Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0W8

SMG9, Protein SMG9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG9Q9H0W8 AC008536.2-201ENST00000607284 349 ntBASIC7□□□□□ -1.29
SMG9Q9H0W8 MIR7109-201ENST00000613748 65 ntBASIC7□□□□□ -1.29
SMG9Q9H0W8 AL158209.2-201ENST00000619266 216 ntBASIC7□□□□□ -1.29
SMG9Q9H0W8 Metazoa_SRP.129-201ENST00000619776 251 ntBASIC7□□□□□ -1.29
SMG9Q9H0W8 AL132796.3-201ENST00000624703 900 ntBASIC7□□□□□ -1.29
SMG9Q9H0W8 OR5T1-201ENST00000641368 1118 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
SMG9Q9H0W8 LINC00184-201ENST00000429269 2270 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
SMG9Q9H0W8 ATP1B4-203ENST00000539306 4644 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
SMG9Q9H0W8 EPS15P1-202ENST00000459691 2071 ntBASIC7□□□□□ -1.29
SMG9Q9H0W8 FBXW10-203ENST00000395665 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
SMG9Q9H0W8 AL590763.1-201ENST00000398297 1545 ntBASIC7□□□□□ -1.29
SMG9Q9H0W8 RANBP3L-204ENST00000515759 1532 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
SMG9Q9H0W8 TCF4-225ENST00000564999 3590 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
SMG9Q9H0W8 ZMAT1-206ENST00000540921 3139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
SMG9Q9H0W8 DPCR1-201ENST00000304311 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
SMG9Q9H0W8 CAP1P2-201ENST00000417455 1409 ntBASIC7□□□□□ -1.29
SMG9Q9H0W8 AMY1A-201ENST00000370083 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
SMG9Q9H0W8 LINC00652-201ENST00000412553 3299 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
SMG9Q9H0W8 AMOT-202ENST00000371958 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
SMG9Q9H0W8 KAT6A-201ENST00000265713 9153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
SMG9Q9H0W8 AC012618.3-201ENST00000415793 2042 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
SMG9Q9H0W8 AKR1C2-201ENST00000380753 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SMG9Q9H0W8 HBS1L-206ENST00000415177 2636 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SMG9Q9H0W8 SLC12A1-202ENST00000380993 4707 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SMG9Q9H0W8 CFI-205ENST00000512148 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SMG9Q9H0W8 FKBP5-202ENST00000536438 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SMG9Q9H0W8 SLA-201ENST00000338087 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SMG9Q9H0W8 OR10K2-202ENST00000641042 3023 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SMG9Q9H0W8 LIN28B-201ENST00000345080 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SMG9Q9H0W8 LMNTD1-207ENST00000539744 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SMG9Q9H0W8 CPSF6-202ENST00000435070 6616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SMG9Q9H0W8 RAPGEF4-214ENST00000538974 3920 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SMG9Q9H0W8 AL022068.1-201ENST00000636202 1875 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SMG9Q9H0W8 SLC41A2-201ENST00000258538 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SMG9Q9H0W8 OR2AP1-201ENST00000321688 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SMG9Q9H0W8 RNU1-65P-201ENST00000363919 148 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SMG9Q9H0W8 Y_RNA.263-201ENST00000364659 114 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SMG9Q9H0W8 LINC01620-202ENST00000372910 649 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SMG9Q9H0W8 AL359922.1-201ENST00000404796 935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
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SMG9Q9H0W8 AC009237.2-201ENST00000421358 284 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
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SMG9Q9H0W8 CCNB1IP1P1-201ENST00000428976 839 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
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SMG9Q9H0W8 AP000472.1-201ENST00000452500 530 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SMG9Q9H0W8 PHKA2-AS1-202ENST00000452900 656 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
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SMG9Q9H0W8 LINC01326-201ENST00000495159 755 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
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SMG9Q9H0W8 DCHS2-207ENST00000623607 8912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SMG9Q9H0W8 DUXAP8-203ENST00000437781 2398 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
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SMG9Q9H0W8 AC243772.3-201ENST00000617878 1537 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
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SMG9Q9H0W8 PRNCR1-201ENST00000635449 12727 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SMG9Q9H0W8 ZNF549-204ENST00000602149 5505 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SMG9Q9H0W8 SATL1-201ENST00000395409 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SMG9Q9H0W8 NAT1-206ENST00000518029 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SMG9Q9H0W8 VCAN-202ENST00000342785 7154 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SMG9Q9H0W8 AC117409.1-201ENST00000470499 1310 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SMG9Q9H0W8 KAT6B-203ENST00000372714 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SMG9Q9H0W8 LRRC37A4P-201ENST00000579913 3243 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SMG9Q9H0W8 BRD8-204ENST00000411594 2967 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SMG9Q9H0W8 ITGB1-201ENST00000302278 3640 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SMG9Q9H0W8 MED28-201ENST00000237380 10868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
SMG9Q9H0W8 SLC6A14-202ENST00000598581 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
SMG9Q9H0W8 MCTP2-201ENST00000357742 7555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
SMG9Q9H0W8 PPWD1-201ENST00000261308 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
SMG9Q9H0W8 PPWD1-214ENST00000535264 2195 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
SMG9Q9H0W8 SNORA70.3-201ENST00000365075 132 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
SMG9Q9H0W8 RNA5SP279-201ENST00000365513 117 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
SMG9Q9H0W8 SPANXN4-201ENST00000370504 560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
SMG9Q9H0W8 TRAV40-201ENST00000390467 317 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
SMG9Q9H0W8 SNORD65.1-201ENST00000390889 71 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
SMG9Q9H0W8 BCL2L15-203ENST00000393320 276 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
SMG9Q9H0W8 RPS3AP23-201ENST00000401762 784 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
SMG9Q9H0W8 SERHL2-204ENST00000407614 521 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
SMG9Q9H0W8 BTF3L4P3-201ENST00000418879 476 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
SMG9Q9H0W8 AL358394.1-201ENST00000422807 535 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
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