Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 AL391840.1-201ENST00000571144 367 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 MIR3913-1-201ENST00000577744 102 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 MIR5095-201ENST00000578844 88 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 AC008752.3-201ENST00000588113 712 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 AC105094.2-203ENST00000590357 555 ntTSL 4 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 ZNF675-202ENST00000596211 581 ntTSL 4 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 AC104184.1-201ENST00000607513 721 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 STARD13-AS-232ENST00000609137 882 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 GLYATL1-219ENST00000612196 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 AC011472.4-201ENST00000615848 491 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 116 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 AC009159.1-201ENST00000618386 642 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 EFCAB8-204ENST00000618684 435 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 AC073862.4-201ENST00000622982 854 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 AP003122.6-201ENST00000623831 495 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 AJ009632.2-209ENST00000634853 933 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 MIR6863-201ENST00000636112 90 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 AC012078.1-201ENST00000405035 1646 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 TTC6-202ENST00000382320 1972 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 SPINK5-203ENST00000398454 2915 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 INPP5F-208ENST00000637174 3168 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 ITGA1-201ENST00000282588 10757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 ZNF600-201ENST00000338230 3829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 C2orf66-201ENST00000342506 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 DNA2-208ENST00000551118 3468 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 CDON-202ENST00000392693 9138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 HMGN2P46-204ENST00000409454 1923 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 EOGT-208ENST00000540764 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 BEST3-202ENST00000330891 3532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 BNC1-202ENST00000569704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 KLHL2-202ENST00000421009 2452 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 KCNRG-202ENST00000360473 1623 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 PTPRZ1-202ENST00000449182 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 MEPE-208ENST00000540395 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 LUZP1-203ENST00000418342 8421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 OR5A2-201ENST00000302040 6318 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 HHLA2-201ENST00000357759 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 KRTAP15-1-201ENST00000334067 671 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 MXI1-204ENST00000369612 879 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 MTCO3P40-201ENST00000392516 676 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 RPL5P20-201ENST00000403848 896 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
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PHACTR1Q9C0D0 AC090617.1-201ENST00000413674 323 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 RPL21P111-201ENST00000418453 477 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 CD33-203ENST00000421133 1023 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
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PHACTR1Q9C0D0 ELOCP7-201ENST00000439968 331 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 CYP2C56P-201ENST00000440076 291 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
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PHACTR1Q9C0D0 RN7SL42P-201ENST00000579786 294 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 RN7SL667P-201ENST00000582817 298 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
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PHACTR1Q9C0D0 MIR7515HG-243ENST00000591400 1067 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 AC063944.1-210ENST00000593837 519 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 PRR13P5-201ENST00000596581 442 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 AC008395.1-201ENST00000601752 607 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
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PHACTR1Q9C0D0 CYCSP1-201ENST00000604815 315 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 AL352984.2-201ENST00000611153 546 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
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PHACTR1Q9C0D0 AC018692.2-201ENST00000624130 348 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 AC024614.3-201ENST00000637860 256 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 RPL37-201ENST00000274242 7686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 MTRF1-203ENST00000379480 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 CNOT4-206ENST00000428680 4642 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 EOGT-201ENST00000295571 4138 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 RBMXL1-201ENST00000321792 4799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 FOXJ3-209ENST00000545068 5165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 USP37-201ENST00000258399 8032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PHACTR1Q9C0D0 HSFY2-201ENST00000304790 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
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