Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 AC111000.3-201ENST00000508057 576 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
TCOF1Q13428 AC026402.1-201ENST00000513642 170 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
TCOF1Q13428 AP002370.2-203ENST00000533101 576 ntTSL 4 BASIC7.58□□□□□ -1.2
TCOF1Q13428 LINC01489-201ENST00000542689 605 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
TCOF1Q13428 AC009396.1-201ENST00000553628 1079 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
TCOF1Q13428 AL031600.2-201ENST00000563223 307 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
TCOF1Q13428 AC116553.2-201ENST00000564203 463 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
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TCOF1Q13428 SMARCA2-206ENST00000382185 1584 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
TCOF1Q13428 DDX3Y-201ENST00000336079 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
TCOF1Q13428 OFD1P9Y-201ENST00000417699 1491 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
TCOF1Q13428 CNGA1-207ENST00000514170 2837 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
TCOF1Q13428 CASC19-260ENST00000641828 2001 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
TCOF1Q13428 RNF217-201ENST00000359704 1784 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
TCOF1Q13428 RNF217-202ENST00000368414 1771 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
TCOF1Q13428 IFNG-AS1-202ENST00000538665 1791 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
TCOF1Q13428 VPS13A-202ENST00000357409 9967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
TCOF1Q13428 GLYATL1-201ENST00000300079 2068 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TCOF1Q13428 PCDH15-215ENST00000409834 5401 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TCOF1Q13428 MECOM-203ENST00000460814 3374 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
TCOF1Q13428 WDR64-201ENST00000366552 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TCOF1Q13428 U3.30-201ENST00000391308 210 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
TCOF1Q13428 AC013472.2-201ENST00000416226 306 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TCOF1Q13428 AL450472.1-201ENST00000439434 405 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TCOF1Q13428 AL450023.3-201ENST00000440592 271 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
TCOF1Q13428 AL034380.1-201ENST00000448791 306 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TCOF1Q13428 OR52J1P-201ENST00000450596 932 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
TCOF1Q13428 HMGB1P4-201ENST00000455362 567 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
TCOF1Q13428 RNA5SP116-201ENST00000516132 98 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
TCOF1Q13428 RBPMS-207ENST00000519647 780 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TCOF1Q13428 AL139354.1-201ENST00000554319 645 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
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TCOF1Q13428 SMARCA2-231ENST00000634931 939 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TCOF1Q13428 PNPLA4-203ENST00000444736 2752 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TCOF1Q13428 AMOT-201ENST00000304758 6888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
TCOF1Q13428 PYHIN1-203ENST00000368140 2083 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
TCOF1Q13428 PSMA4-201ENST00000044462 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
TCOF1Q13428 IL13RA2-201ENST00000243213 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
TCOF1Q13428 FGF1-215ENST00000619447 3818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TCOF1Q13428 DNAJC16-202ENST00000375847 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
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TCOF1Q13428 ZFAND6-213ENST00000559835 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
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TCOF1Q13428 TRAV12-2-201ENST00000390437 445 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
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TCOF1Q13428 RORA-203ENST00000335670 10844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
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TCOF1Q13428 SNX24-202ENST00000395451 1050 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TCOF1Q13428 Z97832.1-201ENST00000402490 328 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
TCOF1Q13428 OTUD6B-202ENST00000404789 1089 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
TCOF1Q13428 RNA5SP345-201ENST00000410646 108 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
TCOF1Q13428 RSU1P3-201ENST00000412878 835 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
TCOF1Q13428 AC122718.1-201ENST00000439448 744 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
TCOF1Q13428 snoU13.1-201ENST00000459157 104 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
TCOF1Q13428 FAM133DP-201ENST00000464802 691 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
TCOF1Q13428 AC011005.3-201ENST00000491624 395 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
TCOF1Q13428 AC097460.1-204ENST00000515026 764 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TCOF1Q13428 ASPH-226ENST00000522919 1277 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TCOF1Q13428 SCARNA9-201ENST00000530422 353 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
TCOF1Q13428 AL512782.1-201ENST00000603093 364 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
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TCOF1Q13428 USP7-202ENST00000381886 3587 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
TCOF1Q13428 RASGRP1-209ENST00000559830 1910 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
TCOF1Q13428 NLN-202ENST00000502464 8354 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TCOF1Q13428 ECM1P2-201ENST00000503354 1577 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
TCOF1Q13428 PTPRD-205ENST00000397611 8242 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TCOF1Q13428 ITGB1-205ENST00000423113 3729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TCOF1Q13428 SMG1P3-204ENST00000520823 3194 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TCOF1Q13428 LAMTOR3-201ENST00000226522 1220 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TCOF1Q13428 RNA5SP191-201ENST00000362585 102 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
TCOF1Q13428 RN7SKP227-201ENST00000364445 330 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
TCOF1Q13428 SNORA57.1-201ENST00000391227 145 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
TCOF1Q13428 ELOCP19-201ENST00000411919 318 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
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