Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 CDY12P-201ENST00000440679 1015 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 CDY13P-201ENST00000445813 1015 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 CDY23P-201ENST00000451661 1014 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 UQCRHP4-201ENST00000471686 272 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 SLC9A9-AS2-201ENST00000490153 327 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 AL035078.3-201ENST00000525382 241 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 OR5M11-201ENST00000528616 1020 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 AP003557.1-202ENST00000528978 562 ntTSL 4 BASIC5.26□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 OR4A43P-201ENST00000532938 908 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 GABARAPL1-212ENST00000543602 653 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 ZNF85-201ENST00000300540 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 PCDH15-224ENST00000612394 5765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 NCLP2-201ENST00000416078 1462 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 HECTD4-202ENST00000377560 15759 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 MYO15A-217ENST00000615845 11860 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 MITF-203ENST00000328528 4680 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 PREPL-205ENST00000409411 4725 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 SPATA13-201ENST00000343003 6405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 TP53BP1-201ENST00000263801 6346 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 PCDH11X-202ENST00000361655 4126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 COPB2-205ENST00000507777 3034 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 OR2M7-201ENST00000317965 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 5S_rRNA.1-201ENST00000364415 116 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 DEFB115-201ENST00000400552 267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 RPS29P17-201ENST00000430795 166 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 SLC25A51P1-201ENST00000468432 871 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 AC104971.1-201ENST00000495117 578 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 LINC02408-202ENST00000538573 559 ntTSL 4 BASIC5.26□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 AC106782.4-201ENST00000568264 210 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 H3F3BP2-201ENST00000583907 357 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 CARD8-202ENST00000391898 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 ST8SIA3-201ENST00000324000 11833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 PHTF2-202ENST00000275575 4541 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 PTPRT-207ENST00000373201 12660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 FAM197Y8-201ENST00000426661 2340 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 FAM197Y6-202ENST00000442145 2340 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 ZNF484-204ENST00000395506 4031 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 AC104066.2-201ENST00000564513 1741 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 AC233968.1-201ENST00000611212 1300 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 KIAA1328-202ENST00000586135 1863 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 C17orf78-204ENST00000615133 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 SNORD56.6-201ENST00000384569 71 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 CRYBB2P1-203ENST00000415709 538 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 AC087380.1-202ENST00000415970 1163 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 AL390036.1-201ENST00000419428 734 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 FABP7P1-201ENST00000424004 391 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 AC108463.1-201ENST00000450258 347 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 LINC02339-201ENST00000472649 752 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 AC068633.1-202ENST00000476460 458 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 ZNF43-209ENST00000598288 560 ntTSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 TP63-201ENST00000264731 4909 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 ERVH48-1-201ENST00000447535 2790 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 TNS1-201ENST00000171887 10331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 LINS1-201ENST00000314742 4821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 PBRM1-206ENST00000409114 5015 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 SNORA62.3-201ENST00000365110 153 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 AC114814.2-201ENST00000419195 485 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 HSFY1P1-201ENST00000423928 1178 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 AC073410.1-201ENST00000435125 589 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 AL603839.1-201ENST00000453437 432 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 HMGB1P4-201ENST00000455362 567 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 RN7SL703P-201ENST00000578485 302 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 RN7SL176P-201ENST00000580352 264 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 AL121890.2-201ENST00000617644 465 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 NEK3-211ENST00000629912 141 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 AC092821.2-201ENST00000545710 2042 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 TMEM170B-201ENST00000379426 8362 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 FBXO25-204ENST00000382824 10386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 SLC38A1-211ENST00000612161 1607 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 EIF3E-206ENST00000519030 1324 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 MYBPC1-203ENST00000392934 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 KIF3A-203ENST00000403231 2181 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 GIGYF2-202ENST00000409196 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 HYALP1-201ENST00000417674 1279 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 SLC4A1APP1-201ENST00000419995 602 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 AC097523.2-201ENST00000435551 652 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 AC067852.5-201ENST00000589299 310 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 BRD8-202ENST00000254900 4388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 NAA25-201ENST00000261745 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 TUSC7-203ENST00000477539 2415 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 SLC26A7-208ENST00000523719 2902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 MARCH7-201ENST00000259050 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 ECM1P2-201ENST00000503354 1577 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 ZNF788-203ENST00000430298 3941 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 GLYATL1-201ENST00000300079 2068 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 STX3-208ENST00000641815 3236 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 BX323845.1-201ENST00000432417 179 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 VAV3-AS1-201ENST00000438318 619 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 AC008958.1-201ENST00000511047 682 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 AC092130.1-201ENST00000565531 531 ntTSL 4 BASIC5.24□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 RN7SL802P-201ENST00000577858 299 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 AC008770.4-201ENST00000586394 468 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 AL355376.2-201ENST00000603866 267 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 ADAMTS20-201ENST00000389420 6076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 TTC8-217ENST00000622513 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 TRPS1-201ENST00000220888 5480 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 DDX58-202ENST00000379883 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 STAP1-201ENST00000265404 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 AL442639.1-201ENST00000625030 1899 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
LAMA3Q16787 AL353626.3-201ENST00000413399 657 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
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