Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 TCF7L2-221ENST00000545257 2160 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 EIF3F-208ENST00000533626 7540 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 PIGR-201ENST00000356495 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 LINC00939-202ENST00000507313 2819 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 ARID5B-202ENST00000309334 3141 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 RAD9B-203ENST00000409246 2794 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 AMPD3-208ENST00000528723 2753 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 DTNA-203ENST00000315456 1706 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 CYP4A11-203ENST00000371905 1725 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 FNDC3B-201ENST00000336824 7904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 EEF1A1P10-201ENST00000475365 1390 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 TDP1-201ENST00000335725 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 USP17L21-202ENST00000621388 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 CTNND1-213ENST00000526357 5994 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 AC005863.1-201ENST00000379640 2998 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 EPB41-204ENST00000356093 5857 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 CBFA2T2-203ENST00000346541 7737 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 OR2M4-201ENST00000306687 936 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 AL137784.1-201ENST00000407121 745 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 RN7SKP110-201ENST00000410146 285 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 AC096664.2-201ENST00000411843 406 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 VN2R10P-201ENST00000411871 853 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 AL591896.1-201ENST00000420211 491 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 CFL1P7-201ENST00000424759 486 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 GAPDHP32-201ENST00000433816 998 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 AC010881.1-201ENST00000433830 235 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 AC009229.1-201ENST00000450854 622 ntTSL 4 BASIC9.65□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 AL133351.3-201ENST00000454998 193 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 HNRNPCP7-201ENST00000456056 905 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 AC011476.1-201ENST00000466725 307 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 AC087879.1-201ENST00000474343 374 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 AC080188.1-201ENST00000491923 567 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 RPL19P11-201ENST00000495944 589 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 SNORA31.6-201ENST00000516241 130 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 AC011853.1-201ENST00000518911 454 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 AC112191.2-201ENST00000522428 333 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 AP000442.2-201ENST00000531108 440 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 TMEM106C-212ENST00000549288 321 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 AC023510.1-201ENST00000555862 490 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 AC022196.1-202ENST00000559570 462 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 AL023284.4-201ENST00000564248 374 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 AC060771.1-201ENST00000582031 164 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 AC245517.5-201ENST00000611529 162 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 CCL14-202ENST00000618404 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 ZNF80-203ENST00000619534 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 FOXN3-202ENST00000345097 7832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 CEP128-209ENST00000555265 4662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 CAGE1-202ENST00000338150 2771 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 DST-207ENST00000421834 18030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 FER-202ENST00000438717 1531 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 SLFN12-201ENST00000304905 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 NBPF19-204ENST00000611931 2051 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 NBPF26-205ENST00000615219 2051 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 NBPF12-207ENST00000617864 2051 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 NBPF20-204ENST00000620821 2051 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 LINC01260-201ENST00000415889 1416 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 KYNUP1-201ENST00000466683 1406 ntBASIC9.65□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 SOCS4-202ENST00000395472 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 R3HDM2P1-201ENST00000505381 1960 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 IL5RA-209ENST00000446632 2514 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 BACH2-201ENST00000257749 9113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 PTK2-203ENST00000430260 1940 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 BCL2L14-211ENST00000586576 1927 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 CEP68-205ENST00000537589 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 MATN2-208ENST00000520016 3495 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 NAV1-202ENST00000367296 13091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 AL122126.1-201ENST00000546905 1318 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 SLC16A4-203ENST00000437429 2372 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 DNAJC5G-204ENST00000406962 1562 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 RNMT-203ENST00000543302 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 RNF138-201ENST00000257190 2071 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 ABHD3-205ENST00000578270 2080 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 MARK3-203ENST00000335102 2331 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 CAST-213ENST00000504465 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 ZBTB14-207ENST00000614697 3341 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 SNORD62.1-201ENST00000362541 86 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 GPX2-201ENST00000389614 990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 IGLV6-57-201ENST00000390285 353 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 TRBV5-1-201ENST00000390381 652 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 PDCL3P5-201ENST00000398028 722 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 RNA5SP209-201ENST00000411237 97 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 WDR82P1-201ENST00000439836 939 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 AL135929.1-201ENST00000449287 552 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 AC016724.1-201ENST00000453215 421 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 CBX1P2-201ENST00000453841 458 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 RN7SL598P-201ENST00000494391 294 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 AC109481.1-201ENST00000509173 282 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 RNA5SP422-201ENST00000516778 111 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 AC091516.1-201ENST00000549191 703 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 AC092375.1-201ENST00000550410 637 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 AC079363.1-201ENST00000551366 1125 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 AC091073.1-201ENST00000559620 666 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 AC106782.4-201ENST00000568264 210 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 SCIMP-204ENST00000574297 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 AC096708.1-201ENST00000584419 658 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
MKRN4PQ13434 AC011474.3-201ENST00000587520 250 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
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