256104 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CENPFP49454 AL589765.1-201ENST00000457548 386 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CENPFP49454 AC107396.1-201ENST00000509641 735 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CENPFP49454 ZNF649-AS1-201ENST00000600329 579 ntTSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CENPFP49454 BNIP3P19-201ENST00000605397 577 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CENPFP49454 LRRC2-AS1-202ENST00000614743 633 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CENPFP49454 CTSS-201ENST00000368985 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CENPFP49454 GABRA3-201ENST00000370314 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CENPFP49454 CNOT1-216ENST00000569240 7660 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CENPFP49454 KDM4C-214ENST00000536108 3406 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CENPFP49454 LINS1-201ENST00000314742 4821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
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