Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 BARD1-213ENST00000619009 3967 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 PIK3CD-AS1-201ENST00000377320 1823 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 TXNRD1-215ENST00000526950 1847 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 ZNF321P-201ENST00000313956 2341 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 MARK2P11-201ENST00000518523 1670 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 SEC24D-201ENST00000280551 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 SH2D4A-201ENST00000265807 3352 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 EXOSC2-204ENST00000372358 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 ABLIM3-207ENST00000508983 2011 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 PLAC4-201ENST00000623119 5588 ntAPPRIS P1 BASIC9.77□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 PPEF1-202ENST00000361511 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 INPP5F-201ENST00000361976 5063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 CPB2-AS1-204ENST00000606991 3218 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 AURKA-201ENST00000312783 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 GNAS-208ENST00000371075 2551 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 ZNF214-204ENST00000536068 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 TANGO6-201ENST00000261778 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 SCN1B-208ENST00000640135 4846 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 AC007731.2-201ENST00000426448 1703 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 MAP4-205ENST00000420772 3478 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 MYO5A-205ENST00000399231 12225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 GSTCD-203ENST00000394730 4043 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 SENP1-205ENST00000549595 1932 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 ADGRG1-202ENST00000456916 3860 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 NRF1-204ENST00000393230 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 AP001642.1-201ENST00000624727 2117 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 NEDD1-203ENST00000429527 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 LINC01260-201ENST00000415889 1416 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 ZNF597-201ENST00000301744 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 RALYL-204ENST00000518566 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 BAZ2A-211ENST00000549884 6050 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 ACAD10-201ENST00000313698 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 RCAN1-204ENST00000399272 2164 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 MIR219A1-201ENST00000362166 110 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 CARD17-201ENST00000375707 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
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HOXD11P31277 GEMIN6-203ENST00000409566 834 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
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HOXD11P31277 AC009119.3-201ENST00000562835 388 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
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HOXD11P31277 AL355987.5-201ENST00000621585 411 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
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HOXD11P31277 NSUN7-202ENST00000381782 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
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HOXD11P31277 RGPD5-201ENST00000016946 7253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 TP53BP1-210ENST00000450115 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
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HOXD11P31277 MKKS-202ENST00000399054 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
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HOXD11P31277 LINC00485-201ENST00000547179 3722 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
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HOXD11P31277 ZNF175-201ENST00000262259 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 ASCC3-204ENST00000369162 8146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 ZNF3-202ENST00000299667 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 C5orf64-203ENST00000505642 2970 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 RMI1-201ENST00000325875 3420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 AL139811.2-201ENST00000373465 1630 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 SMG1P3-205ENST00000522480 4262 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 ITGB1BP2-205ENST00000538820 1439 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 BHLHB9-205ENST00000457056 4082 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.75□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 COL3A1-202ENST00000317840 3873 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 RPGR-202ENST00000339363 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 IPCEF1-202ENST00000367220 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 IL5RA-209ENST00000446632 2514 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 FAM197Y8-201ENST00000426661 2340 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 FAM197Y6-202ENST00000442145 2340 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 ZNF189-204ENST00000615466 2316 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 ERBB3-201ENST00000267101 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 SNORA35-201ENST00000386104 128 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 RNU6-754P-201ENST00000391166 107 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 RNU4ATAC2P-201ENST00000408674 126 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 RN7SKP152-201ENST00000410444 315 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 AL139161.1-201ENST00000443207 190 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 RN7SL63P-201ENST00000468228 304 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 RN7SL654P-201ENST00000479178 292 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
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