Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 AC080013.3-201ENST00000606839 578 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 ELSPBP1-206ENST00000619003 893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02033-201ENST00000623207 971 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 AC093875.1-201ENST00000623688 504 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 USP45-204ENST00000369233 2514 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 PDE1A-204ENST00000410103 2000 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 CLMN-201ENST00000298912 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 AL513550.1-201ENST00000418945 1638 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 FAM205BP-203ENST00000455647 3752 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 ADGRF1-203ENST00000371253 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 PTK2-206ENST00000517712 3351 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 PLCH1-202ENST00000340059 6168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 RABGAP1L-206ENST00000367688 1425 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 CDKAL1-201ENST00000274695 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 AC079753.1-201ENST00000623243 3868 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 HYDIN-201ENST00000288168 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 PRH2-201ENST00000381847 641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 GAPDHP15-201ENST00000398586 975 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 NT5C3A-206ENST00000409787 840 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 AC003975.1-201ENST00000411856 837 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 RPL22P18-201ENST00000417197 377 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 NIFKP3-201ENST00000417799 865 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 RPS3P2-201ENST00000421346 701 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 AC010099.3-201ENST00000423896 409 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 AC104170.2-201ENST00000424246 678 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 RNF19BPX-201ENST00000426224 625 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 GNGT1-203ENST00000429473 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 USP9YP14-201ENST00000430663 563 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 AL451136.1-201ENST00000435399 325 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 AL353751.1-203ENST00000437032 603 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 AL035258.1-201ENST00000439450 439 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 Z93403.1-202ENST00000440002 713 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 BMS1P22-202ENST00000440946 1160 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 MTCYBP21-201ENST00000443300 1113 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 TRIM60P16-201ENST00000444048 694 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 OR13K1P-201ENST00000444577 975 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 AL157400.3-201ENST00000449882 1298 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 ART2BP-201ENST00000453501 499 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 HLA-DPA3-207ENST00000454398 229 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 CST12P-201ENST00000457644 362 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 MLF1-205ENST00000469452 1098 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 PRDX3P4-201ENST00000470828 747 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 AC007370.1-201ENST00000503163 316 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 AC104803.1-201ENST00000506917 529 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 AC093297.2-205ENST00000508123 572 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 AC112518.2-201ENST00000508565 425 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 OCIAD1-216ENST00000509122 1204 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 AC010343.3-202ENST00000510327 619 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 AC006499.4-201ENST00000510947 694 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 AC010260.1-201ENST00000511484 664 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 AC060775.1-201ENST00000518241 520 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 AC103726.2-201ENST00000523318 411 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 RSF1-IT2-201ENST00000529656 566 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 AP000857.2-201ENST00000532123 419 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 AC112693.1-201ENST00000555297 682 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 AC020891.3-201ENST00000560011 363 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 AC004381.1-201ENST00000565498 351 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 AC009852.2-201ENST00000567898 485 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 MMP2-AS1-202ENST00000569037 553 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 AC027281.1-201ENST00000574178 758 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 AC090236.2-201ENST00000587933 1101 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 AC021171.1-201ENST00000603137 706 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 OR7A19P-201ENST00000608051 733 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 AC093388.1-201ENST00000609166 430 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 AC096708.4-201ENST00000620563 552 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 SNX18P12-201ENST00000624821 759 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 AC004160.1-201ENST00000625468 929 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 AL589740.1-205ENST00000635561 565 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 WDPCP-202ENST00000398544 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 CLVS1-201ENST00000325897 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 AP001541.1-201ENST00000623322 1904 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 HYKK-206ENST00000569878 4097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 ANO3-202ENST00000525139 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 OR52A5-201ENST00000307388 3973 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 OR52A5-202ENST00000642125 3993 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00326-202ENST00000457339 2515 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 SSH2-201ENST00000269033 9327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 MOCS2-201ENST00000361377 3568 ntTSL 4 BASIC6.36□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 THAP6-201ENST00000311638 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 AC104024.1-201ENST00000428142 2201 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 RLIMP2-201ENST00000427891 1563 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 NOS1-201ENST00000317775 12158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 RUBCNL-205ENST00000389908 3956 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 MRE11-204ENST00000407439 2684 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 CFAP70-202ENST00000340329 1403 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 AC119674.1-213ENST00000641177 1386 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF436-201ENST00000314011 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 CR1-201ENST00000367049 7470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 KIAA1328-201ENST00000280020 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 SPINK14-201ENST00000356972 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 MIR16-2-201ENST00000362117 81 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 AL353625.1-202ENST00000366273 571 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 OR2W1-201ENST00000377175 1028 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 IGLV5-48-201ENST00000390293 369 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 SYCP3-202ENST00000392924 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 RPL5P19-201ENST00000404228 893 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 AL355615.1-201ENST00000406187 641 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 RNU4-27P-201ENST00000410889 139 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 AL158840.1-201ENST00000414132 523 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 AL136131.2-201ENST00000424283 348 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88 ms