Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 MTCO2P11-201ENST00000431069 680 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 AC242426.1-201ENST00000435270 960 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 AC234064.1-201ENST00000436312 247 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 ACBD3-AS1-201ENST00000440540 535 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 MTATP6P30-201ENST00000443540 664 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 AC023512.1-201ENST00000444513 499 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 AC010240.2-201ENST00000445363 1205 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 AC087501.1-201ENST00000445617 715 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 AL157827.1-201ENST00000447622 132 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 RBMY3AP-201ENST00000449381 1145 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 RPS27AP2-201ENST00000457576 465 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 RN7SL561P-201ENST00000488553 281 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 AC124893.1-201ENST00000496247 545 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 AC098859.2-201ENST00000506232 563 ntTSL 4 BASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 AC079395.1-201ENST00000510981 262 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 AC016074.1-201ENST00000518339 636 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 AC023632.1-201ENST00000518463 375 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 TPT1-AS1-216ENST00000522845 403 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 PRH1-204ENST00000539853 837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 GLYCAM1-201ENST00000546596 285 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 OR4C13-201ENST00000555099 1029 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 AL121839.1-201ENST00000556233 1185 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 DIO2-210ENST00000557010 6367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 AC002310.3-201ENST00000569728 723 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 MIR4502-201ENST00000580432 81 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 RN7SL475P-201ENST00000583379 298 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 DYNLL1P1-201ENST00000595442 269 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 AC073046.2-201ENST00000604756 527 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 IL21-202ENST00000611104 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 MIR7844-201ENST00000616161 122 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 MIR6085-201ENST00000618314 110 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 ARFGAP2-230ENST00000629231 213 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 ZNRD1ASP-221ENST00000637794 1074 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 TRRAP-201ENST00000355540 12590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 AL137918.1-201ENST00000624542 1922 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 AP003119.3-201ENST00000566747 4192 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 LIN7A-204ENST00000552864 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 MDM4-207ENST00000454264 9926 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 AC106038.1-201ENST00000501194 3473 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 AC007998.4-201ENST00000612496 2533 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 BUB3-203ENST00000368865 7828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 ADAM7-204ENST00000520720 1870 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 BMS1-201ENST00000374518 7753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 MRRFP1-201ENST00000435941 1675 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 KCNMB2-204ENST00000432997 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 TCF12-207ENST00000557843 4076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 PLCH1-206ENST00000494598 3525 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 TTC39B-208ENST00000512701 10483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 TTC21A-203ENST00000431162 4209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 MYLK4-201ENST00000274643 5806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 DDX1-208ENST00000621973 2183 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 OR4K1-203ENST00000641429 1358 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 LDAH-212ENST00000619656 3663 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 A2M-201ENST00000318602 4844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 IL5RA-204ENST00000418488 5521 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 MR1-204ENST00000367580 7704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 TRAPPC3L-201ENST00000356128 2421 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 USP46-202ENST00000451218 4622 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 RNU5F-7P-201ENST00000363696 115 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 RNA5SP433-201ENST00000364491 114 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 RN7SKP275-201ENST00000364626 301 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 RNU4-91P-201ENST00000364778 135 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 PRPS1-202ENST00000372419 628 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 AC117402.1-202ENST00000383686 820 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 TRAV19-201ENST00000390447 467 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 RPL34-203ENST00000394668 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 NCSTNP1-201ENST00000406229 144 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 LINC01709-201ENST00000415532 634 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 AC027644.1-201ENST00000419595 298 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 AC007435.1-201ENST00000421086 415 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 AC008753.1-201ENST00000423096 284 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
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HOXD8P13378 DEFA9P-201ENST00000433042 285 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 HMGN1P2-201ENST00000445197 310 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 NANOGNBP1-201ENST00000448444 480 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 AC211433.1-201ENST00000450426 686 ntTSL 4 BASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 AP000431.2-201ENST00000450653 790 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 EIF4A2P4-201ENST00000458691 1196 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 RN7SL254P-201ENST00000460609 284 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 AC018638.3-201ENST00000461273 132 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 AL121769.1-201ENST00000469473 401 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 DCUN1D1-204ENST00000469954 970 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 AC083906.1-201ENST00000509298 406 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 LINC02201-203ENST00000514657 674 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 AP002004.1-202ENST00000528437 586 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 IL18-204ENST00000528832 795 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 MIR100HG-221ENST00000534297 572 ntTSL 4 BASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 KLRC2-204ENST00000536833 771 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 AL133481.2-201ENST00000538322 367 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 LINC02420-201ENST00000543387 741 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 AC004825.1-201ENST00000555068 586 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 NR2F2-AS1-208ENST00000560395 441 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 AC005730.3-201ENST00000583067 366 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 AC005034.5-201ENST00000604219 466 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 AL121757.2-201ENST00000611223 313 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 MALAT1-210ENST00000617489 318 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 AC099063.3-201ENST00000642066 185 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 TSC1-203ENST00000440111 8463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 NEMP2-202ENST00000409150 6168 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 LRRC28-201ENST00000301981 5971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
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