Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 AC018442.3-201ENST00000523025 183 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ATG16L1Q676U5 AP000842.2-202ENST00000526211 569 ntTSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ATG16L1Q676U5 AP001000.1-201ENST00000526843 742 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ATG16L1Q676U5 EIF4A2P5-201ENST00000529914 499 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ATG16L1Q676U5 AP003037.1-201ENST00000537594 267 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ATG16L1Q676U5 TIMM9-203ENST00000555061 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
ATG16L1Q676U5 MT1CP-201ENST00000567054 174 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ATG16L1Q676U5 H3F3BP2-201ENST00000583907 357 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ATG16L1Q676U5 SS18L2P2-201ENST00000583960 235 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ATG16L1Q676U5 AC097717.1-230ENST00000597051 738 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ATG16L1Q676U5 FAM72A-208ENST00000607379 1139 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ATG16L1Q676U5 AC004477.3-201ENST00000614061 590 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ATG16L1Q676U5 AJ009632.2-203ENST00000634708 1205 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ATG16L1Q676U5 PDE10A-203ENST00000539869 4401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
ATG16L1Q676U5 TEDDM1-201ENST00000367565 2500 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ATG16L1Q676U5 AC011912.1-201ENST00000623483 5819 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
ATG16L1Q676U5 RPGRIP1L-212ENST00000621565 6038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
ATG16L1Q676U5 TMEM99-201ENST00000301665 2058 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ATG16L1Q676U5 SLITRK4-202ENST00000356928 3074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ATG16L1Q676U5 IPCEF1-210ENST00000519344 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ATG16L1Q676U5 OR8J3-204ENST00000642058 3806 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ATG16L1Q676U5 DCLK1-204ENST00000379893 4612 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ATG16L1Q676U5 AASDH-202ENST00000451613 3182 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
ATG16L1Q676U5 AP002001.1-201ENST00000526101 1759 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
ATG16L1Q676U5 ART3-203ENST00000355810 1561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
ATG16L1Q676U5 ADGRG4-202ENST00000394141 8971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
ATG16L1Q676U5 MAK-203ENST00000474039 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
ATG16L1Q676U5 AL445623.2-201ENST00000640307 4805 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
ATG16L1Q676U5 ADGRL2-209ENST00000370727 5164 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ATG16L1Q676U5 CYP3A43-204ENST00000354829 1709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
ATG16L1Q676U5 AC008627.1-201ENST00000517511 1704 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ATG16L1Q676U5 VPS50-202ENST00000305866 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
ATG16L1Q676U5 EDA2R-203ENST00000396050 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ATG16L1Q676U5 PLS1-211ENST00000497002 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
ATG16L1Q676U5 DYNC2LI1-210ENST00000605786 1346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
ATG16L1Q676U5 RAP1GDS1-202ENST00000339360 2092 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
ATG16L1Q676U5 LRRC37A-203ENST00000496930 3860 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ATG16L1Q676U5 AC010099.4-201ENST00000424515 1453 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ATG16L1Q676U5 CNKSR2-202ENST00000379510 5315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
ATG16L1Q676U5 RPL39P5-201ENST00000273411 449 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
ATG16L1Q676U5 CD84-205ENST00000368051 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
ATG16L1Q676U5 MIR320B1-201ENST00000390209 79 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ATG16L1Q676U5 TRGV5-201ENST00000390344 552 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ATG16L1Q676U5 SNORA48.4-201ENST00000391089 134 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ATG16L1Q676U5 RPS27AP11-201ENST00000402798 447 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ATG16L1Q676U5 RN7SKP222-201ENST00000410651 315 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ATG16L1Q676U5 RN7SKP29-201ENST00000410957 272 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ATG16L1Q676U5 LYST-AS1-201ENST00000412098 521 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ATG16L1Q676U5 AL357752.1-201ENST00000412817 349 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ATG16L1Q676U5 ITGA9-AS1-202ENST00000420870 581 ntTSL 4 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ATG16L1Q676U5 GAPDHP48-201ENST00000436626 961 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ATG16L1Q676U5 AP001604.1-201ENST00000447384 954 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
ATG16L1Q676U5 CYCSP42-201ENST00000450823 238 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ATG16L1Q676U5 HMGB1P26-201ENST00000452520 628 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ATG16L1Q676U5 AZGP1P2-201ENST00000454506 345 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ATG16L1Q676U5 AC096741.1-201ENST00000472250 846 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ATG16L1Q676U5 SLC9A9-AS1-201ENST00000479030 518 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ATG16L1Q676U5 RN7SL612P-201ENST00000497704 295 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ATG16L1Q676U5 PPM1AP1-201ENST00000502740 1135 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ATG16L1Q676U5 EPPIN-WFDC6-201ENST00000504988 1156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ATG16L1Q676U5 NAMPTP2-201ENST00000505629 1115 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ATG16L1Q676U5 AC113367.2-201ENST00000505749 160 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ATG16L1Q676U5 RCHY1-206ENST00000507014 650 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ATG16L1Q676U5 TMEM161B-AS1-208ENST00000507736 630 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ATG16L1Q676U5 AC008957.1-203ENST00000508745 589 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ATG16L1Q676U5 AC091912.1-201ENST00000511351 248 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ATG16L1Q676U5 MTCO3P27-201ENST00000514397 196 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ATG16L1Q676U5 AP000859.1-201ENST00000525536 307 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ATG16L1Q676U5 LINC02416-201ENST00000550019 540 ntTSL 4 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ATG16L1Q676U5 AL445363.1-202ENST00000553697 545 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ATG16L1Q676U5 AL121852.1-201ENST00000554665 430 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ATG16L1Q676U5 AL355838.1-201ENST00000554814 559 ntTSL 4 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ATG16L1Q676U5 GLRXP2-201ENST00000555594 321 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ATG16L1Q676U5 ETFRF1-211ENST00000557540 1259 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ATG16L1Q676U5 AL109741.3-201ENST00000561748 592 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ATG16L1Q676U5 AC106730.2-201ENST00000566641 540 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ATG16L1Q676U5 LYRM1-211ENST00000569023 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ATG16L1Q676U5 AC090618.1-201ENST00000571972 585 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ATG16L1Q676U5 AC005703.3-201ENST00000579159 373 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ATG16L1Q676U5 LINC02563-201ENST00000579474 277 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ATG16L1Q676U5 AP005119.1-201ENST00000580956 292 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ATG16L1Q676U5 AC005244.1-201ENST00000582566 339 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ATG16L1Q676U5 EIF1P5-201ENST00000585002 234 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ATG16L1Q676U5 SLC14A2-AS1-204ENST00000592899 359 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ATG16L1Q676U5 AC068768.2-201ENST00000602352 343 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ATG16L1Q676U5 AC091769.2-201ENST00000605385 479 ntTSL 4 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ATG16L1Q676U5 AC005156.1-201ENST00000613371 573 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ATG16L1Q676U5 AL359513.1-201ENST00000614364 557 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ATG16L1Q676U5 HTR1DP1-201ENST00000616500 888 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ATG16L1Q676U5 AC022306.3-201ENST00000619930 550 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ATG16L1Q676U5 AC010435.1-201ENST00000623353 1177 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ATG16L1Q676U5 AL590396.2-201ENST00000636511 1041 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ATG16L1Q676U5 5S_rRNA.29-201ENST00000641250 107 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ATG16L1Q676U5 GNRHR-201ENST00000226413 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
ATG16L1Q676U5 LRRC8B-201ENST00000330947 7593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ATG16L1Q676U5 MECOM-217ENST00000494292 3939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ATG16L1Q676U5 AC018557.1-201ENST00000569274 1790 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ATG16L1Q676U5 PSG1-201ENST00000244296 2276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
ATG16L1Q676U5 ZNF334-203ENST00000593880 2635 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
ATG16L1Q676U5 AC027088.4-201ENST00000611559 1947 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.6 ms