Protein–RNA interactions for Protein: O00287

RFXAP, Regulatory factor X-associated protein, humanhuman

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Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFXAPO00287 AC092691.2-201ENST00000461787 803 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 RN7SL269P-201ENST00000467795 305 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 CBX1P5-201ENST00000475330 559 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 AC231760.1-201ENST00000498002 260 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 AC078788.1-201ENST00000498457 634 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 EDNRA-204ENST00000506066 1032 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 LINC02364-201ENST00000514802 687 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 OR7E10P-201ENST00000526420 991 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 APPL2-203ENST00000546731 684 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 AL163973.2-201ENST00000548096 288 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 AL133370.1-201ENST00000554679 537 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 SERPINE4P-201ENST00000554978 281 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 AC023813.2-201ENST00000564321 469 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 AC007431.2-201ENST00000577189 563 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 SNORA59B-202ENST00000578183 701 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 AC015802.2-201ENST00000589690 189 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 OR7A1P-201ENST00000601206 970 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 AP002906.1-201ENST00000603405 233 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 AL645933.2-201ENST00000606743 1207 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 ACYP2-208ENST00000606865 674 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 AC012409.3-201ENST00000611343 981 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 AC073114.1-201ENST00000612027 490 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 ZNF248-209ENST00000615949 518 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 U6atac.1-201ENST00000616025 117 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 AC037198.3-201ENST00000616754 526 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 AC005972.4-201ENST00000636248 1131 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 NCKAP5-203ENST00000405974 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 PDE1A-204ENST00000410103 2000 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 ZNF333-203ENST00000540689 3595 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 LARP7-210ENST00000509061 2332 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 AC001226.2-204ENST00000638101 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 IL1RAP-212ENST00000443369 2760 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 TMEM209-201ENST00000397622 3545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 QRSL1-202ENST00000369046 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 ANGPT1-205ENST00000520052 1523 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 CASC19-243ENST00000641588 1546 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 MRRFP1-201ENST00000435941 1675 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 CTNNA1P1-201ENST00000515849 2728 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 AL596244.1-201ENST00000567068 3779 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 ZNF836-201ENST00000322146 2811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 IFNG-AS1-202ENST00000538665 1791 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 CACNA1E-209ENST00000621551 14886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 DNAJC6-203ENST00000395325 5743 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 AC092821.3-202ENST00000641304 2767 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 NLGN4X-202ENST00000381092 3750 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 DNA2-208ENST00000551118 3468 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 PPP2R3A-201ENST00000264977 6795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 CLUL1-205ENST00000579494 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 VTCN1-202ENST00000359008 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 ZNF326-203ENST00000370447 9433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 PPHLN1-225ENST00000619544 1449 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 AC007744.1-201ENST00000607540 2289 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
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RFXAPO00287 OR6K2-201ENST00000359610 975 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 CRP-204ENST00000368112 787 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 KCNJ13-202ENST00000409779 1099 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
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RFXAPO00287 LINC01442-201ENST00000414201 704 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 BX284656.2-201ENST00000414483 498 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
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RFXAPO00287 LINC01661-201ENST00000415910 708 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
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RFXAPO00287 RPS24P1-201ENST00000438550 371 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 AL035443.1-202ENST00000442841 586 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 CYCSP51-201ENST00000443545 318 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 AL354793.1-201ENST00000446028 713 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
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RFXAPO00287 RPL7P45-201ENST00000455851 743 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
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RFXAPO00287 LINC02480-201ENST00000511875 612 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
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RFXAPO00287 OR9L1P-201ENST00000529493 933 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
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RFXAPO00287 FXNP1-201ENST00000555153 337 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 AC006530.1-201ENST00000555980 571 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 AC009145.2-201ENST00000562685 377 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 AL354943.1-201ENST00000572103 781 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 CCDC178-208ENST00000579916 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 AL035411.2-201ENST00000604022 421 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 AC024589.2-201ENST00000605642 1294 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 OR7M1P-201ENST00000608946 533 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 SCOC-AS1-203ENST00000609616 405 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 AL450489.1-201ENST00000612071 468 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 FRG1HP-204ENST00000617940 757 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 AC105105.2-201ENST00000590797 4521 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 DCDC2-201ENST00000378450 3684 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 GABRA3-204ENST00000535043 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 SMAD5-211ENST00000545279 7012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 XCL1-201ENST00000367818 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 ZNF91-202ENST00000397082 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
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