Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 AL035530.1-201ENST00000446887 331 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 AC090804.1-201ENST00000448870 490 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 PRPF38AP1-201ENST00000451976 933 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 MRE11P1-201ENST00000464884 2127 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 NDUFA5P5-201ENST00000468361 342 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 AC094085.1-201ENST00000468914 584 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 AC022795.1-201ENST00000473808 480 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 AC025181.1-201ENST00000477507 416 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 RNA5SP464-201ENST00000516251 108 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 AC022784.7-201ENST00000520017 651 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 AC078906.1-201ENST00000523602 798 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 AP001001.1-202ENST00000527594 692 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 AP002373.2-201ENST00000541631 1060 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 LINC00929-203ENST00000556213 713 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 LINC00687-203ENST00000558175 696 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 AC018767.2-201ENST00000562361 600 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 AC055855.2-201ENST00000565993 500 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 MTCYBP13-201ENST00000578634 1093 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 AC005726.4-201ENST00000582858 458 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 CDC42EP3P1-201ENST00000601004 764 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 uc_338.7-201ENST00000621834 124 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 AL139220.2-221ENST00000628123 395 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 OR8A1-204ENST00000642111 1145 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 ZNF92-203ENST00000431504 2947 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 DLG1-210ENST00000422288 2854 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 FAM19A2-215ENST00000551619 2718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 CDC27P2-201ENST00000425026 1922 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 CLIP1-AS1-201ENST00000535976 1745 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.56
CUL3Q13618 FTO-203ENST00000460382 1517 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL3Q13618 FAP-203ENST00000443424 2598 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL3Q13618 TRIM51GP-201ENST00000534741 1350 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL3Q13618 EPHA4-202ENST00000409854 3454 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL3Q13618 HMCN1-201ENST00000271588 18208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL3Q13618 SLC24A2-202ENST00000341998 10749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL3Q13618 PLSCR2-201ENST00000336685 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL3Q13618 SPRR2D-201ENST00000360379 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL3Q13618 LEMD1-203ENST00000367152 741 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL3Q13618 BMS1P3-201ENST00000372011 932 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL3Q13618 IL6-203ENST00000401651 539 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL3Q13618 LYPLA1P3-201ENST00000402650 695 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL3Q13618 RPL10P10-201ENST00000403509 664 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL3Q13618 AL589655.1-201ENST00000405398 482 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL3Q13618 RMRPP5-201ENST00000411156 267 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL3Q13618 AC079630.1-201ENST00000412812 585 ntTSL 4 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL3Q13618 LINC01203-201ENST00000419566 580 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL3Q13618 AC093155.2-201ENST00000420734 937 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL3Q13618 AL513188.1-201ENST00000421167 614 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL3Q13618 PRUNEP1-201ENST00000425846 705 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL3Q13618 AL022310.1-201ENST00000436974 690 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL3Q13618 AL139161.2-201ENST00000438371 740 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL3Q13618 LINC02038-201ENST00000439074 702 ntTSL 4 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL3Q13618 CD200R1L-202ENST00000448932 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL3Q13618 AC107072.1-201ENST00000449007 110 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL3Q13618 HGF-207ENST00000453018 721 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL3Q13618 AC011225.1-201ENST00000457751 369 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL3Q13618 AL591473.1-201ENST00000464297 313 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL3Q13618 SELENOT-204ENST00000480740 783 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL3Q13618 LINC00483-204ENST00000502517 940 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL3Q13618 LINC01339-201ENST00000505712 440 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL3Q13618 AC016559.2-201ENST00000510759 359 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL3Q13618 SPRY4-AS1-205ENST00000514303 152 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL3Q13618 CYCSP22-201ENST00000517555 339 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL3Q13618 AC013549.2-201ENST00000526953 489 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL3Q13618 AP003168.1-201ENST00000530091 307 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL3Q13618 AP001804.2-201ENST00000533932 910 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL3Q13618 AC008147.3-201ENST00000548666 354 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL3Q13618 OR4C13-201ENST00000555099 1029 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL3Q13618 AC040958.1-201ENST00000561102 201 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL3Q13618 AC025278.1-201ENST00000593558 515 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL3Q13618 AC025574.2-201ENST00000615621 514 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL3Q13618 AP005431.1-201ENST00000618479 319 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL3Q13618 NRXN1-223ENST00000625891 1164 ntTSL 4 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL3Q13618 AD000090.1-201ENST00000638356 494 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL3Q13618 AL596275.2-204ENST00000641628 552 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL3Q13618 MIR193BHG-214ENST00000641765 509 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL3Q13618 AL596275.2-206ENST00000641957 626 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL3Q13618 RNF217-201ENST00000359704 1784 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL3Q13618 TTC39DP-201ENST00000416781 1688 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL3Q13618 CDC42SE2-201ENST00000360515 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL3Q13618 AIG1-208ENST00000494282 3393 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL3Q13618 FGD4-210ENST00000525053 2925 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL3Q13618 IFIT1B-201ENST00000371809 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL3Q13618 OR2J3-202ENST00000641151 3297 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL3Q13618 ARHGAP24-201ENST00000264343 4572 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL3Q13618 TET2-202ENST00000305737 9233 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL3Q13618 SRRM1P3-201ENST00000426911 2678 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CUL3Q13618 FOXN2-203ENST00000616844 1414 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CUL3Q13618 OR2H1-203ENST00000377136 3024 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CUL3Q13618 FAM196B-201ENST00000377365 2999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CUL3Q13618 AC100778.3-201ENST00000580060 1750 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CUL3Q13618 AC007996.1-201ENST00000620414 2821 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CUL3Q13618 RPL39P5-201ENST00000273411 449 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
CUL3Q13618 AC017079.1-201ENST00000333650 415 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CUL3Q13618 RPL12P9-201ENST00000412942 488 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CUL3Q13618 COX5BP7-201ENST00000414780 274 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CUL3Q13618 AC013472.2-201ENST00000416226 306 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CUL3Q13618 AF064860.1-201ENST00000416555 544 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CUL3Q13618 RPL34P3-201ENST00000421454 338 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CUL3Q13618 AL445528.1-201ENST00000426330 420 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CUL3Q13618 MTCO1P45-201ENST00000431457 267 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.6 ms