Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 AC233702.1-201ENST00000482905 502 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 AC008443.2-201ENST00000499096 566 ntTSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 AC110794.1-201ENST00000505816 425 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 AC092834.1-201ENST00000506514 442 ntTSL 3 BASIC9.22□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 ST13P6-201ENST00000522430 1102 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 AC087277.1-201ENST00000529910 535 ntTSL 3 BASIC9.22□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 OR5B10P-201ENST00000532869 642 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 AP000781.1-201ENST00000534162 311 ntTSL 3 BASIC9.22□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 AC022509.1-203ENST00000541940 708 ntTSL 4 BASIC9.22□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 FAM30C-201ENST00000561158 410 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 AC010542.1-201ENST00000568430 555 ntTSL 4 BASIC9.22□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 MIR3137-201ENST00000577367 75 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 AC005324.5-201ENST00000584540 571 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 TPMTP1-201ENST00000592307 737 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 AL133338.2-201ENST00000604292 736 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 AL445465.1-206ENST00000609544 528 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 AL512504.2-201ENST00000445455 1909 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 CSNK1G3-210ENST00000521364 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 CEP57-207ENST00000537677 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 SMARCA1-203ENST00000371123 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 ZNF385B-201ENST00000336917 2610 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 AC044839.1-206ENST00000635559 1324 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 ZNF605-202ENST00000360187 9340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 HGD-201ENST00000283871 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 CYP2C8-211ENST00000539050 2024 ntTSL 3 BASIC9.22□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 MICAL2-202ENST00000342902 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 TDRD9-201ENST00000339063 3447 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 RRM2-213ENST00000641198 3431 ntAPPRIS P1 BASIC9.22□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 GALNT3-202ENST00000409882 2107 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 APOL3-202ENST00000361710 3563 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 NECAP1-210ENST00000638237 2517 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 SEL1L3-201ENST00000264868 4369 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 BTN3A2-203ENST00000396934 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 AL355103.1-201ENST00000557246 2226 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 MET-204ENST00000436117 2295 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
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MKRN3Q13064 TPPP2-201ENST00000321760 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
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MKRN3Q13064 OR2L1P-202ENST00000641567 1023 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 TRIM6-203ENST00000380107 2590 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 ZNF484-203ENST00000395505 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 RGS21-201ENST00000417209 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 IL1R1-208ENST00000424272 2658 ntTSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 GCNT3-201ENST00000396065 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 RAD21L1-203ENST00000409241 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
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MKRN3Q13064 TDP1-201ENST00000335725 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
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MKRN3Q13064 TREML2-201ENST00000483722 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 CEBPG-202ENST00000585933 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 NRG3-204ENST00000404576 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 ZNF540-202ENST00000343599 3073 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 TPTE2-203ENST00000390680 1558 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
MKRN3Q13064 ZNF383-208ENST00000590503 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
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