Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 AC008280.3-201ENST00000606436 732 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 AL136131.3-201ENST00000607600 188 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 PLCE1-AS2-211ENST00000613585 542 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 MIR4509-1-201ENST00000618224 94 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 HNF1A-AS1-205ENST00000619441 343 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 SYNJ2BP-COX16-205ENST00000621525 929 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 AC023510.2-201ENST00000622162 746 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 OR4G3P-201ENST00000633500 913 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 U6.107-201ENST00000637108 79 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 C3orf35-203ENST00000425564 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 SATB1-209ENST00000454909 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 RXFP1-211ENST00000613319 3771 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 ALG10B-201ENST00000308742 10253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 BACH1-202ENST00000399921 5769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 NAPEPLD-203ENST00000417955 4988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 ZNF571-202ENST00000358744 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 GBP1-201ENST00000370473 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 IFRD1-217ENST00000621379 3232 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 RNF6P1-201ENST00000444889 1784 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 ZNF546-201ENST00000347077 7987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 ZNF254-208ENST00000616028 3886 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 POT1-202ENST00000393329 3950 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 C8orf4-201ENST00000315792 1854 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 OPRM1-219ENST00000522555 2440 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 PTPRC-209ENST00000442510 5164 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 SNX13-213ENST00000611725 6817 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 SLC12A6-204ENST00000397707 4194 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 LINC00707-201ENST00000436383 3070 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 DSC2-202ENST00000280904 12325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 RFX4-201ENST00000229387 3378 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 PPP1R1C-201ENST00000280295 1636 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 AL358975.1-203ENST00000413352 2932 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 BRIP1-202ENST00000577598 3969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 SREK1IP1-204ENST00000513458 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 CASC11-201ENST00000502463 3301 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 NEK11-207ENST00000508196 1938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 WDR64-201ENST00000366552 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 RNU1-150P-201ENST00000362491 162 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 ECHDC1-202ENST00000368289 909 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 TOMM7-203ENST00000405021 455 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 AL096800.1-201ENST00000405326 893 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 FIGN-202ENST00000409634 746 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 VN1R51P-201ENST00000411675 945 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 AL031674.1-202ENST00000413070 465 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 AC092687.1-201ENST00000418835 389 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 BX284632.2-201ENST00000421091 399 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 RPS3P2-201ENST00000421346 701 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 ZNF736P7Y-201ENST00000425158 820 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 NAP1L4P2-201ENST00000425958 899 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 AL590867.3-201ENST00000436953 438 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 CBX1P4-201ENST00000439415 457 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 AC000041.1-201ENST00000439655 175 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 AL512605.1-202ENST00000441919 381 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 AF130359.1-201ENST00000444868 438 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 AC073109.1-201ENST00000445066 978 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 AL359955.2-201ENST00000445380 353 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 LINC01911-201ENST00000450667 806 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 RPL7AP10-201ENST00000481016 791 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 AC112206.2-204ENST00000504068 793 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 SNHG27-202ENST00000507933 491 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 LINC02200-202ENST00000508879 615 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 AC008565.1-201ENST00000509046 885 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 LINC02353-201ENST00000515181 849 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 LINC02055-205ENST00000521090 774 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 ANAPC15-205ENST00000535503 734 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 AC016987.1-201ENST00000558587 499 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 AC048382.2-201ENST00000560239 492 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 ZNF971P-201ENST00000562068 1249 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 CYP2C60P-201ENST00000566088 139 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 AC130371.1-201ENST00000577023 230 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 AC007639.1-201ENST00000577281 833 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 AC119403.2-201ENST00000590960 598 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 AL161896.1-201ENST00000597248 508 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 DARS-AS1-217ENST00000599279 544 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 AL606834.3-201ENST00000602615 496 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 AC023762.1-201ENST00000603280 584 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 AC073387.2-201ENST00000604797 784 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 AC093673.2-201ENST00000609674 331 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 DLG2-AS1_1.1-201ENST00000622319 213 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 LINC01955-201ENST00000626392 792 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 LGI1-209ENST00000627699 664 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 ATP2C1-203ENST00000422190 3386 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 CD226-201ENST00000280200 12319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 FMN1-212ENST00000616417 13529 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 MRRFP1-201ENST00000435941 1675 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 AC109811.1-201ENST00000512833 2807 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 SCN1A-217ENST00000637988 8562 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 ARHGAP28-205ENST00000531294 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 DDAH1-204ENST00000535924 3909 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 CALN1-203ENST00000395276 9189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 BIRC3-207ENST00000615299 4342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 LINGO2-204ENST00000613945 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 OR5AS1-202ENST00000641320 7860 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 PTBP3-202ENST00000334318 7990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 RBMS2-201ENST00000262031 8382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 PIK3C2A-201ENST00000265970 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 IKZF2-210ENST00000451136 9344 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 AC009313.2-201ENST00000417893 1941 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 AC012254.3-201ENST00000591183 2117 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 KCNT2-203ENST00000451324 3146 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.7 ms