Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 EPHA7-201ENST00000369297 1885 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 AC107419.1-201ENST00000422048 1879 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 ADGRF2-204ENST00000507065 3043 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 FGFR1OP-202ENST00000366847 14166 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 SORBS1-208ENST00000371241 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 PSG5-202ENST00000366175 1766 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 LINC01222-201ENST00000427439 1785 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 AC066616.2-201ENST00000559334 1481 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 RTL3-201ENST00000321110 2648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 REG1CP-201ENST00000377435 1705 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 LINC01924-201ENST00000589376 1722 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 ZNF260-202ENST00000523638 5666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 CTXN3-201ENST00000379445 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 HSD17B4-220ENST00000513628 2225 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 MTND5P1-201ENST00000445440 1375 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 KIT-201ENST00000288135 5186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 ZNF610-208ENST00000613461 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 AL109811.1-201ENST00000452378 2682 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 AGL-201ENST00000294724 7446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 AC242022.1-201ENST00000638002 1565 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 ADGRG7-201ENST00000273352 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 AC107884.1-207ENST00000504206 4433 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 DOCK2-211ENST00000520908 4654 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 HDAC9-218ENST00000456174 2307 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 AL139352.1-201ENST00000255183 1001 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 RBMX2P2-201ENST00000257020 946 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 OR1A2-201ENST00000381951 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 C6orf48-208ENST00000395788 815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 OR2H1-204ENST00000396792 1294 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 TOMM6-202ENST00000398884 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 RN7SKP32-201ENST00000410167 303 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 VAV3-203ENST00000415432 1293 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 AC005162.1-201ENST00000416513 389 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 BOLA3P4-201ENST00000418151 400 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 AL132796.1-201ENST00000421617 479 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 TEX41-204ENST00000423031 491 ntTSL 4 BASIC7.09□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 LINC01980-202ENST00000425195 491 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 RPL35AP12-201ENST00000425362 338 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 AC017002.2-201ENST00000426124 792 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 AL445669.1-201ENST00000426743 755 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 RPS27AP6-201ENST00000427962 448 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 AL158212.1-201ENST00000428766 315 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 RPL35P8-201ENST00000433284 337 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 AC024082.2-201ENST00000434771 238 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 AC010235.1-201ENST00000450613 547 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 AL591504.1-201ENST00000450681 414 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 AC005517.1-201ENST00000452091 489 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 AL512328.1-202ENST00000452640 850 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
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CLN3Q13286 POU5F1P7-201ENST00000508759 541 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 RN7SKP13-201ENST00000515933 244 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 Y_RNA.672-201ENST00000516289 104 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 RNU7-30P-201ENST00000516835 62 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 LINC00589-202ENST00000518623 938 ntTSL 4 BASIC7.09□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 AC100802.1-201ENST00000519197 1026 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 AF117829.1-202ENST00000524166 836 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
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CLN3Q13286 COX6CP16-201ENST00000603667 216 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 AC097468.3-201ENST00000607956 456 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 CERS6-AS1-209ENST00000609766 642 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 DLEU1_2.1-201ENST00000617920 342 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 LINC01955-201ENST00000626392 792 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 AC026108.1-201ENST00000635444 547 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 AP4S1-211ENST00000616371 4595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 B3GALT5-202ENST00000380618 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 NMD3-201ENST00000351193 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 ZC3H13-201ENST00000242848 8018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 INO80C-212ENST00000592173 3245 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 AF131215.2-201ENST00000531549 1710 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 AL355974.1-201ENST00000618896 1708 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 FSTL5-203ENST00000427802 2920 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 AC104964.2-201ENST00000562242 4641 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 LINC02209-201ENST00000521245 2651 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 CD46-205ENST00000358170 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 HNRNPA1P54-201ENST00000411857 9714 ntBASIC7.09□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 ZNF268-213ENST00000542986 3773 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 POTEH-AS1-201ENST00000422014 2566 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 ATP2B4-201ENST00000341360 4658 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 OR2G6-203ENST00000641804 6084 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 AC079178.2-201ENST00000439323 1624 ntBASIC7.09□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 LINC00836-202ENST00000626230 1640 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 ERICH3-202ENST00000420661 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 MATR3-232ENST00000502929 4373 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 GALK2-201ENST00000327171 5299 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 CASC19-221ENST00000641309 1382 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 KIAA0232-202ENST00000425103 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 AC023055.1-201ENST00000546837 1807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 TENM4-201ENST00000278550 14000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 AL353052.2-201ENST00000441459 2241 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 OR2T11-202ENST00000641193 3770 ntAPPRIS P1 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 AC108099.1-201ENST00000564402 3258 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 CCL16-205ENST00000611905 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 NAT1-206ENST00000518029 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 LIMA1-216ENST00000552909 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
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