Protein–RNA interactions for Protein: Q12840

KIF5A, Kinesin heavy chain isoform 5A, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF5AQ12840 FTO-203ENST00000460382 1517 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
KIF5AQ12840 OBSCN-205ENST00000422127 24060 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
KIF5AQ12840 DTNA-202ENST00000283365 6522 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
KIF5AQ12840 PATL1-201ENST00000300146 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
KIF5AQ12840 RN7SKP28-201ENST00000364770 305 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
KIF5AQ12840 SNORA16A-201ENST00000384342 137 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
KIF5AQ12840 MT-RNR1-201ENST00000389680 954 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
KIF5AQ12840 GABARAPL3-201ENST00000412799 354 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
KIF5AQ12840 AC092687.1-201ENST00000418835 389 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
KIF5AQ12840 RPL17P35-201ENST00000432217 549 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
KIF5AQ12840 GSTM5P1-201ENST00000434751 660 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
KIF5AQ12840 AL590762.3-201ENST00000436372 640 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
KIF5AQ12840 LINC01350-201ENST00000436955 642 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
KIF5AQ12840 AC003685.1-201ENST00000440430 466 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
KIF5AQ12840 LINC01986-201ENST00000440867 590 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
KIF5AQ12840 AL731574.1-201ENST00000447757 456 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
KIF5AQ12840 AC018635.1-201ENST00000468292 1030 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
KIF5AQ12840 SPRR2F-201ENST00000468739 681 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
KIF5AQ12840 THOC7-AS1-201ENST00000468961 673 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
KIF5AQ12840 AC058823.1-201ENST00000485315 474 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
KIF5AQ12840 RPL37P23-201ENST00000492641 294 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
KIF5AQ12840 AP001960.1-201ENST00000506494 658 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
KIF5AQ12840 CCNHP1-201ENST00000513311 678 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
KIF5AQ12840 RN7SKP99-201ENST00000517028 307 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
KIF5AQ12840 AC011853.1-201ENST00000518911 454 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
KIF5AQ12840 PKIA-AS1-201ENST00000519242 995 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
KIF5AQ12840 AC246817.1-201ENST00000520024 610 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
KIF5AQ12840 GNG2-208ENST00000554875 430 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
KIF5AQ12840 AC018558.1-201ENST00000562591 459 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
KIF5AQ12840 AC093591.2-201ENST00000565254 3843 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
KIF5AQ12840 DPRXP4-201ENST00000578053 568 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
KIF5AQ12840 MIR3936-201ENST00000584304 110 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
KIF5AQ12840 AC073592.6-201ENST00000624271 415 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
KIF5AQ12840 IQCM-206ENST00000636793 1900 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
KIF5AQ12840 MYNN-203ENST00000544106 4815 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
KIF5AQ12840 MAP2-202ENST00000360351 9711 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
KIF5AQ12840 AP3B1-204ENST00000519295 3986 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
KIF5AQ12840 RASAL2-203ENST00000462775 14453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
KIF5AQ12840 NLRC4-203ENST00000402280 3355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
KIF5AQ12840 ZNF83-203ENST00000541777 3743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
KIF5AQ12840 CASC17-201ENST00000569074 2059 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
KIF5AQ12840 MATR3-228ENST00000620916 3134 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
KIF5AQ12840 MED23-203ENST00000368058 4576 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
KIF5AQ12840 AC106872.5-201ENST00000508856 1416 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
KIF5AQ12840 NBPF14-206ENST00000614999 10080 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
KIF5AQ12840 LTN1-202ENST00000389194 7749 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
KIF5AQ12840 RALGAPA1-204ENST00000553892 6271 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
KIF5AQ12840 PCGEM1-201ENST00000454040 1590 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
KIF5AQ12840 AC063976.2-201ENST00000425667 3556 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
KIF5AQ12840 SYT14-206ENST00000537238 5208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
KIF5AQ12840 GBA3-205ENST00000511446 2018 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
KIF5AQ12840 LCMT1-AS2-202ENST00000565214 5666 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
KIF5AQ12840 DEFB118-201ENST00000253381 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
KIF5AQ12840 RAD51AP1-202ENST00000352618 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
KIF5AQ12840 RCAN3-201ENST00000374393 382 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
KIF5AQ12840 IFNA8-201ENST00000380205 1039 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
KIF5AQ12840 HSPA8P15-201ENST00000401676 786 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
KIF5AQ12840 AL589994.1-201ENST00000404962 340 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
KIF5AQ12840 NPM1P40-201ENST00000412758 733 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
KIF5AQ12840 MARK2P12-201ENST00000420129 585 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
KIF5AQ12840 AL662874.1-201ENST00000426065 230 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
KIF5AQ12840 AL354896.1-201ENST00000430214 561 ntTSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
KIF5AQ12840 AL356421.2-201ENST00000446733 197 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
KIF5AQ12840 AC006482.1-201ENST00000448898 273 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
KIF5AQ12840 BX546450.1-201ENST00000454307 482 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
KIF5AQ12840 RN7SL189P-201ENST00000468631 289 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
KIF5AQ12840 RN7SL423P-201ENST00000486202 304 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
KIF5AQ12840 AC135457.1-201ENST00000503553 664 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
KIF5AQ12840 AC068672.3-203ENST00000505166 311 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
KIF5AQ12840 AC091860.2-201ENST00000509423 941 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
KIF5AQ12840 FGB-207ENST00000509493 1164 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
KIF5AQ12840 RN7SKP70-201ENST00000516655 271 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
KIF5AQ12840 NRBF2P4-201ENST00000520874 850 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
KIF5AQ12840 OR4R2P-201ENST00000530815 597 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
KIF5AQ12840 AL118556.1-201ENST00000555257 502 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
KIF5AQ12840 RN7SL708P-201ENST00000580952 299 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
KIF5AQ12840 MIR4472-2-201ENST00000582069 67 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
KIF5AQ12840 AC090227.1-201ENST00000590532 936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
KIF5AQ12840 GMFG-202ENST00000594700 397 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
KIF5AQ12840 AC098483.2-201ENST00000603158 454 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
KIF5AQ12840 AC005252.1-201ENST00000604518 1063 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
KIF5AQ12840 AL160400.1-201ENST00000606385 1030 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
KIF5AQ12840 AL163952.1-201ENST00000612704 916 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
KIF5AQ12840 BX005214.3-202ENST00000619809 325 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
KIF5AQ12840 AC023510.2-201ENST00000622162 746 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
KIF5AQ12840 AC129915.3-201ENST00000634128 948 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
KIF5AQ12840 AC073869.10-201ENST00000642016 354 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
KIF5AQ12840 ZC3H14-205ENST00000393514 2195 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
KIF5AQ12840 POU2F1-212ENST00000541643 13937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
KIF5AQ12840 SMARCA2-201ENST00000302401 2242 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
KIF5AQ12840 PSG7-206ENST00000623675 1392 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
KIF5AQ12840 ASAH2-204ENST00000447815 2311 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
KIF5AQ12840 MEG8-223ENST00000638012 3757 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
KIF5AQ12840 AP002518.1-201ENST00000534904 3837 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
KIF5AQ12840 VPS13D-214ENST00000620676 16320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
KIF5AQ12840 ZNF415-203ENST00000500065 2496 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
KIF5AQ12840 ADAM2-207ENST00000622267 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
KIF5AQ12840 EIF3H-209ENST00000521861 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
KIF5AQ12840 DNAAF4-CCPG1-201ENST00000565113 4589 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
KIF5AQ12840 HYKK-206ENST00000569878 4097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.6 ms