Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 PIGN-241ENST00000640050 3154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 DLGAP1-AS2-202ENST00000573177 1388 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 EIF3E-206ENST00000519030 1324 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 ZNF782-208ENST00000535338 3296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 TSPAN8-201ENST00000247829 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 WFDC11-202ENST00000356562 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 AC106870.1-201ENST00000359823 200 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 RN7SKP28-201ENST00000364770 305 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 APOA2-201ENST00000367990 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 RNA5SP105-201ENST00000391123 113 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 RNA5SP241-201ENST00000391326 114 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 AL445213.1-201ENST00000412589 747 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 BMS1P17-202ENST00000416720 316 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 OXSM-202ENST00000420173 1256 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 GNG5P5-201ENST00000420444 220 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 RPL34P3-201ENST00000421454 338 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 AC010737.1-201ENST00000426699 559 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 MAJIN-202ENST00000432175 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 AL031599.1-201ENST00000432694 808 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 AL136988.2-201ENST00000440729 861 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 RPL36AP39-201ENST00000445859 318 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 CBX1P2-201ENST00000453841 458 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 LINC01436-201ENST00000457157 1048 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 AC091976.1-201ENST00000458002 448 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 AC098583.1-201ENST00000480875 255 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 OR11I1P-201ENST00000486033 954 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 ZCCHC10-203ENST00000504170 325 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 AC109464.1-201ENST00000511091 819 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 LINC02358-201ENST00000514413 465 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 HMGN1P9-201ENST00000515212 298 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 AC103833.1-201ENST00000517442 172 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 LINC01904-201ENST00000564872 861 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 AC233266.2-201ENST00000567067 528 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 RN7SL290P-201ENST00000578661 300 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 GXYLT1P5-202ENST00000618830 589 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 AL445493.3-201ENST00000619568 477 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 CU639417.4-201ENST00000623928 207 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 AC068631.1-223ENST00000625877 472 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 AC073869.7-201ENST00000640874 297 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 AC015813.1-203ENST00000585065 4722 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 TCF7L2-206ENST00000355995 4073 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 CCDC178-202ENST00000383096 3391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 MAP2-205ENST00000392194 5303 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 MOSPD2-201ENST00000380492 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 ANKRD49-208ENST00000544253 3002 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 AC002525.1-201ENST00000624392 1622 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 RNF19A-205ENST00000519449 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 IKZF2-207ENST00000434687 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 EPB41L2-226ENST00000530757 4360 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 CRYAB-201ENST00000227251 848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 TMBIM4-201ENST00000286424 989 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 SSX1-201ENST00000376919 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 RNA5SP284-201ENST00000384547 118 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 CEACAM7-202ENST00000401731 1236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 Z86062.1-201ENST00000406773 777 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 PTP4A1P1-201ENST00000420539 515 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 MTND6P12-201ENST00000428247 522 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 HSPD1P12-201ENST00000429127 1069 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 RPL7AP49-201ENST00000429522 581 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 LINC00894-203ENST00000432696 298 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 AL591438.1-201ENST00000433508 581 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 AC002504.1-201ENST00000438281 691 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 AC068489.1-201ENST00000453706 261 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 MTND2P39-201ENST00000457230 764 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 AL122019.1-202ENST00000458070 546 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 AC021087.2-201ENST00000504656 1203 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 AC117383.1-201ENST00000507698 422 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 AP001266.2-201ENST00000534505 464 ntTSL 4 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 AP003037.1-201ENST00000537594 267 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 DUX4L52-201ENST00000549363 777 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 AC124784.1-201ENST00000552426 571 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 AL161804.1-201ENST00000555600 708 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 AL049872.1-201ENST00000556323 322 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 USP3-AS1-202ENST00000559357 455 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 AC015660.3-201ENST00000559569 198 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 AP000842.3-201ENST00000564354 808 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 RBM22P12-201ENST00000567098 1255 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 PDE6G-203ENST00000571224 526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 AC010547.6-201ENST00000571789 193 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 AC015845.1-202ENST00000580184 242 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 AC008537.2-201ENST00000596135 482 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 ERVK-28-203ENST00000600419 457 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 AC135178.6-201ENST00000605314 398 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 AL022394.1-201ENST00000606979 292 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 LINC02335-201ENST00000616578 659 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 uc_338.7-201ENST00000621834 124 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 AC105105.5-201ENST00000622635 1294 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 SPAM1-201ENST00000223028 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 AL078621.3-201ENST00000623707 2042 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 ELAVL4-205ENST00000371824 3966 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 AL603750.1-201ENST00000624216 1717 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 SEC31A-204ENST00000355196 4104 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 KRR1-201ENST00000229214 10118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 NSUN3-201ENST00000314622 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 ZNF24-202ENST00000399061 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 PTPRZ1-201ENST00000393386 8175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 PCDH15-207ENST00000395430 7002 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 PTPRB-202ENST00000334414 12316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 GPALPP1-201ENST00000357537 5368 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 DMTF1-204ENST00000413276 3548 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
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