Protein–RNA interactions for Protein: P29536

LMOD1, Leiomodin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD1P29536 SMC1A-201ENST00000322213 9784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
LMOD1P29536 AC022075.1-201ENST00000500682 2830 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
LMOD1P29536 SLC14A1-208ENST00000586142 2846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
LMOD1P29536 AF064860.2-201ENST00000457325 1542 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
LMOD1P29536 NEK11-207ENST00000508196 1938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
LMOD1P29536 TINAG-202ENST00000370864 692 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
LMOD1P29536 SNORD65.1-201ENST00000390889 71 ntBASIC8□□□□□ -1.13
LMOD1P29536 AC073626.1-201ENST00000415146 582 ntTSL 4 BASIC8□□□□□ -1.13
LMOD1P29536 MTCYBP38-201ENST00000417160 1123 ntBASIC8□□□□□ -1.13
LMOD1P29536 CD33-203ENST00000421133 1023 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
LMOD1P29536 GRK5-IT1-201ENST00000421206 400 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
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LMOD1P29536 AC069228.1-202ENST00000550272 737 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
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LMOD1P29536 RPL36A-209ENST00000553110 429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
LMOD1P29536 AL450442.1-201ENST00000554042 854 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
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LMOD1P29536 AC091117.2-201ENST00000560324 542 ntTSL 4 BASIC8□□□□□ -1.13
LMOD1P29536 APOOP5-203ENST00000565921 410 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
LMOD1P29536 AC055855.2-201ENST00000565993 500 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
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LMOD1P29536 ZSCAN12-202ENST00000396827 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
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LMOD1P29536 RN7SL177P-201ENST00000476596 299 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
LMOD1P29536 RPS4XP14-201ENST00000493072 781 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
LMOD1P29536 LINC02005-201ENST00000498832 782 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
LMOD1P29536 AC114954.1-201ENST00000506656 820 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
LMOD1P29536 RNA5SP418-201ENST00000515951 117 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
LMOD1P29536 EEF1B2P2-201ENST00000519625 676 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
LMOD1P29536 IQCJ-SCHIP1-205ENST00000527095 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
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LMOD1P29536 AL162632.2-201ENST00000553933 399 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
LMOD1P29536 SRP54-AS1-203ENST00000556355 603 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
LMOD1P29536 AC051619.2-201ENST00000559063 397 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
LMOD1P29536 AC234778.2-201ENST00000566241 354 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
LMOD1P29536 AC009303.2-201ENST00000585381 1083 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
LMOD1P29536 LINC01125-220ENST00000599501 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
LMOD1P29536 ZNF418-210ENST00000600989 597 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
LMOD1P29536 LINC00635-219ENST00000608506 482 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
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