Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 AL132712.2-201ENST00000556653 127 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 GRAMD1B-207ENST00000529750 7723 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 EFNA5-206ENST00000611503 4933 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 ERC1-203ENST00000360905 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 WDR64-201ENST00000366552 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 IPCEF1-203ENST00000422970 3267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 TM4SF1-202ENST00000472441 3115 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 AL355306.2-205ENST00000635395 1646 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 ARHGEF12-201ENST00000356641 6891 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 RPL7P41-201ENST00000485823 957 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 LINC01192-207ENST00000492553 836 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 RNA5SP43-201ENST00000516559 110 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 AC026401.1-201ENST00000549756 530 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 AC011477.5-201ENST00000586571 259 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 MIA3-203ENST00000344922 8142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 BCLAF3-203ENST00000379687 6528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 EYA4-202ENST00000355286 4317 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 SPTA1-201ENST00000368147 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 ARHGAP32-201ENST00000310343 10111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 CRISP1-201ENST00000329411 1709 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 CTNND1-204ENST00000361796 6226 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 AC009779.8-201ENST00000641684 4384 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 MFSD8-220ENST00000641243 1422 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 AASDH-202ENST00000451613 3182 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 MIR589-201ENST00000385238 99 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 RPL32P23-201ENST00000397237 405 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 AL390316.1-201ENST00000406279 553 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 CYTOR-204ENST00000409898 560 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 RN7SKP100-201ENST00000411258 284 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 AL391704.2-201ENST00000418379 981 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 FSIP2-AS1-201ENST00000429929 440 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 TEX41-206ENST00000432608 661 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 AL354863.1-204ENST00000436430 556 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 FSIP2-AS1-202ENST00000436557 689 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 MIR4435-2HG-214ENST00000453478 560 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 RPL23AP56-201ENST00000460778 453 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 AP006289.1-201ENST00000538089 277 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 LINC02408-202ENST00000538573 559 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 AL391358.1-201ENST00000605342 190 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 CCDC25-212ENST00000640944 261 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 N4BP2L2-204ENST00000399396 2872 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 ARHGAP18-201ENST00000368149 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 ZNF83-204ENST00000545872 2633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 RFC1-202ENST00000381897 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 AL162425.1-201ENST00000423637 1525 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 PPEF1-201ENST00000349874 2687 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 CARF-203ENST00000414439 2099 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 TRIM51GP-201ENST00000534741 1350 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 AL122126.1-201ENST00000546905 1318 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 CACNA1D-211ENST00000636570 6441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 AC007618.1-201ENST00000366455 732 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 AL138767.2-201ENST00000446794 168 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 PTCHD1-AS-201ENST00000455399 718 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 AC022679.1-202ENST00000520251 376 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 ATXN3-215ENST00000532032 1191 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 ASB8-204ENST00000536071 568 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 LINC02444-201ENST00000550723 1256 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 AC021483.2-201ENST00000567415 758 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 AC112694.2-201ENST00000623697 768 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 SLC9B1-202ENST00000394789 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 LRRK2-201ENST00000298910 9158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 NRG1-220ENST00000539990 2401 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 GRIK2-204ENST00000369137 4272 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 SIAH3-201ENST00000400405 7057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 AC083837.1-201ENST00000565297 2994 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 OR2A7-202ENST00000641841 2062 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 RYBP-201ENST00000477973 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 SNORA2.3-201ENST00000383920 135 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 AC009506.2-201ENST00000420635 840 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
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BPTFQ12830 MIR6716-201ENST00000613413 80 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 PTPRB-208ENST00000550358 6583 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 ZBTB21-204ENST00000398505 6846 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 ZNF181-203ENST00000459757 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 AIMP1-202ENST00000394701 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 STAP1-201ENST00000265404 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 AP005435.3-201ENST00000531260 3198 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 ANKFY1-201ENST00000341657 7418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 SNORA71.3-201ENST00000362582 128 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 AL590723.1-201ENST00000426030 629 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 BX842559.2-201ENST00000451418 605 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 COX6B1P5-201ENST00000509843 249 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 LINC01088-208ENST00000511895 795 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 AC097460.1-204ENST00000515026 764 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 IGKV3OR22-2-201ENST00000517943 313 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 AC104257.1-202ENST00000524275 884 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 AP003557.1-201ENST00000531715 585 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 LINC01232-203ENST00000625369 576 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 IFNG-AS1-202ENST00000538665 1791 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 A1CF-201ENST00000282641 9350 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 TDO2-208ENST00000536354 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 PZP-201ENST00000261336 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 AL033384.1-202ENST00000431554 3104 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 OR1L4-201ENST00000259466 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 EEF1A1P1-201ENST00000447052 739 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
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