Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 SPAG11B-201ENST00000297498 795 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 Y_RNA.145-201ENST00000363527 102 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 RN7SKP118-201ENST00000364331 330 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 SSX6-201ENST00000376932 562 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 TRBV9-201ENST00000390363 390 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 SRI-202ENST00000394641 653 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 COX6A1P3-201ENST00000404167 293 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 RSPH14-202ENST00000406876 519 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 MAST4-207ENST00000407621 559 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 VN1R8P-201ENST00000407739 893 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 MIR1303-201ENST00000408625 86 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 AL162411.1-201ENST00000413145 526 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 HCG25-217ENST00000422366 702 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 DBIL5P2-201ENST00000443827 253 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 AL049552.1-201ENST00000444302 577 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 AL355592.1-201ENST00000450292 386 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 SLC31A1P1-201ENST00000451221 567 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 FGF7P3-201ENST00000454645 303 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 TBL1XR1-AS1-201ENST00000454723 414 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 AL117382.2-201ENST00000455642 403 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 AC073594.1-201ENST00000462065 364 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 RPL5P12-201ENST00000477071 851 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 MME-AS1-201ENST00000484721 828 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 AC079594.1-201ENST00000489757 331 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 ABHD10-204ENST00000494817 801 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 GYPA-209ENST00000512789 258 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 AC112196.1-201ENST00000515092 832 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 AC018437.2-201ENST00000517369 389 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 HMGB1P23-201ENST00000518743 568 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 LGALS8-217ENST00000525042 903 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 AC055720.2-201ENST00000537724 172 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 RPL3P13-201ENST00000550415 216 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 AC025263.2-201ENST00000550437 548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 AC016526.2-201ENST00000554225 520 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 GNG2-215ENST00000557376 573 ntTSL 4 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 AL359999.1-201ENST00000604513 294 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 AC113139.1-201ENST00000605049 239 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 AL591686.2-201ENST00000608241 475 ntTSL 4 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 AL161734.1-201ENST00000609720 557 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 MIR6780B-201ENST00000610307 79 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 CCL14-202ENST00000618404 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 AC092683.2-201ENST00000619740 621 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 RN7SL680P-201ENST00000620379 299 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 OR3A3-203ENST00000641141 3800 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 OR2AK2-202ENST00000641852 1008 ntAPPRIS P2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 GPM6B-205ENST00000454189 3957 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 AMD1-204ENST00000368885 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 ZNF90-201ENST00000418063 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 MAK-202ENST00000354489 3941 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 AL109918.1-201ENST00000602367 3039 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 COL21A1-212ENST00000535941 3369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 RIOK2-202ENST00000508447 2149 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 BRS3-201ENST00000370648 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 EPHA4-201ENST00000281821 6346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 PTPRR-203ENST00000378778 2632 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 AC108467.2-201ENST00000617640 1597 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 AGBL4-203ENST00000371838 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 GMFB-209ENST00000616146 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 IKZF3-213ENST00000439167 1879 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 NOX4-211ENST00000528341 1899 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 FAM19A2-215ENST00000551619 2718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 AL161911.1-202ENST00000464488 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 VPS8-210ENST00000446204 4721 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 ADAM3A-202ENST00000460383 2528 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 GCNT2-202ENST00000316170 4381 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 LL22NC03-63E9.3-201ENST00000407120 3111 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 MARF1-201ENST00000396368 7743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 NMD3P1-201ENST00000439704 1488 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 AC024560.2-201ENST00000507981 1497 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 ZNF674-207ENST00000523374 4073 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 NPIPB5-209ENST00000517539 3569 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 AC006511.3-201ENST00000624929 1783 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 LINC00561-201ENST00000565815 2738 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 BSPH1-201ENST00000344839 654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 NLRP3-202ENST00000348069 3828 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 RNU6-666P-201ENST00000363499 107 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 Y_RNA.315-201ENST00000365117 102 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 Y_RNA.459-201ENST00000384251 102 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 MIR1272-201ENST00000408106 129 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 AC023347.1-202ENST00000419223 440 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 NCOR1P3-201ENST00000420479 303 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 AL135785.1-201ENST00000422554 399 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 DAZAP2-202ENST00000425012 1117 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 FGF12-202ENST00000430714 603 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 AL589990.1-201ENST00000432210 592 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 AC113331.2-201ENST00000445557 926 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 RPL7P59-201ENST00000447700 943 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 Y_RNA.632-201ENST00000459189 102 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 MEMO1P3-201ENST00000459811 302 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 AC121764.1-201ENST00000472238 563 ntTSL 4 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 AC017015.1-201ENST00000477387 286 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 AC073610.1-201ENST00000489971 396 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 AC023194.1-201ENST00000493084 308 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 AC010168.1-201ENST00000501178 657 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 ZCCHC10-203ENST00000504170 325 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 AC093809.1-201ENST00000509155 340 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 AC233724.10-201ENST00000510454 409 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 RNU6-445P-201ENST00000516949 107 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 IGHVIII-67-3-201ENST00000517650 232 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
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