Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 CSNK1A1P3-201ENST00000504105 330 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 SNORA70.20-201ENST00000516848 126 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 AC084855.1-201ENST00000528696 572 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 OR4C13-201ENST00000555099 1029 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 AC018558.1-201ENST00000562591 459 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 PWRN1-207ENST00000565893 818 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 LINC02137-203ENST00000567448 930 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 AC092121.1-201ENST00000569452 202 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 AC130371.1-201ENST00000577023 230 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 AC022884.2-201ENST00000578535 580 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 H3F3BP2-201ENST00000583907 357 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 AC100863.1-201ENST00000584843 560 ntTSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 OR2L8-201ENST00000623922 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 CASC19-222ENST00000641321 1173 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 ST8SIA4-201ENST00000231461 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 PUS10-203ENST00000407787 1820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 AHCTF1-201ENST00000326225 8633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 GRIK2-201ENST00000318991 4317 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 MIR99AHG-219ENST00000619222 3476 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 UGT2B17-201ENST00000317746 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 RNMT-202ENST00000383314 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 NEAT1-202ENST00000501122 22743 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 ANKRD30A-204ENST00000602533 4458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 ADGRL2-206ENST00000370721 5023 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 MAP3K7-203ENST00000369327 4558 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 MRE11-203ENST00000393241 2604 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 ARHGAP24-201ENST00000264343 4572 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 USMG5-201ENST00000309579 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 SSX3-202ENST00000376893 800 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 OR7E101P-201ENST00000400428 513 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 AL139240.1-201ENST00000422963 505 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 AC012519.1-201ENST00000424588 610 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 AL121917.1-201ENST00000441270 893 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 FHP1-201ENST00000442741 703 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 AL356421.2-201ENST00000446733 197 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 PPIA-203ENST00000451562 544 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 AL021940.1-201ENST00000454271 677 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
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IFT88Q13099 RPL5P30-201ENST00000465511 891 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 RPSAP37-201ENST00000470913 821 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 AC087672.1-201ENST00000479876 766 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 DUTP7-201ENST00000507982 486 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 HMGB3P16-201ENST00000508037 287 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 AC107396.1-201ENST00000509641 735 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 AC008592.4-201ENST00000509999 450 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 AC060775.1-201ENST00000518241 520 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 LINC02553-201ENST00000529088 734 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 ATXN3-215ENST00000532032 1191 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 AC068305.2-201ENST00000550567 1205 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 C15orf41-205ENST00000563167 772 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 AC011507.1-201ENST00000585364 567 ntTSL 4 BASIC5.42□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 TTN-AS1-226ENST00000588716 604 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 SSX4B-201ENST00000595235 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 SSX4-201ENST00000595689 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 AC063977.5-201ENST00000601044 974 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 AL589935.1-201ENST00000602418 488 ntTSL 4 BASIC5.42□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 AC092574.2-201ENST00000631198 753 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 TEX41-210ENST00000451774 2098 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 EPHA7-202ENST00000369303 6588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 DBT-201ENST00000370131 1521 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 ZEB1-208ENST00000542815 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
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IFT88Q13099 KANSL1L-209ENST00000457374 2264 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 POU2F1-202ENST00000367862 14038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 KCTD16-201ENST00000507359 13950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 OR2H1-203ENST00000377136 3024 ntAPPRIS P1 BASIC5.41□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 SLC9C1-201ENST00000305815 4172 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
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IFT88Q13099 TMLHE-AS1-201ENST00000433624 1702 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 PLET1-201ENST00000338832 1215 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
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IFT88Q13099 RMRPP5-201ENST00000411156 267 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 LINC00867-202ENST00000415417 488 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 NENFP1-201ENST00000419476 466 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 HMGB3P24-201ENST00000433260 622 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 AC211433.1-202ENST00000434256 1187 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 AP000936.3-201ENST00000438127 255 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 AL512637.1-201ENST00000439523 1231 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 AC113430.1-201ENST00000506872 718 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 LINC02200-202ENST00000508879 615 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 PDE4D-225ENST00000515835 590 ntTSL 4 BASIC5.41□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 AC022882.1-201ENST00000532142 501 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 AC068722.1-202ENST00000559600 655 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 AC114488.3-201ENST00000581333 480 ntTSL 4 BASIC5.41□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 MIR4271-201ENST00000582451 67 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 LINC02112-204ENST00000606222 429 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 FO681491.1-202ENST00000623392 737 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 AP000648.2-201ENST00000624182 404 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 AC087565.3-203ENST00000641018 837 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 AC073869.8-201ENST00000641806 335 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 LIMA1-214ENST00000552783 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 MT-RNR2-201ENST00000387347 1559 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 AL034370.1-201ENST00000397254 1590 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 AC118758.3-201ENST00000624628 24137 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 MRE11-202ENST00000323977 2588 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 OR2L3-202ENST00000641161 2830 ntAPPRIS P1 BASIC5.41□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 PPP2R2A-201ENST00000315985 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
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