Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 HEATR1-203ENST00000366582 8447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PUM3Q15397 DGKB-203ENST00000403951 6917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PUM3Q15397 NRCAM-202ENST00000379022 3900 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PUM3Q15397 LEPROT-206ENST00000613538 4625 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PUM3Q15397 ZNF189-201ENST00000259395 3115 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PUM3Q15397 GTDC1-203ENST00000392867 2408 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PUM3Q15397 GSTCD-202ENST00000394728 2416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PUM3Q15397 FAM26D-201ENST00000368596 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PUM3Q15397 ZNF23-207ENST00000564528 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PUM3Q15397 RPL23P2-201ENST00000320371 421 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PUM3Q15397 MIR137-201ENST00000385223 102 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PUM3Q15397 RNA5SP105-201ENST00000391123 113 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PUM3Q15397 CCNB2P1-201ENST00000399411 1150 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PUM3Q15397 DUTP5-201ENST00000406790 469 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PUM3Q15397 RPL23AP27-201ENST00000415161 451 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PUM3Q15397 GLUD1P9-201ENST00000420997 1173 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PUM3Q15397 AC007394.1-201ENST00000421941 531 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PUM3Q15397 AL359853.3-201ENST00000423879 544 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PUM3Q15397 AL390879.2-203ENST00000426943 1121 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PUM3Q15397 AC090505.2-201ENST00000427064 464 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PUM3Q15397 MIR99AHG-205ENST00000435697 716 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PUM3Q15397 AL389915.2-201ENST00000454576 441 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PUM3Q15397 AC104629.2-201ENST00000468627 598 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PUM3Q15397 RPL32P9-201ENST00000487963 407 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PUM3Q15397 AC016651.1-201ENST00000502680 822 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PUM3Q15397 AC097515.1-202ENST00000511818 371 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PUM3Q15397 RNA5SP116-201ENST00000516132 98 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PUM3Q15397 SNORA26.10-201ENST00000516427 141 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PUM3Q15397 RNA5SP373-201ENST00000517271 95 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PUM3Q15397 SUMO2P19-201ENST00000518920 295 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PUM3Q15397 RPL26L1-203ENST00000519239 679 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PUM3Q15397 LINC01493-201ENST00000530102 460 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PUM3Q15397 YWHABP2-201ENST00000540201 713 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PUM3Q15397 OR11J2P-201ENST00000555298 907 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PUM3Q15397 AC127381.1-201ENST00000555979 939 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PUM3Q15397 AC109460.2-201ENST00000569974 544 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PUM3Q15397 TMF1P1-201ENST00000576058 373 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PUM3Q15397 AC010511.1-202ENST00000590229 573 ntTSL 4 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PUM3Q15397 MIMT1-201ENST00000597105 1050 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PUM3Q15397 OR4H6P-202ENST00000603819 340 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PUM3Q15397 AL133445.2-201ENST00000611191 527 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PUM3Q15397 RPSAP73-201ENST00000614820 330 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PUM3Q15397 CHD2-202ENST00000420239 2221 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PUM3Q15397 ZNF733P-202ENST00000444809 1573 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PUM3Q15397 CFAP47-202ENST00000313548 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PUM3Q15397 CALN1-203ENST00000395276 9189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PUM3Q15397 STMN2-201ENST00000220876 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 LRRC37A3-204ENST00000400877 3273 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 MGAM2-201ENST00000477922 7867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 ARHGAP24-201ENST00000264343 4572 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 LINC01684-203ENST00000453784 2908 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 AL359715.3-201ENST00000569267 2123 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 TAF9-205ENST00000506736 1331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 RNMT-201ENST00000262173 6051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 AC004784.1-201ENST00000635495 1833 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 ZNF19-206ENST00000565100 2087 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 LINC01478-201ENST00000587877 2068 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 DOPEY1-201ENST00000237163 7995 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 FNIP1-202ENST00000307968 6388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 RNU1-43P-201ENST00000365052 165 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 AC016769.2-201ENST00000414815 475 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 DPP10-AS3-201ENST00000417844 665 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 AL132796.1-201ENST00000421617 479 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 MORF4L2-205ENST00000423833 717 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 HNRNPA3P4-201ENST00000427514 803 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 LINC01798-203ENST00000428590 553 ntTSL 4 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 MKLN1-204ENST00000429546 572 ntTSL 4 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 AL355357.1-201ENST00000433531 417 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 LINC00969-211ENST00000438608 525 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 LINC01941-201ENST00000455174 624 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 snoU13.29-201ENST00000459370 104 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 AC055758.1-201ENST00000494509 569 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 AC010245.1-201ENST00000511329 754 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 AC091912.1-201ENST00000511351 248 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 AC093535.1-203ENST00000512500 730 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 ARL6IP1P3-201ENST00000524544 560 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 SNHG1-204ENST00000537068 629 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 HMGN2P6-201ENST00000551091 273 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 ETFRF1-211ENST00000557540 1259 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 AC055855.3-201ENST00000564269 578 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 AC046158.2-201ENST00000568764 707 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 AC090617.5-201ENST00000571815 528 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 AC016839.1-201ENST00000578162 867 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 ABHD15-AS1-201ENST00000581474 187 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 ADAD1P2-201ENST00000588476 646 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 Z98949.1-204ENST00000595102 731 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 AC008555.3-201ENST00000603717 442 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 IGLCOR22-2-201ENST00000605398 313 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 AC037198.3-201ENST00000616754 526 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 RMST_5.1-201ENST00000618704 126 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 AL133370.2-201ENST00000619934 439 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 AC080188.3-201ENST00000624842 748 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 AC006453.5-201ENST00000636451 619 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 CYP3A43-201ENST00000222382 1515 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 CCAT2-201ENST00000630920 1752 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 SLC12A6-216ENST00000560164 3744 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 TRAPPC6B-201ENST00000330149 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 TOX3-202ENST00000407228 3124 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 PNISR-202ENST00000438806 3142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 GTDC1-204ENST00000392869 10514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.9 ms