Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 PLAGL1-205ENST00000392307 6296 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 MAPK10-233ENST00000515650 2394 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 CWF19L1-201ENST00000354105 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 MTND5P10-201ENST00000603719 1809 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 MAP3K7CL-203ENST00000341618 1855 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 RNU6-619P-201ENST00000365146 108 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 AP004243.1-202ENST00000398983 969 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 AL034403.1-201ENST00000399414 885 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 AL359634.1-202ENST00000404721 284 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 MRPL32P1-201ENST00000406301 247 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 AL358942.1-201ENST00000418595 1178 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 AL500522.1-201ENST00000423667 318 ntTSL 3 BASIC9.2□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 AC023347.2-201ENST00000433994 462 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 AL353093.1-201ENST00000441292 436 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 RPS7P4-201ENST00000444127 582 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 GPC6-AS2-201ENST00000445540 587 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 ARL2BPP7-201ENST00000446421 490 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 AC013429.1-201ENST00000456604 422 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 ARPP21-231ENST00000474696 572 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 AC017015.1-201ENST00000477387 286 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 AC106872.2-201ENST00000494303 480 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 AC098591.2-201ENST00000510152 315 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 RFPL4AP3-201ENST00000515267 345 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 RNU6-1261P-201ENST00000517194 104 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 OR4C1P-201ENST00000530880 937 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 RGS4-209ENST00000531057 544 ntTSL 4 BASIC9.2□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 OR5F2P-201ENST00000532761 941 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 AL389895.1-201ENST00000554127 252 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 RORA-AS2-202ENST00000561413 576 ntTSL 4 BASIC9.2□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 AC015912.1-201ENST00000574826 538 ntTSL 3 BASIC9.2□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 AC125421.2-201ENST00000580370 583 ntTSL 4 BASIC9.2□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 AL021918.1-201ENST00000603933 236 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 RNU6-87P-201ENST00000607561 108 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 AC012510.1-201ENST00000607946 759 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 AL355810.1-201ENST00000614629 552 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 AC096861.1-201ENST00000616652 240 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 AL391425.1-202ENST00000617518 774 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 AL138693.1-201ENST00000622219 129 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 HEATR9-207ENST00000604834 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 NFRKB-202ENST00000524746 4114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 MBP-206ENST00000397863 4800 ntTSL 3 BASIC9.2□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 ANAPC5-208ENST00000535482 2077 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 AC245060.6-201ENST00000624350 8420 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 AC127070.5-201ENST00000623177 2104 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 AC011453.1-201ENST00000597619 2239 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 GJA1-201ENST00000282561 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 NR2F1-AS1-208ENST00000606233 2264 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 GNL2-201ENST00000373062 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 TP63-203ENST00000354600 4668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 HMCN2-206ENST00000624552 15610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 CCR3-202ENST00000395940 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 ANKRD42-202ENST00000393389 4066 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 FBXO38-203ENST00000394370 4132 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 TACC2-226ENST00000513429 4114 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 LINC00547-201ENST00000612438 3314 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 GPR1-209ENST00000612892 2565 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.19□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 REG1CP-205ENST00000444841 1710 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 NLGN4Y-203ENST00000382868 5338 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 MLIP-201ENST00000274897 1815 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 LINC01132-201ENST00000437601 3793 ntTSL 4 BASIC9.19□□□□□ -0.94
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MKRN3Q13064 NOL4-203ENST00000538587 1979 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 AL391095.1-201ENST00000422519 2004 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 SLC11A2-202ENST00000262052 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 GART-201ENST00000361093 2149 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 GINS1-201ENST00000262460 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 PDE6A-204ENST00000613228 5398 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 CCNT2-202ENST00000295238 4491 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 OPTN-203ENST00000378748 3521 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
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MKRN3Q13064 SNCAIP-201ENST00000261367 4986 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 AC239809.3-214ENST00000496508 2513 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 SSX1-201ENST00000376919 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 SUGT1P1-201ENST00000379514 476 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 RPL6P29-201ENST00000414863 865 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 AL359633.1-201ENST00000421403 310 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 SNX18P3-201ENST00000424993 835 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 AL353148.1-204ENST00000426752 477 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
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MKRN3Q13064 AC020719.1-201ENST00000448977 518 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 LINC00571-203ENST00000454060 525 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 RN7SL19P-201ENST00000462522 306 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 RN7SL741P-201ENST00000482473 289 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 LEKR1-206ENST00000483177 546 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 AC091885.1-201ENST00000506658 268 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 AC116634.1-201ENST00000506926 447 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 AC063979.2-201ENST00000513767 958 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 HMGB1P19-201ENST00000517578 577 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 AP000827.1-201ENST00000527814 258 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 AP002444.1-201ENST00000534252 620 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 AL109628.1-201ENST00000556877 366 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 AC010333.1-201ENST00000563116 563 ntTSL 4 BASIC9.19□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 LINC01894-201ENST00000580984 487 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 LINC00347-205ENST00000597518 868 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 BCRP9-201ENST00000605312 388 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 U1.22-201ENST00000605806 164 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
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