Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 AC097063.1-201ENST00000426714 1797 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 LINC01619-203ENST00000549802 2169 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 ALCAM-205ENST00000472644 4189 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 ZNF658-201ENST00000612867 4160 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 RNA5SP428-201ENST00000365129 132 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 U3.22-201ENST00000391120 215 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 OTUD6B-202ENST00000404789 1089 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 GSTM5P1-201ENST00000434751 660 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 EEF1A1P1-201ENST00000447052 739 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 AC093840.1-201ENST00000511599 336 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 RNA5SP464-201ENST00000516251 108 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 AC130364.2-201ENST00000528639 604 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 AL352984.2-202ENST00000613699 155 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 NEK3-211ENST00000629912 141 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 CNTN5-204ENST00000524871 6258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 NAT1-210ENST00000545197 1827 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 SCAF11-212ENST00000549162 3934 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 HTR1F-201ENST00000319595 3140 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 ETFBKMT-201ENST00000357721 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 CR1-203ENST00000367051 7469 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 CR1-204ENST00000367052 7469 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 CR1-205ENST00000367053 7469 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 HAUS3-201ENST00000243706 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 BDNF-212ENST00000525528 4766 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 WDR35-201ENST00000281405 6918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 BLM-201ENST00000355112 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 AL078621.3-201ENST00000623707 2042 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 AC007114.2-201ENST00000576014 4281 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 AC113146.2-201ENST00000560743 1961 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 TYW3-203ENST00000457880 3335 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
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CHD4Q14839 RGS5-219ENST00000528019 512 ntTSL 4 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 AC090125.1-201ENST00000581541 493 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 AC010422.4-201ENST00000601420 533 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 AC069542.2-201ENST00000624816 216 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 AC018557.1-201ENST00000569274 1790 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 NRCAM-202ENST00000379022 3900 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 AC017104.4-201ENST00000636283 1592 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 ZNF418-205ENST00000595830 3543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 GIGYF2-246ENST00000629305 7878 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 N4BP2-201ENST00000261435 9744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 DDX58-201ENST00000379868 4089 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 NHS-205ENST00000617601 8163 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 LIMCH1-201ENST00000313860 6165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 CPS1-203ENST00000430249 5698 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 DIAPH3-208ENST00000498416 2249 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 LCP2-201ENST00000046794 4678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 U3.10-201ENST00000364459 214 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 SLC26A5-208ENST00000393730 2498 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
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CHD4Q14839 AC062021.1-201ENST00000429008 557 ntTSL 4 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 CASP12-204ENST00000433738 709 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 ASPH-226ENST00000522919 1277 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 AC022523.3-201ENST00000559643 410 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 BGLT3-201ENST00000564523 994 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 RN7SL356P-201ENST00000582228 248 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 SERPINB10-204ENST00000619595 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
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CHD4Q14839 AL160286.3-201ENST00000569644 3294 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
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CHD4Q14839 MECOM-203ENST00000460814 3374 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 LINC01630-202ENST00000578152 3188 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 AQP9-201ENST00000219919 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
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CHD4Q14839 CTSS-201ENST00000368985 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 FILIP1L-202ENST00000354552 3970 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
CHD4Q14839 CASP10-204ENST00000346817 3926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
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CHD4Q14839 UGT2A1-205ENST00000512704 2519 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
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CHD4Q14839 IGKV3OR22-2-201ENST00000517943 313 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CHD4Q14839 AP003557.1-201ENST00000531715 585 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CHD4Q14839 OR4C13-201ENST00000555099 1029 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CHD4Q14839 ZNF701-207ENST00000611267 1136 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CHD4Q14839 SEC22A-201ENST00000309934 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
CHD4Q14839 CAPRIN2-203ENST00000417045 3535 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
CHD4Q14839 NBPF9-205ENST00000613595 4527 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
CHD4Q14839 Z98755.1-201ENST00000407015 1384 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CHD4Q14839 CDC42BPA-201ENST00000334218 10134 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CHD4Q14839 AC006600.2-201ENST00000624834 2506 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CHD4Q14839 BDNF-205ENST00000395981 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
CHD4Q14839 ZNF585A-201ENST00000292841 8618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
CHD4Q14839 LINC01619-207ENST00000551843 2205 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
CHD4Q14839 ESRRG-219ENST00000487276 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
CHD4Q14839 SLC4A10-204ENST00000421911 3398 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CHD4Q14839 ZNF528-203ENST00000391788 4209 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CHD4Q14839 AL121885.1-201ENST00000417957 451 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CHD4Q14839 RPL36AP36-201ENST00000418616 301 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CHD4Q14839 AC092754.1-201ENST00000472975 479 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CHD4Q14839 AC090204.1-202ENST00000500843 737 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CHD4Q14839 AC010451.1-201ENST00000509057 556 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
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