Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 AGBL4-204ENST00000371839 2947 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 SNORA10B-201ENST00000384458 133 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 RNU6-456P-201ENST00000384493 107 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 ATP5E-203ENST00000395663 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 BX284668.3-201ENST00000414128 882 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 AL356968.1-201ENST00000416622 474 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 TXNDC8-204ENST00000423740 356 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 ZDHHC20P1-204ENST00000435787 423 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 AL139161.2-201ENST00000438371 740 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 AL121908.1-201ENST00000443055 668 ntTSL 4 BASIC7.31□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 AC008080.2-201ENST00000455149 577 ntTSL 4 BASIC7.31□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 BTF3P5-201ENST00000457252 467 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 RPS3P7-201ENST00000488662 726 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 CD86-209ENST00000493101 1572 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 AC008040.4-201ENST00000494834 768 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 AC092834.1-201ENST00000506514 442 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 AC095059.2-201ENST00000510601 933 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 COX6B1P4-201ENST00000519826 484 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 RANP9-201ENST00000519957 271 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 AC011333.1-201ENST00000520587 436 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 SGK1-223ENST00000528577 1850 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 CTNND1-220ENST00000529526 6099 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 AC140847.1-201ENST00000538025 534 ntTSL 4 BASIC7.31□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 AC010287.1-201ENST00000566916 357 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 AC004494.1-202ENST00000573820 480 ntTSL 4 BASIC7.31□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 LINC01894-201ENST00000580984 487 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 AC090844.2-203ENST00000582263 632 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 AC110743.1-201ENST00000584870 478 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 AC009271.1-202ENST00000588803 492 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 AC063944.1-210ENST00000593837 519 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 MIR663AHG-213ENST00000596767 837 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 ANKRD20A19P-203ENST00000602724 295 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 RACK1-235ENST00000626067 564 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 HM13-224ENST00000498035 3932 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 ZNF169-203ENST00000480716 2716 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 LMLN-202ENST00000332636 1812 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 RAD51B-211ENST00000487861 1673 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 SERPINA9-205ENST00000448305 1520 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 TTC23-203ENST00000394132 3849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 AC013444.1-201ENST00000428909 1904 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 MRPS23-201ENST00000313608 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 ZNF827-203ENST00000508784 7463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 CKAP2-203ENST00000378037 3629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 MTA3-201ENST00000405094 1785 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 HCG18-242ENST00000602319 3342 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 IGSF11-AS1-201ENST00000477009 1604 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 NFRKB-203ENST00000524794 4351 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 TRAPPC3L-201ENST00000356128 2421 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
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FOXC1Q12948 DNTT-202ENST00000630152 1954 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 EPHA4-201ENST00000281821 6346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 SLC38A9-201ENST00000318672 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
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FOXC1Q12948 HELQ-201ENST00000295488 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
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FOXC1Q12948 UGT1A6-203ENST00000406651 785 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 MAST4-207ENST00000407621 559 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
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FOXC1Q12948 AL451164.1-201ENST00000417149 390 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
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FOXC1Q12948 LINC00395-202ENST00000451570 415 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 MRPS31P2-201ENST00000451581 518 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 AL133351.1-201ENST00000456189 417 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 RN7SL149P-201ENST00000465197 281 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 AC092324.1-201ENST00000468671 324 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 GPX5-203ENST00000469384 428 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 RPS16P9-201ENST00000477220 427 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 AC233702.1-201ENST00000482905 502 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 LINC02377-201ENST00000500169 450 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
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FOXC1Q12948 Vault.3-201ENST00000516676 95 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 OR4A7P-201ENST00000531463 910 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 OR52E8-201ENST00000537935 1061 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 AC073571.1-201ENST00000549103 475 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 AC124068.1-201ENST00000563131 678 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 RAB27A-205ENST00000564609 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
FOXC1Q12948 AC026464.1-202ENST00000564737 722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
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