Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 GABRA1-215ENST00000636573 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 RGS1-201ENST00000367459 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 CD86-203ENST00000393627 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 CD200R1L-204ENST00000488794 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AC019072.1-201ENST00000604535 1551 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 KMT2D-201ENST00000301067 19419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 ANK3-201ENST00000280772 16874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 ZNF24-202ENST00000399061 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 SUCLG1-201ENST00000393868 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 LINC02153-202ENST00000522604 1644 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 DECR1-215ENST00000522161 1766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AC020656.2-201ENST00000613291 5309 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 TGIF1-208ENST00000472042 2214 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 PNISR-202ENST00000438806 3142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AC005005.4-201ENST00000623789 16698 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 TNRC6B-202ENST00000335727 17933 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 KIN-201ENST00000379562 6348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 SLC4A10-202ENST00000375514 5710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AC010127.1-209ENST00000447809 2305 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AMY1B-201ENST00000330330 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 C5orf64-203ENST00000505642 2970 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AP005435.3-201ENST00000531260 3198 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 STXBP4-203ENST00000405898 2229 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 OR10R3P-201ENST00000361688 942 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 ADPRM-201ENST00000379774 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 TRAJ25-201ENST00000390512 60 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 SYCP3-202ENST00000392924 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 LRRC37BP1-201ENST00000398851 714 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 GSTA12P-201ENST00000402398 508 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AL132875.1-201ENST00000403623 949 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 RPS27L-202ENST00000411926 528 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AL603962.1-201ENST00000413148 436 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 GAS5-202ENST00000414075 413 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AL449283.1-202ENST00000418249 604 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AF064858.3-201ENST00000419664 509 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AL121885.3-201ENST00000422833 115 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AL391832.1-201ENST00000423963 423 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AC073410.1-201ENST00000435125 589 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AC008269.1-201ENST00000438070 646 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 ZNF619P1-201ENST00000446539 752 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 FTLP8-201ENST00000446770 267 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 HMGB1P7-201ENST00000450921 612 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AC019084.1-201ENST00000457337 432 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 NAP1L1P3-201ENST00000462291 880 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 GCSAM-204ENST00000484193 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 LINC00518-204ENST00000491317 1228 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 TPT1P3-201ENST00000492841 512 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 LYRM4-208ENST00000500576 592 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AC114284.1-201ENST00000511422 1114 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AC008957.1-202ENST00000512329 681 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 RFESD-208ENST00000513950 464 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AP003354.2-201ENST00000517983 563 ntTSL 4 BASIC5.69□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AC078906.1-201ENST00000523602 798 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AC137590.1-201ENST00000542422 495 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AC091814.1-201ENST00000545258 719 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AC007346.1-201ENST00000569208 867 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 MTND3P13-201ENST00000574391 343 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 LINC01533-204ENST00000590719 435 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AC006115.2-201ENST00000596823 202 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 LINC01435-212ENST00000601212 742 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AL353811.1-201ENST00000602851 736 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AC073387.2-201ENST00000604797 784 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AP004372.1-201ENST00000604842 844 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AC092681.3-201ENST00000609463 678 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AC104836.2-201ENST00000609675 1293 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 C8orf89-201ENST00000613105 495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 Metazoa_SRP.38-201ENST00000615981 254 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AL589745.2-201ENST00000616366 555 ntTSL 4 BASIC5.69□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 RNA5SP439-201ENST00000617595 124 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 OR8H2-202ENST00000618136 1038 ntAPPRIS ALT1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 RMST_5.1-201ENST00000618704 126 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 MALAT1-214ENST00000618925 424 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AL512652.1-201ENST00000619006 500 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AL035461.2-201ENST00000619201 524 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AL161616.2-201ENST00000622001 565 ntTSL 4 BASIC5.69□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 OSER1-AS1-205ENST00000623343 827 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AC004943.3-201ENST00000624116 600 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 OR1S2-202ENST00000641683 941 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 TMEM161B-211ENST00000512429 1796 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 CALN1-204ENST00000405452 8571 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 RASGRP1-203ENST00000450598 2296 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 MYBPC1-207ENST00000545503 3569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 CPSF2-201ENST00000298875 13035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 TAX1BP1-203ENST00000409980 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 ZNF90P1-201ENST00000480493 1951 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 GRIA2-202ENST00000296526 5621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 TNFSF4-201ENST00000281834 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 PPARGC1A-201ENST00000264867 6318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 MYO5A-201ENST00000356338 11971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 CNTN1-208ENST00000551295 5557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AL353796.1-201ENST00000561542 3241 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 TMOD2-201ENST00000249700 9191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 ZNF559-201ENST00000317221 2732 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AC119674.1-202ENST00000641333 1860 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 RASSF8-213ENST00000542865 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AC016747.4-201ENST00000462959 1383 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 MTND4P8-201ENST00000514997 1362 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 LINC02421-201ENST00000542219 3135 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 SPARCL1-202ENST00000418378 2994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AF287957.1-201ENST00000607368 1595 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.3 ms