Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 SAMMSON-209ENST00000641222 1100 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
MCAMP43121 CCAT2-201ENST00000630920 1752 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
MCAMP43121 MATR3-230ENST00000394800 5513 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
MCAMP43121 SEMA3A-201ENST00000265362 8225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
MCAMP43121 HAT1-201ENST00000264108 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
MCAMP43121 ZNF679-202ENST00000421025 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
MCAMP43121 LINC01478-201ENST00000587877 2068 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
MCAMP43121 SLCO1C1-209ENST00000545604 2557 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
MCAMP43121 DMD-228ENST00000541735 7080 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
MCAMP43121 AC009962.1-201ENST00000567327 3813 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
MCAMP43121 CYP3A43-203ENST00000342499 1396 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
MCAMP43121 NRG3-202ENST00000372142 3136 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
MCAMP43121 AC109780.1-201ENST00000451768 1344 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
MCAMP43121 TTC37-201ENST00000358746 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
MCAMP43121 LAMA2-201ENST00000421865 9640 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
MCAMP43121 OR2AT4-204ENST00000641593 8733 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
MCAMP43121 RNF20-202ENST00000389120 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
MCAMP43121 CCDC169-202ENST00000239860 716 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
MCAMP43121 OR6C74-201ENST00000343870 1105 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
MCAMP43121 U3.7-201ENST00000363668 216 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
MCAMP43121 ANAPC10P1-201ENST00000395991 556 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
MCAMP43121 NT5C3A-206ENST00000409787 840 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
MCAMP43121 RNU4-27P-201ENST00000410889 139 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
MCAMP43121 AC109779.1-201ENST00000414475 573 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
MCAMP43121 SMIM2-IT1-201ENST00000415082 478 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
MCAMP43121 SLC35E1P1-201ENST00000419313 864 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
MCAMP43121 HMGB3P5-201ENST00000428894 612 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
MCAMP43121 RNFT1P2-201ENST00000443064 757 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
MCAMP43121 LINC02210-201ENST00000444561 288 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
MCAMP43121 IGBP1P3-201ENST00000447449 1000 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
MCAMP43121 AL672138.1-201ENST00000450604 1015 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
MCAMP43121 AC099344.3-201ENST00000454489 626 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
MCAMP43121 RN7SL515P-201ENST00000463999 297 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
MCAMP43121 RPS21P4-201ENST00000487122 248 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
MCAMP43121 WDR78-207ENST00000488333 613 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
MCAMP43121 NADK2-AS1-201ENST00000501794 720 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
MCAMP43121 CCDC169-211ENST00000503173 837 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
MCAMP43121 AC111000.6-201ENST00000514471 709 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
MCAMP43121 LINC02497-201ENST00000515292 507 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
MCAMP43121 OR4A17P-201ENST00000526032 904 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
MCAMP43121 AC004923.2-201ENST00000529649 369 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
MCAMP43121 AC087894.1-201ENST00000538359 518 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
MCAMP43121 OR7G1-201ENST00000541538 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
MCAMP43121 CA1-224ENST00000542576 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
MCAMP43121 RAD51AP1-213ENST00000544927 787 ntTSL 4 BASIC6.6□□□□□ -1.35
MCAMP43121 OR11H3P-201ENST00000554547 982 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
MCAMP43121 RPL10P14-201ENST00000565265 298 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
MCAMP43121 AC090617.5-201ENST00000571815 528 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
MCAMP43121 AC005702.2-201ENST00000591035 481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
MCAMP43121 Z98949.1-204ENST00000595102 731 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
MCAMP43121 AC073254.1-207ENST00000600482 714 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
MCAMP43121 XIST-210ENST00000602863 775 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
MCAMP43121 AC008555.3-201ENST00000603717 442 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
MCAMP43121 AL445435.1-201ENST00000604232 665 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
MCAMP43121 AC009974.1-201ENST00000608881 455 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
MCAMP43121 PXT1-202ENST00000619547 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
MCAMP43121 AC135068.5-201ENST00000624197 983 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
MCAMP43121 AL590396.4-201ENST00000636779 956 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
MCAMP43121 OR5AC4P-202ENST00000642086 985 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
MCAMP43121 MAK-204ENST00000536370 3767 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
MCAMP43121 AL513550.1-201ENST00000418945 1638 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
MCAMP43121 TCF4-284ENST00000637169 7553 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
MCAMP43121 LINC00598-206ENST00000615947 3541 ntTSL 4 BASIC6.6□□□□□ -1.35
MCAMP43121 ESRRG-219ENST00000487276 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
MCAMP43121 OR12D3-201ENST00000396806 1869 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
MCAMP43121 C4BPAP1-201ENST00000415474 1893 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
MCAMP43121 MEIOB-205ENST00000470044 1857 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
MCAMP43121 NSD3-206ENST00000527502 4471 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
MCAMP43121 LIMA1-215ENST00000552823 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
MCAMP43121 AP000547.3-204ENST00000588548 2523 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
MCAMP43121 JCHAIN-201ENST00000254801 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
MCAMP43121 CEP152-201ENST00000325747 4986 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
MCAMP43121 NABP1-204ENST00000410026 11521 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
MCAMP43121 SLC12A6-216ENST00000560164 3744 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
MCAMP43121 CSPP1-201ENST00000262210 4367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
MCAMP43121 MPHOSPH9-220ENST00000606320 6351 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
MCAMP43121 SEPT7P7-201ENST00000420492 1301 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
MCAMP43121 HSPD1P14-201ENST00000432666 1618 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
MCAMP43121 FCER1G-201ENST00000289902 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
MCAMP43121 CFHR2-201ENST00000367415 1059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
MCAMP43121 BX248415.1-201ENST00000367421 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
MCAMP43121 OR2J2-202ENST00000377167 1272 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
MCAMP43121 MIR105-2-201ENST00000385083 81 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
MCAMP43121 AF228730.1-201ENST00000397972 663 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
MCAMP43121 AP000534.2-201ENST00000412729 568 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
MCAMP43121 AC007556.1-201ENST00000432133 307 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
MCAMP43121 OPA1-AS1-201ENST00000433105 492 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
MCAMP43121 AP000855.1-201ENST00000433210 636 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
MCAMP43121 AL450384.1-201ENST00000433526 413 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
MCAMP43121 AC024084.1-201ENST00000440744 455 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
MCAMP43121 ZNF736P8Y-201ENST00000451913 669 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
MCAMP43121 AP000472.1-201ENST00000452500 530 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
MCAMP43121 AC115223.1-201ENST00000466377 870 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
MCAMP43121 RN7SL447P-201ENST00000494711 245 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
MCAMP43121 AC105233.1-201ENST00000498840 781 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
MCAMP43121 HIGD1AP14-201ENST00000507617 282 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
MCAMP43121 AC109464.1-201ENST00000511091 819 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
MCAMP43121 SCARNA16.4-201ENST00000516956 187 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
MCAMP43121 LINC00535-204ENST00000520513 305 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
MCAMP43121 AC021451.1-201ENST00000523498 1129 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 140.7 ms