Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 AC091564.1-201ENST00000464563 479 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
PTPREP23469 AC011005.4-201ENST00000466717 535 ntTSL 3 BASIC8.64□□□□□ -1.03
PTPREP23469 TOPORSLP1-201ENST00000467693 2102 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
PTPREP23469 AC026780.2-201ENST00000503489 730 ntTSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
PTPREP23469 AC024132.2-201ENST00000506878 482 ntTSL 3 BASIC8.64□□□□□ -1.03
PTPREP23469 CHCHD2P7-201ENST00000508008 452 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
PTPREP23469 CDC42P3-201ENST00000518493 633 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
PTPREP23469 OR8A2P-201ENST00000528631 952 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
PTPREP23469 AP001189.6-201ENST00000528781 831 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
PTPREP23469 NDUFA3P2-201ENST00000531434 232 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
PTPREP23469 RAB30-209ENST00000532548 644 ntTSL 3 BASIC8.64□□□□□ -1.03
PTPREP23469 SMCO2-203ENST00000535986 1096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
PTPREP23469 ARL6IP1P1-201ENST00000545836 610 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
PTPREP23469 AC011595.1-201ENST00000548901 753 ntTSL 3 BASIC8.64□□□□□ -1.03
PTPREP23469 SCOCP1-201ENST00000554676 349 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
PTPREP23469 AC034105.3-201ENST00000565294 442 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
PTPREP23469 RBM4-213ENST00000578778 582 ntTSL 4 BASIC8.64□□□□□ -1.03
PTPREP23469 LINC01908-201ENST00000583148 555 ntTSL 4 BASIC8.64□□□□□ -1.03
PTPREP23469 AC019131.1-201ENST00000583654 622 ntTSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
PTPREP23469 MTCO2P22-201ENST00000603246 681 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
PTPREP23469 AC103710.4-201ENST00000609301 899 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
PTPREP23469 CERS6-AS1-209ENST00000609766 642 ntTSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
PTPREP23469 DAOA-AS1_2.1-201ENST00000614829 187 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
PTPREP23469 AL589745.2-201ENST00000616366 555 ntTSL 4 BASIC8.64□□□□□ -1.03
PTPREP23469 AC015722.2-201ENST00000622210 551 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
PTPREP23469 LINC01002-204ENST00000631644 473 ntTSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
PTPREP23469 AC074387.1-201ENST00000632044 823 ntTSL 2 BASIC8.64□□□□□ -1.03
PTPREP23469 ADGRE4P-202ENST00000600751 2810 ntTSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
PTPREP23469 ZC3H11B-202ENST00000636126 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.64□□□□□ -1.03
PTPREP23469 CCDC162P-202ENST00000368966 6751 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
PTPREP23469 SERPINB8-203ENST00000397985 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
PTPREP23469 TOGARAM2-201ENST00000379558 12691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
PTPREP23469 OTX2-201ENST00000339475 3001 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
PTPREP23469 TRIM55-202ENST00000315962 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
PTPREP23469 LINC00269-201ENST00000399711 2173 ntTSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
PTPREP23469 PGM3-212ENST00000513973 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
PTPREP23469 TLN2-209ENST00000561311 11880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
PTPREP23469 ZNF182-202ENST00000396965 3586 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
PTPREP23469 IL31RA-207ENST00000490985 2414 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
PTPREP23469 AC015689.2-201ENST00000528172 1738 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
PTPREP23469 KC6-201ENST00000592302 1713 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
PTPREP23469 KIFAP3-203ENST00000367767 2718 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
PTPREP23469 KCNJ1-203ENST00000392664 1674 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
PTPREP23469 EPHA4-201ENST00000281821 6346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
PTPREP23469 NUMB-214ENST00000555238 3588 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
PTPREP23469 PSMA6-201ENST00000261479 1029 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
PTPREP23469 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
PTPREP23469 U8.3-201ENST00000363321 132 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
PTPREP23469 Y_RNA.231-201ENST00000364358 102 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
PTPREP23469 TRPM3-206ENST00000377097 554 ntTSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
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PTPREP23469 AC103808.6-201ENST00000578035 464 ntTSL 3 BASIC8.63□□□□□ -1.03
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PTPREP23469 SSX2B-202ENST00000596480 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
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PTPREP23469 MUC1-227ENST00000615517 951 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
PTPREP23469 AC092650.2-201ENST00000619984 902 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
PTPREP23469 AC092683.1-207ENST00000620051 837 ntTSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
PTPREP23469 uc_338.37-201ENST00000620113 186 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
PTPREP23469 AC092574.2-201ENST00000631198 753 ntTSL 3 BASIC8.63□□□□□ -1.03
PTPREP23469 AC073488.8-201ENST00000631952 757 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
PTPREP23469 LINC00466-206ENST00000634576 1279 ntTSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
PTPREP23469 ADA2-202ENST00000330232 3195 ntTSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
PTPREP23469 NLRP9-201ENST00000332836 3484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
PTPREP23469 TPTE2-201ENST00000255310 1562 ntTSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
PTPREP23469 AC242022.1-201ENST00000638002 1565 ntTSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
PTPREP23469 AL161911.1-202ENST00000464488 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
PTPREP23469 AC126755.2-201ENST00000545114 1522 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
PTPREP23469 C18orf54-206ENST00000620105 5693 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
PTPREP23469 MITF-201ENST00000314557 1798 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
PTPREP23469 NMD3P1-201ENST00000439704 1488 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
PTPREP23469 SF3A3P1-201ENST00000446317 1477 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
PTPREP23469 PIGN-225ENST00000638435 4382 ntTSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
PTPREP23469 TMPPE-202ENST00000416695 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
PTPREP23469 ACKR2-202ENST00000442925 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
PTPREP23469 CDH2-202ENST00000399380 3737 ntTSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
PTPREP23469 AL451064.2-201ENST00000623514 1654 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
PTPREP23469 ZBTB18-201ENST00000358704 3851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
PTPREP23469 OPALIN-202ENST00000393870 3578 ntTSL 3 BASIC8.62□□□□□ -1.03
PTPREP23469 AC006019.2-201ENST00000451116 3044 ntTSL 2 BASIC8.62□□□□□ -1.03
PTPREP23469 LINC01692-201ENST00000441009 2719 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
PTPREP23469 VPS41-202ENST00000310301 5903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
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