Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 RNU6-420P-201ENST00000458780 107 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 AL049650.1-201ENST00000461548 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 RN7SL251P-201ENST00000464175 297 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 AC090638.1-201ENST00000498296 909 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 AC099520.1-202ENST00000503650 777 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 AC008629.1-202ENST00000504820 525 ntTSL 4 BASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 AC139783.2-201ENST00000504847 1145 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 CSN1S1-202ENST00000505782 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 AC092834.1-201ENST00000506514 442 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 CSN1S1-204ENST00000507772 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 GBA3-203ENST00000508166 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 AC087241.1-201ENST00000508615 429 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 SEPT14P4-201ENST00000513445 186 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 RNU6-885P-201ENST00000516607 104 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 AP003354.2-201ENST00000517983 563 ntTSL 4 BASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 AC011333.1-201ENST00000520587 436 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 FO082796.1-201ENST00000523795 183 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 NPIPB11-201ENST00000524087 3653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 AF117829.1-202ENST00000524166 836 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 OR5D2P-201ENST00000524390 911 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 LINC01493-202ENST00000533575 581 ntTSL 4 BASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 C16orf62-224ENST00000567245 573 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 FOPNL-205ENST00000573429 646 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 AC010928.1-201ENST00000592477 1447 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 AC074135.1-202ENST00000600223 563 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 LINC01440-210ENST00000629744 541 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 AMD1-204ENST00000368885 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 ZNF195-203ENST00000343338 3145 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 CDH18-203ENST00000502796 2386 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 AC106799.3-201ENST00000562127 3300 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 AC092162.3-201ENST00000624511 1624 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 AMPD3-209ENST00000529507 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 VPS8-210ENST00000446204 4721 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 TUBD1-214ENST00000592426 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 LIN7C-202ENST00000524596 4290 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 KLHL32-202ENST00000369261 3698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 NOX1-202ENST00000372960 2418 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 LRFN5-203ENST00000554120 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 CCDC30-202ENST00000342022 3098 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 PPFIA2-202ENST00000407050 3903 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 PARP9-205ENST00000477522 3128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 MAMDC2-AS1-201ENST00000377178 1504 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 AC011369.1-201ENST00000517408 2181 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 MRE11-201ENST00000323929 6897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 KCNMA1-212ENST00000406533 5639 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 IKZF3-213ENST00000439167 1879 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 SLC7A14-201ENST00000231706 10103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 ZNF880-202ENST00000422689 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 AL355103.1-201ENST00000557246 2226 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 HIPK1-211ENST00000626993 8016 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 SREK1-203ENST00000380918 2433 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 MAVS-202ENST00000428216 11714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 OR4M1-201ENST00000315957 1116 ntAPPRIS P1 BASIC7.98□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 U8.3-201ENST00000363321 132 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 Y_RNA.422-201ENST00000384054 114 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 FAUP2-201ENST00000394301 401 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 SNRPD3-202ENST00000402849 567 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 AL354719.1-201ENST00000406535 843 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 OR4K12P-201ENST00000406538 961 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 TEX41-204ENST00000423031 491 ntTSL 4 BASIC7.98□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 AC013402.2-201ENST00000424257 437 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 PCBP2P1-201ENST00000437262 977 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 RPL7P54-201ENST00000438336 674 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 AC079781.1-201ENST00000441505 394 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 AL157882.1-201ENST00000447148 429 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 RPL31P44-201ENST00000447680 377 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 LINC01344-202ENST00000449842 571 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 AC009244.1-201ENST00000450566 258 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 SRP68P2-201ENST00000456184 254 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 RN7SL392P-201ENST00000473024 299 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 RPL36AP51-201ENST00000487216 318 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 RAB7A-208ENST00000493186 329 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 RPL10P7-201ENST00000495649 625 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 AC008443.2-201ENST00000499096 566 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 AC112204.1-201ENST00000502591 103 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 AL158068.2-201ENST00000510632 563 ntTSL 4 BASIC7.98□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 SNORA81.2-201ENST00000516868 170 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 AC103957.1-201ENST00000517681 503 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 LGALS8-217ENST00000525042 903 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 AL121594.2-201ENST00000541658 472 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 AC006581.1-201ENST00000545706 496 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 MYL6-211ENST00000548580 528 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 AC023310.2-201ENST00000553844 547 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 LINC01904-201ENST00000564872 861 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 PWRN1-205ENST00000565295 465 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 ZNF174-204ENST00000572544 1002 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 AC007861.1-201ENST00000576671 674 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 AC019131.1-201ENST00000583654 622 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 AC092960.1-201ENST00000604762 351 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 BPIFA4P-204ENST00000605211 656 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 AL133215.3-201ENST00000609801 448 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 AL031777.2-201ENST00000611953 196 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 HOTTIP_2.1-201ENST00000616633 376 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 AL355974.3-201ENST00000617383 467 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 DLEU1_2.1-201ENST00000617920 342 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 ALKAL2-208ENST00000619265 496 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 AC078909.2-201ENST00000620584 398 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 RMST_7.1-201ENST00000621935 268 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
HOXA2O43364 AC211433.3-201ENST00000623770 375 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 140.7 ms